绘制斑马鱼胚胎的时空图谱和发育轨迹，单细胞DNBelab C系列如虎之傅翼！

近日，深圳华大生命科学研究院、华中农业大学等联合团队，利用华大自主研发的两大技术平台——时空组学技术（Stereo-seq）和单细胞自主高通量分选平台（DNBelab C系列），对斑马鱼受精后24h以内6个关键时间点的斑马鱼胚胎进行研究，首次绘制了斑马鱼早期胚胎发育的时空转录组图谱，构建了斑马鱼胚胎发生过程中细胞命运转变和细胞分子变化的时空发育轨迹，为后续探究脊椎动物的发育提供了新的参考方向。该项成果发表于Cell子刊Developmental Cell上，文章标题为“Spatiotemporal mapping of gene expression landscapes and developmental trajectories during zebrafish embryogenesis”。

研究主要成果：

//获取受精后24h内6个关键发育时间点（3.3、5.25、10、12、18、24hpf）的斑马鱼胚胎样本，进行单细胞和时空两大维度研究，总共获得了86,307 个细胞和139,391个位点，鉴定到71种细胞类型，并在此基础上绘制了斑马鱼早期胚胎发生时空转录组图谱在线开放资源库ZESTA (http://stereomap.cngb.org/zebrafish/data_index)；

//对每个时间点的Stereo-seq数据和scRNA-seq数据进行整合分析，构建斑马鱼胚胎发生过程中细胞命运转变和细胞分子变化的时空发育轨迹，探索性研究了细胞空间微环境与分化方向之间的关联；

//分析了斑马鱼胚胎发生过程中不同配体-受体对的动态空间分布，发现了新的配体-受体对互作模式，提示潜在胚胎发育调控机制。

倒计时1天

为了解更多研究详情，本周二（6月28日）19:30，我们邀请本篇文章第一作者，深圳华大生命科学研究院副研究员——刘畅博士做客直播间，深度讲解：如何构建斑马鱼胚胎的时空图谱和发育轨迹？

点击文末“阅读原文”或扫描海报二维码

直达直播间

2022华大科技单细胞系列课程回顾

（持续更新中）

▶ 错过课程直播别担心，扫描对应课程海报二维码即可观看回放~

了解更多产品服务及资讯，关注我们！

↓↓↓ 点击“阅读原文”进入直播间