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培训 | 单细胞组学实用技术分析培训

华大基因学院 华大科技BGITech 2019-06-02

火热招生中


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单细胞测序是指通过对单个细胞不同组学层面,如基因组、转录组及表观基因组等进行高通量测序,获得单细胞分辨率的数据信息,进而进行细胞身份鉴定、新细胞类型发现、时序分析等的测序技术。单细胞测序可以解决用多细胞样本测序无法解决的细胞异质性难题,为解析细胞群体中单个细胞的行为、机制及其与机体的关系等提供了新方法。

为此,华大学院特开设《单细胞组学实用技术分析培训班》,将华大宝贵的前沿技术经验分享给各位同仁。本期讲师团队长期从事单细胞测序数据分析,在组学领域积累很丰富的项目经验。


培训时间:2019年5月16日-19日

培训地点:中国.深圳



一、培 训 目 标


帮助学员学习掌握:

1

多组学科学研究思路、项目设计方法

2

单细胞转录组测序的基础分析以及高级数据分析

3

多组学整合分析




二、培 训 优 势


一流的讲师

丰富的科研经验、重大项目执行经验

全面的课程

技术原理、分析流程&技术应用相互结合 

全新的方法

使用开源的软件&分析流程,更方便、快捷

面对面解决问题

与信息分析、数据挖掘达人面对面探讨项目中的瓶颈问题





三、课 程 安 排

点击可看大图

【注】 :深圳市华大基因学院保留对以上课程信息(包括主题、课程安排和其他细节等)进行调整的权利,具体课程信息以实际为准。





四、培 训 对 象

从事单细胞研究(如利用单细胞组学技术进行癌症,发育,疾病机制研究)的科研工作者和高校师生





五、专 家 团 队


注:排名不分先后,按姓氏首字母排序;

刘石平

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遗传学博士,2015年毕业于华南理工大学。自2009年加入华大研究院,从事单细胞基因组学、群体遗传学、比较基因组学等生物信息研究工作8年多。

参与众多国际重大的基因组学重大科研项目,如大熊猫基因组、北极熊群体基因组、G10K、癌症单细胞计划、Human Cell Atlas等。曾获中国青少年科技创新奖,深圳市高层次人才,深圳市盐田区生物产业高层次人才(优秀人才)。

目前主要研究单细胞多组学、脑科学等前沿领域。近五年已发表SCI论文14篇,其中Cell, Nature, Science (CNS)7篇,以第一作者或并列第一作者发表论文5篇。


以下展示部分发表文章:

1. Zhao Z, Goldin L, Liu S, Wu L, Zhou W, Lou H, et al. Evolution of multiple cell clones over a 29-year period of a CLL patient. Nat Commun. 2016;7: 13765. doi:10.1038/ncomms13765.

2. Liu, S., Lorenzen, E. D., Fumagalli, M., Li, B., Harris, K., Xiong, Z., … Wang, J. (2014). Population genomics reveal recent speciation and rapid evolutionary adaptation in polar bears. Cell, 157, 785–794. doi:10.1016/j.cell.2014.03.054. 

3. Jex, A. R., Liu, S., Li, B., Young, N. D., Hall, R. S., Li, Y., … Gasser, R. B. (2011). Ascaris suum draft genome. Nature. doi:10.1038/nature10553.

4. Young, N. D., Jex, A. R., Li, B., Liu, S., Yang, L., Xiong, Z., … Gasser, R. B. (2012). Whole-genome sequence of Schistosoma haematobium. Nature Genetics. doi:10.1038/ng.1065.



刘龙奇

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细胞生物学博士,2015年毕业于中国科学院。现任华大生命科学研究院单细胞组学实验室负责人。同时担任西北大学兼职教授,郑州大学兼职副教授,华大基因学院高级讲师。曾获中科院院长奖学金,深圳市高层次人才,深圳市盐田区“梧桐人才”。

目前主要负责高通量单细胞多组学测序新技术和产品研发工作,在细胞命运转变,表观遗传学,基因表达调控,单细胞多组学整合分析等方面具有丰富的经验。

近5年来以第一或通讯作者在Cell Stem Cell, Nature Materials, Nature Communications等杂志上发表论文或评论多篇。


以下展示部分发表文章:

1. Liu L, Xu Y, He M, Zhang M, …, Esteban MA. (2014). Transcriptional pause release is a rate-limiting step for somatic cell reprogramming. Cell Stem Cell 15, 574-588.

2. Xu Y, Liu L#, Laslett AL, Esteban MA#. (2013). Cell reprogramming: Into the groove. Nature Materials 12, 1082-1084. 

3. Liu L, Liu C, … Xun Xu. (2018) Deconvolution of Single-cell multi-omics layers reveals regulatory heterogeneity. Nature Communications.10 (1): 470.

4. Liu L, Leng L,… Ge L. (2018). An integrated chromatin accessibility and transcriptome landscape of human pre-implantation embryos. Nature Communications. 10 (1): 364.



