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新品来了 | 高深度磷酸化蛋白定量就这样轻松搞定!

黄梦楠 华大科技BGITech 2023-10-12
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生物体中发生磷酸化修饰的蛋白质约占所有蛋白质的1/3,磷酸化修饰是蛋白质修饰组学研究中关注度最高的类型之一。磷酸化蛋白质组学是目前磷酸化研究的主要方面,磷酸化位点的鉴定和表征对理解磷酸化蛋白质组内的各种信号事件至关重要。


然而磷酸化蛋白的丰度整体偏低且浮动范围大;其次,DDA采集模式的动态排除机制不利于多磷酸化肽段 isomer 的检出,因为多磷酸化肽段 isomer 往往具有近似的质荷比、保留时间和共享部分碎片离子。


基于DIA全景扫描的无偏模式,DIA磷酸化蛋白质组得以突破传统DDA的限制,能够有效解决磷酸化修饰定性定量的难题,推进磷酸化定量分析向更高鉴定深度、更高定量重复性和定量准确性的方向发展;同时,DIA技术提供了更丰度的子离子信息,可以提供相对全面的磷酸化 isomer信息,有利于磷酸化位点定位研究。


4D-DIA磷酸化在原有的保留时间、质荷比和离子强度的基础上,增加了离子淌度,在检测过程中能够进一步降低待测样本的复杂程度,更有利于对样本进行高深度检测。4D-DIA磷酸化为实现磷酸化定量蛋白组分析的高覆盖、高准确性和大样本的深度分析带来了更优秀的解决方案。


timsTOF Pro


为更好地服务广大科研工作者,华大基因质谱平台特于近日购置了timsTOF Pro,以开展4D-DIA磷酸化蛋白定量研究。目前已经完成了部分测试工作,基于timsTOF Pro平台,磷酸化修饰肽段1h鉴定数近15000,磷酸化肽段的定量相关系数达到0.95。


磷酸化肽段鉴定数韦恩图


重复相关性分析

重复相关性分析


更多测试工作正如火如荼地进行中,4D-DIA磷酸化蛋白定量即将推出,敬请关注!




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