年终盘点 | 华大科技蛋白质组全年回顾

蛋白质组

岁末将至，感谢亲爱的你又陪伴华大科技走过充满收获的一年。

过去的一年，蛋白质组学在研究和临床上都取得了蓬勃发展，华大科技蛋白质组学也始终以提供更优质的科技服务为目标，不断提升产品水平和质量，在今年完成了蛋白定量类全线产品优化升级，蛋白修饰类产品整体质量提升，并推出空间蛋白质组等多项新产品助力前沿科学研究。科技君对华大科技蛋白质组2022年的工作进行了年终盘点，邀您一同回顾我们不断前进的科研印记！

一、

蛋白定量类全线产品优化升级

BGI Tech

蛋白质组定量可以对一个基因组表达的全部蛋白质或一个复杂混合体系内所有蛋白质进行精确鉴定和定量，用于筛选和寻找任何因素引起的样本之间的差异表达蛋白质，结合生物信息学分析揭示生命体生理病理功能，同时也可对某些关键蛋白质进行定性和定量分析，是目前蛋白质组学研究最重要的方向之一。华大科技蛋白定量在今年全面优化升级，推出多项新产品和新服务、数据分析能力全面提升，从高通量数据到高效率分析全覆盖，进一步助力数据深度挖掘。

1. 标记蛋白定量，检测通量再升级

IBTpro-16plex和TMTpro-18plex全新升级，可分别同时对多达16例和18例样品进行蛋白定量，进一步助力定量多元化。此类产品也适用于磷酸化蛋白定量。

2. 非标记DDA和DIA等蛋白定量产品信息分析全面升级

新增多条质控内容、结果目录一目了然、报告展示结构优化，提供更加人性化的分析报告及结果。

3. 新增及升级多项高级分析和多组学关联分析服务

机器学习：不基于任何假设直接从数据中发现分子间内在规律，有助于更好地理解疾病发生、发展的复杂机制，是精准医疗领域的一个重要工具。

GSEA、WGCNA：从海量数据中挖掘与生物学意义相关的蛋白，识别已知蛋白的新功能、寻找新调控蛋白，深入了解调控机制。

蛋白-代谢多组学关联分析：从“因”和“果”探究生物学问题，相互间进行验证，进而深入开展后续研究与应用，全面了解生物系统调控机制。

二、

蛋白修饰类产品整体质量提升

BGI Tech

许多蛋白质是在发生翻译后修饰起作用的。以人体为例，50%以上蛋白质发生蛋白翻译后修饰（PTM），其在细胞生物过程中起看重要的调节调控作用，蛋白修饰类研究对阐释细胞生理过程、疾病的发生发展机制都具有重要意义。在今年，华大科技蛋白修饰类产品整体质量提升，实现富集效率、检测通量、鉴定深度、准确度等全面优化升级。

1. 4D-DIA磷酸化蛋白质组通量、鉴定数等多维提升

全新流程提升富集效率，自动化移液工作站提升检测通量，缩短周期，同时降低批次效应，鉴定深度、定量准确性均有大幅提升，肿瘤组织1h鉴定磷酸化肽段达15,000+，水稻苗11,000+，同时和定量蛋白质组学强强联合，多组学关联分析探索蛋白质表达“全景图”。

2. 乙酰化蛋白质组、泛素化蛋白质组富集效率、鉴定数全面提升

采用进口金标抗体，高效富集修饰肽段，4D label-free方法进行蛋白定量，提高了离子利用率和鉴定准确度，以更少上样量、更快扫描速度，全面提升蛋白质组学的覆盖深度、灵敏度、通量。

3. 糖基化修饰蛋白质组推出N-连接完整糖肽产品，实现新突破

具有更高鉴定深度的同时，可以获得糖链、糖基化修饰肽段及糖链和糖基化位点的对应关系，并对糖链结构进行精确解析，一步到位，为蛋白糖基化研究提供更全面的解决方案。

三、

新增多项前沿蛋白质组学服务

BGI Tech

空间组学被Nature评为2022年 7大“颠覆性”技术之一，蛋白质是生命活动的执行者，在组织空间层面进行蛋白质组研究，对于解析组织微环境、诊断及预后、以及精准医疗具有重要的价值。华大科技蛋白质组紧跟国际前沿研究趋势，于今年推出了空间蛋白质组学助力空间维度的探索。同时，我们还推出了Olink蛋白质组学和单克隆抗体蛋白从头测序服务，进一步丰富蛋白质组解决方案，为广大用户提供更加多样化的选择！