戚 达

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计算机科学博士, 华大基因蛋白质方向资深课程顾问,蛋白质组学研究专家。2008年获得威尔士大学计算机科学博士学位。

2011年在英国利物浦大学开始从事蛋白质组学信息分析研究,主要参与欧盟第七框架计划资助的ProteomeXchange项目,作为HUPO-PSI工作组的成员,制定蛋白质组学标准数据格式,包括定量蛋白质组标准mzQuantML,代谢组标准mzTab等格式的制定,开发与Pride数据库相关的软件。2016年负责英国生物技术和生物科学研究理事会(BBSRC)牛顿基金资助的英国-中国-泰国-菲律宾-越南可持续水稻计划项目,开发生物信息分析流程,利用蛋白基因组学方法,提高水稻基因注释的可靠性以及发现新的未知基因。

2017年加入华大基因,担任蛋白质生物信息平台负责人。主攻基于质谱的蛋白质组学,代谢组学数据标准化建设,大数据深度挖掘,智能生物信息分析系统开发。截至当前,在国际著名学术期刊发表文章10余篇,开发商业化软件ProteoLabels的原型。具有丰富的生物信息分析经验和项目经验,教学举一反三。


以下展示部分发表文章:

1. Z. Ren, D. Qi, N. Pugh, K. Li, B. Wen, R. Zhou, S. Xu, S. Liu, A. R. Jones, Improvements to the rice genome annotation through large-scale analysis of RNA-Seq and proteomics datasets, Molecular and Cellular Proteomics, November 2018, mcp.RA118.000832; https://doi.org/10.1074/mcp.RA118.000832.

2. D. Qi, C. Lawless, J. Teleman, F. Levander, S. W. Holman, S. Hubbard, A. R. Jones, The representation of selected-reaction monitoring data in the mzQuantML data standard, Proteomics, 2015, 15(15): 2592-96. doi:10.1002/pmic.201400281.

3. D. Qi, R. Krishna, A. R. Jones. The jmzQuantML programming interface and validator for the mzQuantML data standard, Proteomics, 2014, 14(6): 685-8. doi:10.1002/pmic.201300281. 



夏军

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华大智造项目经理,主要负责胚胎植入前检测以及单细胞测序方向产品的研发。

先后负责孕妇外周血胎儿有核红细胞分离应用,胚胎植入前遗传传学筛查试剂盒开发、胚胎植入前胚胎单基因病和染色体异常一体化检测技术开发与stLFR建库试剂盒开发等项目。

已发表SCI文章3篇,申请专利4项。在胚胎植入前检测和单细胞建库测序方向有丰富的经验。






六、收 费 标 准


注册费:5000元/人


注:

1、费用含包括学费、资料费、实操练习费、其他材料费及餐费;

2、培训期间可协助安排住宿,住宿费用自理;


优惠政策

1. 华大业务合作伙伴/培训班老学员,可享9.5折优惠,即:4750元/人;

2. 转发分享此文至朋友圈并带上【报名参加】的评论,可享9折优惠,即:4500元/人;

3. 5人及以上团体报名参加本期培训,可享8折优惠,即:4000元/人;


注:以上三项优惠不能同时使用,最终优惠解释权归华大学院所有!





七、报 名 方 式


线上报名


长按识别二维码,填写报名信息,提交并支付,即可报名成功。




八、注 意 事 项


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1. 报到通知

报名成功者,将会在5月9号18:00之前收到会务组的邮件报到通知。

为方便大家报名,可提前下载本期培训的《会议通知》或《培训通知》用于申请经费,点击链接,即可下载。

会议&培训通知

提取码: nk3f 


2. 支付方式

可通过微信/支付宝/银行汇款三种方式支付培训费。

若您选择银行汇款请在5月9日18:00前转账汇款,逾期不保留名额。

*** 汇款信息 *** (国内)
人民币:XX 元(请根据个人报名情况进行相应金额的汇款)
开 户 行:中国工商银行深圳保税区支行
开户名称:深圳市华大基因学院
账 号:4000 0255 0920 0144 415

汇款时请务必标明“病原班+姓名”

成功汇款后将您的汇款凭证扫描或拍照后发到邮箱training@service.genomics.cn

3. 发票

2019年5月9日18:00前付款可在培训期间获取发票。

请务必准确填写报名表单的发票信息,因个人填写信息错误导致发票有误,不予重开!发票信息建议提前与贵单位财务部门确认。

4. 结业证书

完成培训的学员,将获得由深圳市华大基因学院颁发结业证书。

5. 退费

如您已经成功付款但临时有事不能参加本次培训,可联系主办方撤销席位全额退费;如在开课前3个工作日内(含3个工作日)要求撤销席位则退还80%的费用。








联 系 我 们


时间:周一至周五

           9:00-12:00,14:00-18:00


电话:0755-36352044  韩老师 桂老师


邮箱:training@service.genomics.cn






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