一文了解华大全线RNA测序产品和服务全流程
RNA测序技术已经在全球范围内成为研究基因表达调控的重要工具。RNA分为编码RNA(也称为mRNA)与非编码RNA,非编码RNA又包括长链非编码RNA(Long noncoding RNA,LncRNA)、小RNA(Small RNA)和环状RNA(Circular RNA,CircRNA)等。不同种类的RNA在生命活动中都扮演着不可或缺的角色。mRNA在核糖体上作为蛋白质合成的模板,决定肽链的氨基酸排列顺序,非编码RNA是由基因组转录而成的不编码蛋白质的RNA分子,除了在转录和转录后水平上发挥作用外,还在基因表达的表观遗传学调控中发挥重要作用。
华大基于自主DNBSEQ™平台的RNA测序服务具有丰富的经验和高质量的产出,相关测序产品已广泛应用在各个领域,包括生长发育的生理机制研究、微生物感染致病机理研究、复杂疾病研究、癌症研究及标记物、药物作用机制及靶点、免疫应答、干细胞研究和分子标记物等。
本期,科技君为大家介绍下华大目前提供的RNA测序全线产品以及RNA产品的全流程服务。
华大提供多种类RNA测序产品
1. 常规转录组产品
真核转录组 Resequencing
真核转录组 De novo
RNA-Seq(只定量)
2. 非编码RNA测序产品
UMI Small RNA
LncRNA
环状RNA
3. 全转录组产品
转录组+LncRNA+Small RNA+CircRNA
ceRNA
4. 全长转录组
多倍通量全长转录组
PolyA+全长转录组
华大提供全流程服务方案
1. 经验丰富的RNA提取
全面多样的样本类型,可承接常规组织、细胞样本和特殊样本(多糖多酚植物、微量样本和FFPE等);
长片段(>20kb)提取技术,满足您的长读长测序需求。
2. 专业极致的RNA文库构建
常规人、鼠样本建库仅需total RNA 200 ng起,文库构建全自动化,周期质量有保障;
常规转录组产品可选择升级链特异性文库构建,提质不加价;
支持个性化定制特殊文库构建,如pg级微量RNA、全血样本、FFPE等。
3. 高质量的自主测序平台
滚环扩增构建DNB测序文库,PCR扩增错误不会累积,无index hopping之忧,低dup rate无需人为干预;
DNBSEQ™平台RNA测序文章已超1,235篇,多次登上CNS顶级期刊,包含7篇Nature、3篇Cell、1篇Science。
4. 个性化的Dr. Tom分析平台
交互式多组学数据挖掘系统,无需具备生信分析基础,只需一键点击操作,玩转 RNA多种类型数据个性化分析,轻松解决生物学问题,助力文章发表;
除了支持华大测序数据的分析,也支持上传表达量、表型等数据进行数据分析挖掘;
系统基于华大自主搭建的物种多组学数据库,通过选择感兴趣基因/转录本/细胞/蛋白/DMR,结合系统搭载的分析绘图工具,完成多组学数据的相互关联。目前Dr. Tom系统可支持70+种物种的数据分析。
5. 全程质控,质量保证
RNA测序必须达到全流程的严格,规范的质控,才能保证数据的准确性,得以作为科研甚至临床参考数据。华大实验室质控全面,高度可控。全流程中,多人多次核对样本信息,各环节(样本、文库以及测序数据)层层质量控制,只为全面提升整体产品质量和服务体验。
2022 · 年终钜惠
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