诺贝尔奖“新秀”背后:RNA研究的浪潮何以席卷多年?
瑞典卡罗琳医学院于10月7日宣布,将2024年诺贝尔生理学或医学奖授予科学家Victor Ambros(维克托·安布罗斯)和 Gary Ruvkun(加里·鲁夫昆),以表彰他们 “发现微小RNA(microRNA)及其在后转录基因调控中发挥的作用”。他们的发现为我们理解基因调控机制提供了全新的视角,获奖可谓是实至名归。
Victor Ambros(维克托 · 安布罗斯)和 Gary Ruvkun(加里 · 鲁夫昆)共同获得2024年诺贝尔生理学或医学奖。
图片来源:诺贝尔奖官网
热知识:
这已经是RNA分子研究领域的第四个诺贝尔奖。
2006年诺贝尔生理学或医学奖——RNA干扰(RNAi)机制;
2020年诺贝尔化学奖——CRISPR-Cas9基因编辑技术;
2023年诺贝尔生理学或医学奖——核苷碱基修饰方面研究使得COVID-19 mRNA疫苗得以开发;
2024年诺贝尔生理学或医学奖——发现microRNA及其在后转录基因调控中发挥的作用。
RNA研究的浪潮正以不可阻挡之势席卷整个生命科学领域。
microRNA——新型基因调控分子
microRNA(miRNA)是一类由内源基因编码的19-25个核苷酸长的非编码单链RNA分子,在动植物中参与调控基因的转录后表达,第一个miRNA自1993年在突变秀丽隐杆线虫中被发现[1-2],然而,miRNA的一般调控功能直到2001年才被充分认识。目前,已经在不同物种中鉴定出数千种miRNA,其生物合成途径如下[3]:
1) 转录:miRNA基因在细胞核内首先被RNA聚合酶II(Pol II)转录成初级miRNA(pri-miRNA),这是一段较长的RNA分子。
2) 切割:pri-miRNA随后被“微处理器”复合体(包含DROSHA和DiGeorge综合征关键区域8蛋白,DGCR8)切割,产生大约60-70个核苷酸的发夹结构前体miRNA(pre-miRNA)。
3) 转运:pre-miRNA由exportin 5(XPO5)从核内运输到细胞质中。
4) 成熟:在细胞质中,pre-miRNA被DICER酶进一步加工,产生成熟的miRNA。
5) 功能:成熟的miRNA中的一条链(引导链)被加载到miRNA诱导的沉默复合体(miRISC)中,该复合体包含DICER1和Argonaute(AGO)蛋白。miRISC通过序列互补结合靶向mRNA,并在处理体(P-bodies)中通过靶向mRNA的降解和翻译抑制来介导基因抑制。
miRNA的这一生物合成途径在动植物中具有保守性,尽管在某些细节上可能存在差异。例如,在植物中,miRNA的生物合成也涉及类似的步骤,但可能在特定的调控机制和蛋白质因子方面有所不同[4]。
microRNA的合成与作用机制图[4]
microRNA的应用与研究前景
自从miRNA被发现以来,就因其在基因调控中的重要作用而受到广泛关注。miRNA通过影响目标基因的转录后调控和基因沉默等机制,参与了细胞生长、分化、发育和凋亡等一系列关键生物过程。在动物领域的相关研究包括:发育和细胞分化、细胞凋亡、 脂类代谢、激素分泌、内源基因表达调控、疾病发生机制、疾病预测与诊断、肿瘤发生机理、病毒的免疫防御机制等,而在植物领域,miRNA的研究包括:植物胚胎和分生组织发育、叶和花的遗传发育、核酸水平调控、病毒抵抗防御机制等。
miRNA的这些功能和研究应用领域,不仅揭示了其在生物体中的重要角色,也为未来的治疗策略和生物技术应用提供了广阔的前景。
microRNA应用领域
microRNA研究方法与高通量测序
研究miRNA的基本方法通常包括以下步骤:
1) 表型miRNA鉴定:基于高通量测序或已发表的文献,确定与特定表型相关的miRNA;
2) miRNA靶基因预测:利用生物信息学工具,如Targetscan、miRDB或PicTar,预测miRNA的潜在靶基因;或者通过查阅相关文献,筛选出与研究表型相关的miRNA和靶基因,以提高实验的成功率;
3) miRNA实验验证:通过双荧光素酶报告基因的实验验证miRNA与靶基因的靶向关系;
4) 研究miRNA的功能。
miRNA研究策略基本思路导图
高通量测序技术(Next Generation Sequencing,NGS)在miRNA的研究中扮演着至关重要的角色,可以帮助科学家深入分析样本中的miRNA,识别并定量已知的miRNA,发现新型有研究潜力的miRNA。通过对原始数据进行质量控制、序列比对、差异表达分析和靶基因预测等,研究人员可以揭示miRNA的生物合成、功能和调控机制,以及它们在各种生物学过程中的作用。
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参考文献:
[1] Lee RC, Feinbaum RL, Ambros V. The C. elegans heterochronic gene lin-4 encodes small RNAs with antisense complementarity to lin-14. Cell. 1993;75(5):843-854.
[2] Wightman B, Ha I, Ruvkun G. Posttranscriptional regulation of the heterochronic gene lin-14 by lin-4 mediates temporal pattern formation in C. elegans. Cell. 1993;75(5):855-862.
[3] Lin S, Gregory RI. MicroRNA biogenesis pathways in cancer. Nat Rev Cancer. 2015 Jun;15(6):321-33.
[4] Ha M, Kim VN. Regulation of microRNA biogenesis. Nat Rev Mol Cell Biol. 2014 Aug;15(8):509-24.
供稿:向琴、胡瑶
编辑:市场部
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