上新 | CUT&Tag,解锁更精准更高效的蛋白质与DNA互作研究
蛋白质与DNA之间的相互作用包含着很多生物学信息,在蛋白质与DNA互作研究当中,一些传统的技术在样本处理、特异性、分辨率等方面存在一定的限制,为了解决这些限制和挑战,CUT&Tag (Cleavage Under Targets and Tagmentation) 技术应运而生。
CUT&Tag技术于2019年5月由Steven Henikoff博士的实验室研发并首次在Nature Communications报道[1]。为满足广大科研工作者的需求,华大科技重磅推出CUT&Tag产品,降低测序的背景噪音,从少量细胞中研究在全基因组范围内的靶标染色质,更好地助力生命科学领域研究。
技术原理
CUT&Tag技术主要用于蛋白质与DNA互作方面的研究,其实验流程简单无需甲醛交联的繁琐过程,仅利用pA/G-Tn5 Transposase复合物在目的组蛋白修饰标志物、转录因子或染色质调控蛋白结合染色质的局部对靶标结合DNA进行片段化,无需传统的补平加A等步骤,切割的同时在两端加上接头序列,再进行PCR扩增得到测序文库,最短可在一天内完成从细胞到测序文库制备全流程。
图1 CUT&Tag实验流程图[2]
CUT&Tag与ChIP-Seq常被拿来比较,两者在各方面都有较多差异:
CUT&Tag产品优势
周期更短,信噪比高
与ChIP-Seq相比,建库周期减少一半,无需Input样品作为背景,测序数据量也大幅降低。
重复性高,数据真实可靠
无需甲醛交联,避免假阳性、假阴性的错误引入,细胞达到10,000时,Peak的数量可重复性表现较好。
细胞投入量小,测序质量高
尤其适用于早期胚胎发育,肿瘤以及罕见或珍惜样品等领域的研究。
参考文献:
[1] Kaya-Okur, H. S., Wu, S. J., Codomo, C. A., Pledger, E. S., Bryson, T. D., Henikoff, J. G., ... & Henikoff, S. (2019). CUT&Tag for efficient epigenomic profiling of small samples and single cells. Nature communications, 10(1), 1930.
[2] Wang, Q., Xioong, H., Ai, S., Yu, X., Liu, Y., Zhang, J., & He, A. (2019). CoBATCH for high-throughput single-cell epigenomic profiling. bioRxiv, 590661.
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撰稿:婕婕子
编辑:市场部
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