科研助力计划 | 单细胞图谱规模化研究支持方案，正式发布！
单细胞研究技术从单个细胞研究开始，因技术受限，直到2009年结合高通量测序，才完成单个细胞内基因的测序研究。
随着技术发展，2015至2018年，单细胞测序技术发展迅猛，进入高通量时代，单次实现万位级别单细胞分选和细胞内基因测序，极大程度上让我们从“高清”发现和研究生命现象本质。
通过华大自主单细胞DNBelab C系列平台，华大已经加速发表了多篇高分文章，以下为三篇单细胞图谱自主平台经典案例，供大家参考。
01
DNBelab C系列助力成华猪不同解剖部位皮肤组织细胞异质性研究
2023年6月，华大自主单细胞DNBelab C系列平台助力四川农业大学生命科学学院动物学系、成都市畜禽遗传资源保护中心、华大基因共同于eLife（IF=7.7）杂志发表题为"A single-cell transcriptome atlas of pig skin characterizes anatomical positional heterogeneity"的文章[1]。
该研究选取了成华（CH）猪的以皮肤厚度存在显著差异的六个解剖部位皮肤组织以及大白（LW）猪的背部皮肤组织作为研究对象，分析了不同皮肤区域的细胞类型和功能特征，构建了猪皮肤单细胞转录组图谱，鉴定出以平滑肌细胞、内皮细胞和成纤维细胞数量为主的7种细胞类型、21种细胞亚型（如所属成纤维细胞的乳头、网状和间充质3种细胞亚型），揭示了与解剖部位和品种关联的特异基因表达模式及其参与皮肤免疫反应和细胞外基质（胶原蛋白为主）合成的生物功能，为进一步研究皮肤发育和生理功能提供重要线索。
02
DNBelab C系列助力家猪多器官单细胞转录组图谱绘制
2022年6月，华大自主单细胞DNBelab C系列平台助力深圳华大生命科学研究院罗永伦教授，联合丹麦奥胡斯大学林琳教授等多家国内外科研团队，于Nature Communications（IF=17.694）发表名为"Endothelial cell heterogeneity and microglia regulons revealed by a pig cell landscape at single-cell level"[2]的文章，首次构建家猪多个组织和器官的单细胞转录组图谱。
该研究绘制20 种猪组织/器官，获得133,492个细胞和 89,034 个细胞核转录组数据，鉴定确定了234个细胞簇，对应于58个主要的细胞类型，相对全面描绘家猪器官中细胞组成的异质性和相互作用，为深入了解人和猪之间的生物医学相似性和差异，并推动猪在生物医学研究中的应用，提供有效的数据支持。
03
DNBelab C4助力完成全球首个非人灵长类动物全细胞“地图”
2022年4月，由深圳华大生命科学研究院主导，多国科研团队合作在Nature（IF=69.504）上发表了文章"Cell transcriptomic atlas of the non-human primate Macaca fascicularis"[3]，共同绘制了首个非人灵长类动物（猕猴）全身器官细胞图谱。
基于华大自主单细胞DNBelab C系列平台和DNBSEQ测序平台，研究人员对猕猴的45种组织约114万个细胞进行单细胞测序分析，获得了世界上首个非人灵长类动物全身器官细胞图谱。该图谱将被用于物种进化、人类疾病以及药物评价和筛选相关的研究，为生物医学的发展提供基础性的资源和工具，为疾病诊疗、靶向药物开发提供助力，为人类更好地探究生命的进化提供可能。
以上3篇顶刊成果借助华大自主单细胞DNBelab C系列平台及方案，助力科研工作者们追求生命体全部细胞的信息地图，全面解码细胞的数字化特征，解析组织中单个细胞相关核酸及蛋白信息，获得细胞间差异、细胞群体差异，从而绘制出生命体各器官组织细胞图谱，如同细胞地图一样，按图索骥，让我们能够放大到静态和动态方式研究和监测生命活动。
华大科技在单细胞领域深耕多年，积累深厚的单细胞服务经验和方案设计能力，DNBelab C系列高通量单细胞转录组全新服务，一站式解决方案，实现多领域、高性价比服务支持。截止2024年1月，累计发表65篇SCI文章，包含2篇Nature，2篇Cell，平均影响因子15+，其中IF>10文章数有28篇。
华大科技提供单细胞服务一站式高性价比方案，从单细胞图谱方案设计，到样本取材选样及邮寄方式建议等，并可以提供组织解离以及流式细胞分选服务，采用华大自主DNBelab C系列平台单细胞分选，结合DNBSEQ高保真测序，拓展多种分析思路，为细胞图谱研究及发文之路提供最优解决方案。
物种单细胞图谱样本设计推荐：
提示：每个组织类型建议≥3个重复样本备份，样本取材方式包括新鲜和速冻，具体采样方案需根据物种生理年龄、组织类型等差异进行定制化推荐。
时空组学UP！
为了更好地赋能科研，华大科技现推出“时空和单细胞科研助力计划”，加速科研进程，助力成果转化。欢迎扫码参与！
参考文献：
[1] Qin Zou, Rong Yuan, et al. “A single-cell transcriptome atlas of pig skin characterizes anatomical positional heterogeneity.” Elife. 2023 Jun 5:12:e86504.
[2] Wang, Fei, et al. "Endothelial cell heterogeneity and microglia regulons revealed by a pig cell landscape at single-cell level." Nature communications 13.1 (2022): 1-18.
[3] Han, Lei, et al. "Cell transcriptomic atlas of the non-human primate Macaca fascicularis." Nature 604.7907 (2022): 723-731.
供稿：姜莹
编辑：市场部
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