1. 空间蛋白质组学

常规蛋白质组学从整个组织或数百万细胞入手，得到的是一群细胞中信号的平均值，缺少细胞的空间信息，通过测量空间维度蛋白质组数据，将能更准确地反映特定的细胞功能和状态。华大科技质谱平台在空间蛋白领域深耕多年，连续发表了胃印戒癌和结直肠癌空间蛋白质组相关文章，今年重磅推出空间蛋白组学产品，提供从组织切片、到LCM切割、质谱上机、信息分析的全流程服务，专业博士团队全程指导，采用timsTOF Pro高性能质谱仪进行检测，在鉴定深度、定量稳定性和准确性方面均表现优异。

2. Olink蛋白质组学

Olink蛋白质组学提供所有靶向panel蛋白质组学检测，可以广泛应用在心血管、肿瘤、神经系统、免疫等疾病研究领域，提供超灵敏、无偏、靶向蛋白组学解决方案，尤其适用于大队列疾病研究！

3. 单克隆抗体蛋白从头测序

基于质谱的蛋白质从头测序技术，无需数据库、无需参考序列，仅提供少量的纯化蛋白，即可获得完整的蛋白质序列信息。为了满足广大科研工作者对蛋白质测序的强烈需求，华大科技蛋白质组在今年推出蛋白从头测序服务，并针对抗体研发相关领域，特别推出单克隆抗体蛋白从头测序（简称“单抗测序”）服务。

四、

代表性文章

BGI Tech

在过去的一年中，我们参与的蛋白组科研工作百花齐放、硕果累累，多篇文章发表于SCI核心期刊，现选取两篇代表性文章与各位老师分享👇

经典案例1：

蛋白质组学分析间充质干细胞（MSC）衍生的凋亡小泡（apoVs），确定Fas遗传可通过激活血小板功能改善血友病

文章题目：Proteomic analysis of MSC-derived apoptotic vesicles identifies Fasinheritance to ameliorate haemophilia a via activating platelet functions

发表期刊：Journal of Extracellular Vesicles.（IF=17.34）

研究单位：北京大学口腔医学院附属医院

华大科技提供服务：DIA+MRM定量蛋白质组

研究概述：

凋亡囊泡（apoVs）是凋亡细胞衍生的纳米囊泡，在多种病理生理环境中起着至关重要的作用。通过对来自三种不同类型的间充质干细胞（MSC）的apoVs和外泌体进行蛋白质组学分析，包括人骨髓间充质干细胞（hBMSCs）、人脂肪间充质干细胞（hASCs）和小鼠骨髓间充质干细胞（mBMSCs），确定了apoVs与外泌体在功能蛋白负载和表面标记方面的差异并鉴定了13种特异性富集在apoVs中的特定生物标记物，并通过以前未知的Fas/FasL连锁机制证明apoVs在治疗血友病小鼠中的有效性。

经典案例2：

文章题目：Gasdermin D-dependent platelet pyroptosis exacerbates NET formation and inflammation in severe sepsis

发表期刊：Nature Cardiovascular Research（IF=13.08）

研究单位：广州医科大学附属广州市妇女儿童医疗中心

华大科技提供服务：DIA定量蛋白质组

研究概述：

该研究首次报道在脓毒症中存在血小板焦亡，使用DIA定量蛋白组技术筛选出差异表达蛋白GSDMD，通过一系列实验揭示了脓毒症条件下存在血小板和NET间的正反馈调节，从而加剧免疫反应，为脓毒症致病机制解析及治疗靶点筛选提供理论基础和依据。

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回顾2022，华大科技蛋白质组始终以给广大科研工作者带来更优质服务为己任，聚焦前沿，新品不断、服务升级、全方位提升产品竞争力。心中热爱永恒，追逐脚步不止，新的一年，华大科技将继续与您携手并进，带来更多产品和更好服务，敬请期待！

供稿：Carol

编辑：市场部

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