用了都说好的数据库又升级了！新版KEGG有哪些新功能？

接触过生信分析的您对KEGG数据库一定再熟悉不过了。KEGG（Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes，京都基因和基因组百科全书），包含有大量的通路图，用于注释基因的功能和调控关系。如今，它又升级了，都有哪些新功能？科技君和大家一起看看！

图形功能强大到什么程度？

为什么KEGG数据库这么广受欢迎？生命活动中众多代谢通路相互作用，构成了一个复杂的网络，每个代谢通路中又包含众多的基因产物，基因产物之间存在多种相互作用关系。您可以想象一下，这样复杂的网络该怎么用“文字”清晰地描述出来？

KEGG完美地解决了这个问题，它与其他数据库最大的不同，就是用强大的图形功能，让研究者能够对代谢途径有一个直观又系统的了解，获知各个基因产物在通路上的作用，与其他基因产物上下游关系（如下图）。

KEGG数据库中人的 TCA 循环 pathway 图

89.1版本有哪些新功能？

早在2011年7月开始，KEGG数据库就开始收费了。出于成本考虑，大多数生物信息公司仍然沿用了免费的59.0版本。2015年起，华大与KEGG建立了紧密的合作关系。据KEGG数据库官网显示，目前全球只有7家公司获得授权（如图）。中国只有华大获得了授权。

KEGG授权的商业服务提供商名单

几年来，KEGG数据库不断更新，现在升级到89.1版本。一起回顾一下这几年具体做了哪些升级——

那现在的版本都包含多少内容呢？来看看KEGG数据库部分数据统计：   

借力Dr. Tom交互系统，结果更多样

在交互式报告系统Dr. Tom上，KEGG更淋漓尽致地发挥了它的作用。用Dr. Tom很方便地查看KEGG官网上的详细介绍，对感兴趣的代谢通路进行筛选和进一步挖掘，帮助老师找到解释生物学问题的核心基因和功能。

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想要对感兴趣的KEGG结果挖掘

KEGG图表交互，点击分类图柱子或富集图气泡后出现对应的基因。

KEGG小工具，可以循环使用KEGG富集和分类两个小工具分析你感兴趣的基因集，实现数据深度挖掘。

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想要看详细的KEGG通路图

KEGG注释结果：可以从KEGG分析条目直接看，也可以通过扩展列增加KEGG注释。表格中的KEGG注释结果，显示map，红绿颜色表示基因表达上下调，可以在图上点击使下方列表自动更新，或跳转到KEGG官网上。

基因详情页：又可点击表格中的基因ID，进入基因详情页，看KEGG注释结果，支持跳转到KEGG官网。

好的数据库是成功的一半，新学期，新升级，给您的科研加把劲。目前，华大科技的基因组、转录组、表观组、蛋白组和代谢组学等众多产品，都已升级KEGG 89.1版本，并将持续升级。此外，Dr. Tom和自主平台PE150测序，也将上线更多产品，全方位助力您领先一步，发表高质量文章。

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撰稿：赵   青

编辑：市场部

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