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重磅发布!N-连接完整糖肽蛋白质组甜蜜巨献

共赴多组学的 华大科技BGITech
2024-11-11
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糖基化作为一类重要的蛋白质翻译后修饰,细胞内超过50%的蛋白都被糖基化修饰,糖基化会广泛参与到细胞间信号识别、转导、调控、蛋白质折叠、定位、空间构象稳定以及免疫调控等生物学功能中。其中,N-连接糖基化是糖基化修饰中非常普遍和重要的一种修饰,广泛表达于细胞表面以及体液中,并且会参与到肿瘤等疾病的发生与发展,糖蛋白质组研究方向从全谱检测(Profiling)、疾病的生物标志物筛选及分子分型再到利用多组学联合分析揭示生理活动与疾病的病理机理与机制,覆盖了各个热点研究领域。


图1 以“完整糖肽”为关键词的发文量及被引高速增长(来源:Web of Science)


传统的N-连接糖蛋白质组定量分析去除了糖链,只对去糖基化多肽进行分析,缺失了复杂的糖链中蕴藏的遗传信息,糖蛋白质组学的发展也逐渐从研究去糖基化多肽,到糖基化位点及糖链组成,再到研究糖链结构,完整糖肽研究发文量逐年上升,已然成为研究热点,越来越多的研究揭示了糖链结构与生理、病理间的关系。

图2 N-糖链结构模块化拆解图


为满足广大科研工作者的需求,华大科技重磅推出N-连接完整糖肽的糖蛋白质组学研究方案,与N-连接完整糖肽解析软件StrucGP[1](西北大学孙士生教授课题组2021年发表于Nature Methods)强强联合,真正实现糖结构解析,可同时获得糖链结构、糖基化修饰肽段及糖链和糖基化位点的对应关系,并可通过标记定量技术实现对N-连接完整糖肽的精确定量



技术流程


产品优势

1. 完整糖肽解析软件StrucGP:真正意义上实现对糖链结构精确解析。


目前,一些软件如MSFragger-Glyco、pGlyco 3.0等基本可以实现同时解析糖基化位点和糖链组成信息,但由于糖链结构的复杂性和糖基化微不均一性特性,糖链结构解析依然存在极大挑战。StrucGP采用了模块化的解析策略,不依赖于糖链数据库,对糖链结构从头解析,有助于新的糖链结构鉴定,是糖蛋白质组学领域中率先实现对糖链结构解析的软件[1]


2. 采取完整解析策略,可同时获得糖链结构、糖肽及糖链和糖基化位点的对应关系。


3. 具备高深度鉴定能力,常规全谱鉴定5,000+,超深度检测可达14,000+,定量鉴定2,700+。


4. 高通量标记定量技术可以同时对多达18个糖蛋白样品进行精确定量,减少批次效应,极大提高蛋白定量的可信度和覆盖度。


糖链结构分析结果展示




欢迎垂询

华大科技基于N-连接完整糖肽的糖蛋白质组学研究方案,重磅推出N-连接完整糖肽鉴定、N-连接完整糖肽定量产品,以满足广大科研工作者的不同需求。

欲知更多详情,

请联系华大科技当地销售代表↓↓↓

热线电话:400-706-6615

邮箱:info@genomics.cn



参考文献:

[1] Shen, J., Jia, L., Dang, L. et al. StrucGP: de novo structural sequencing of site-specific N-glycan on glycoproteins using a modularization strategy. Nat Methods 18, 921–929 (2021). https://doi.org/10.1038/s41592-021-01209-0



供稿:Carol、徐寅泰

编辑:市场部


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