Workshop邀请函 | 一年一度的动植物基因组盛会
第二十六届国际动植物基因组大会（PAG）将于2018年1月13日至1月18日在美国圣地亚哥举行。华大基因作为全球领先的基因组学研究中心和“生命周期表计划”的领导者，将在本次会议中举行一场以Examples of Recent NGS-Enabled Plant and Animal Research: New Technology, Tools and Findings为主题的研讨会。届时，欢迎各位莅临现场，一起共享动植物基因组学盛宴。
时间：1月15日当地时间 6:20PM - 8:30PM
地点：Sunset Meeting House，Town &
Country Hotel，San Diego，CA
是不是都迫不及待的想知道老师们将会给大家带来哪些干货？科技君带大家先睹为快！
Topic1：A molecular tool to increase protein content and broad disease resistance in crops
Ling Li，Ph.D
Assistant Professor, Department of Biological sciences, Mississippi State University
Dr. Ling Li，现任密西西比州立大学生物科学院教授。她的实验室致力于植物新陈代谢和对环境变化适应性相关研究的统计学算法开发，通过对系统的实验数据集（如转录组学、代谢组学、蛋白质组学和基因组序列）的生物信息学分析，来揭示生物代谢以及信号通路等相关复杂分子间的互作和调控网络。这种研究策略可以用来发现新的基因功能（特别对于功能未知的基因），并且为提高生物系统性能和解决农业问题找到一些创新的研究策略。
Abstract
农作物在生长过程中需整合来自其生长环境的信号并做出有优先顺序的压力应答，这种现象发生在个体或整体，并贯穿整个生长周期。压力应答可能会对植物的生长以及质量性状（如蛋白质和淀粉）产生不利影响。优化食用性植物的蛋白质产率对世界健康和可持续性发展有着深远的影响。研究发现，拟南芥QQS孤儿基因调控蛋白和淀粉的碳分配，QQS基因的异常表达会导致大豆、玉米以及水稻中叶片和种子的蛋白质含量增加，与QQS网络相关基因过表达的突变体对植物病原体和害虫的抗性显著提高。基于此研究，可开发一个非转基因策略来改善作物蛋白产量，并且提高该作物的广谱抗病性。
Topic2：A soft selective sweep during rapid evolution of gentle behavior in an Africanized honeybee
Dr. Arián Avalos
Postdoctoral Associate, Institute for Genomic Biology，University of Illinois
Dr. Arián Avalos就职于美国伊利诺伊大学，是The Robinson Lab的研究员。主要专注于蜜蜂的生物多样性、生态行为学以及进化研究，发表了多篇学术论文。
Abstract
种群在适应新的栖息地的过程中会在生态系统的时间尺度上发生进化。1994年，非洲蜜蜂（AHB）被引进到波多黎各，经历12代繁衍后的温和型非洲蜜蜂（gAHB）的攻击性明显降低。通过对这些温和型非洲蜜蜂的全基因组测序分析表明，最初的AHB群体只发生了温和的选择清除效应，gAHB依旧保留了较高水平的遗传多样性，种群内仍保持着高度的基因多样性、广泛的杂交和极高的重组率。蜜蜂通过遗传瓶颈后仍保持种群多样性的能力，以及它们对复杂特性（如攻击）快速进化的能力解释了蜜蜂这个物种的进化成功性。
Topic3：High quality plant and animal genome assemblies using the BGISEQ-500 sequencing platform
Dr. Xin Liu
Executive Director, BGI Research
刘心博士，现任深圳华大基因研究院副院长。主要研究方向为农业基因组学、群体进化基因组学、生物信息学，在基因组相关研究领域中目前已发表SCI科研论文超过24篇，同时有多项相关专利，并参与过包括科技部973、863和深圳市科研计划在内的多项重要科研课题。
Abstract
Dr. Liu以抹香鲸基因组组装为例，展示基于华大基因自主测序平台BGISEQ-500的全基因组测序数据，通过对数据分析组装，最终得到一个高质量的抹香鲸基因组。华大基因以鸟枪法构建不同大小插入片段的全基因组文库以及10X Genomics文库，在BGISEQ-500平台分别以PE50、PE100和PE150进行测序，一共测得700Gb数据。通过对全基因组鸟枪法测序数据组装，scaffold N50达到5.9Mb, Contig N50达到 43.2Kb。 通过对10X Genomics测序数据组装，scaffold N50达到7.2Mb, Contig N50达到52.6Kb。然后将两种组装结果相结合，最终得到的组装长度scaffold N50高达37M, contig N50高达116.6Kb。最后，结合Hi-C数据，将组装得到的scaffold锚钉到染色体水平。通过对此抹香鲸基因组序列的比对分析，多个与适应性相关的基因特性被鉴定，如染色体融合，基因家族扩张/收缩以及基因的筛选等。除了抹香鲸基因组，Dr. Liu还将在workshop中分享基于BGISEQ-500平台测序数据进行组装的其他动植物基因组。
如此丰富的演讲内容，让我们拭目以待吧！
大会介绍
动植物基因组会议（The Plant and Animal Genome Conference，PAG），始于1992年，每年一次，迄今为止已成功举办25届，是全球范围内最具历史及规模的动植物基因组大会。会议主旨是探讨动植物基因组项目的近展和未来计划，本次大会吸引了多达3,000位动植物遗传学专家及研究者，和130多个展商前去参会。此外，大会还设有150多场学术研讨会和1,100多份学术海报。
欢迎各位莅临PAG会场第432号华大基因展台，共享动植物基因组盛宴！
撰稿：国际科服BU
编辑：市场部
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