免费微课 | 三代测序UMI定量转录组
当三代测序遇上转录组会碰撞出怎样的火花?
它的“迷人之处”又在哪?
“UMI”如何改变三代转录组?
目前,使用三代测序技术测定物种全长转录组的文献报道越来越多,以PacBio Sequel测序为代表的第三代测序技术也基本成熟。
三代测序可以直接获得全长转录本,从而能够从可变剪接、可变聚腺苷酸化、可变启动子、等位基因特异表达等方面解析转录组的多样性和复杂性,大大加深了转录组数据的利用深度,相比于NGS技术集中在基因水平的表达定量,全长转录组也将使定量由基因水平提升为转录本水平,对转录本多样性的精确解析及精确定量将更深层的揭示转录调控机制,从而变革转录组研究范式。
为了提高三代转录组定性、定量准确性,解决二代测序在isoform定量上的问题,华大基因基于 “独立分子标签(UMI)”原理开发了一套三代转录组技术,实现PacBio全长转录组的基因定量和转录本定量。这一技术增加了三代转录组定量的准确性,解决了二代测序不能对转录本亚型(isoform)定量的一大弊端,且有效提高了新转录本的发现灵敏度。
科技君特意为大家准备的三代测序系列微课,第二节《三代测序UMI定量转录组》已上线,并再次邀请到华大股份研发副总监唐冲博士为大家主讲本次微课,与大家共同探讨有关三代测序转录组的应用技巧。
课程主题
三代测序UMI定量转录组
课程大纲
为什么要做三代转录组
三代转录组现状及特点
“UMI”改变三代转录组研究模式
授课讲师
唐冲博士
华大股份研发副总监
唐冲博士2012年毕业于内华达大学生化与分子生物学专业,获得博士学位。毕业后担任于内华达单细胞分子表达中心联合主任,负责单细胞测序数据分析流程的开发及机构管理工作。
主要成就:开发了一套检测可变剪切的高效算法,并在国际上发表了15篇相关文章。曾为美国Texas大学,Washington大学等客户量身定制了专业的单细胞个性化研究策略,并擅长对时下单细胞研究中,最热门的微流控系统及高通量系统进行优化改善。
主要研究方向:精子发育、胚胎早期发育、二代测序方法学研究,并在国际高水平期刊上发表论文十余篇。
课程时间
2018年4月25日(周三),19:30~21:00
如何报名
1、关注“华大科技BGITech”公众号
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2、公众号后台对话框回复“微课”即可收到课程地址
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