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盘点!17篇SCI带你一次了解华大无创单病真实力!

华大医学BGIDx 华大医学
2024-11-10

据2012年《中国出生缺陷防治报告》显示,我国出生缺陷发生率在5.6%左右,出生缺陷严重危害儿童健康,给家庭与社会均带来了一定的经济负担。在导致出生缺陷的致病因素中,染色体异常和单基因遗传病是造成出生缺陷的两大重要原因。随着基因检测技术的发展,通过无创产前检测 (NIPT) 筛查胎儿21/18/13三体异常的检出率可达98%-99%,但由于单基因遗传病对检测技术的精度要求较高,以往国内无创技术对于单基因遗传病的检测一直处于科研阶段。随着我国研究者在单基因遗传病无创检测方面的不断创新及突破,也证实了将NIPT应用于单基因遗传病检测的可行性。

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2011年1月至目前,华大携手临床合作伙伴累计发表无创产前基因检测相关科研论文63篇,其中SCI论文57篇,包含无创单基因病&全基因组SCI论文17篇。



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通过母体血浆测序和单体型的方法构建胎儿全基因组

简       介:无创-全基因组

影响因子:10.08

研究结果:首先利用祖父母及无亲缘关系的个体样本构建父母基因组单倍体型别,通过母亲血浆DNA测序的隐马尔科夫模型及父母基因组单体型别信息构建胎儿基因组。在测序深度约为44×、胎儿DNA浓度约为5.69%时,可无创式推断胎儿基因组及单体型别。研究证明胎儿单体型别中的98.57%父亲常染色体等位基因、95.37%母亲常染色体等位基因及98.45%母亲X染色体可准确构建。该篇文章证明可利用母亲血浆DNA测序无创式构建胎儿全基因组。



将基于目标区域测序的NIPT检测整合到枫糖尿病的临床检测中

简       介:无创-枫糖尿病

影响因子:8.68

研究结果:通过基于目标区域测序及无创产前单体型构建胎儿基因组方法,成功检测出一中国家庭中的BCKDHA基因新突变 (Ex2_4dup and c.392A>G),并开发了产前单倍型辅助方法,以无创方式检测胎儿的基因型。此篇文章为将基于目标区域测序的无创产前检测方法应用于临床检测的首个临床案例,证明利用基于大规模平行测序技术进行单基因遗传病诊断的未来可能性。



利用母体血浆测序法进行无创产前检测常染色体隐性遗传病-先天性耳聋中的应用

简       介:无创-先天性耳聋

影响因子:8.68

研究结果:通过单倍体构建方法检测胎儿是否遗传耳聋致病基因GJB2,由祖父母或先证者遗传信息构建父母单倍体型,根据母亲血浆样本测序信息及父母单倍体型别信息可推断胎儿单倍体型别。结果显示由祖父母构建父亲与母亲单倍体型别准确度分别为99.01%和97.36%;由先证者构建父亲与母亲单倍体型别准确度分别为98.73%和96.79%;但两者对胎儿致病基因遗传推断都是正确的。该篇文章证明基于无创产前检测的单倍体构建检测单基因遗传疾病可应用于临床检测。



利用母体血清中胎儿游离DNA,使用基于单倍体型方法的NIPT检测杜氏进行性肌营养不良

简       介:无创-杜氏进行性肌营养不良

影响因子:8.68

研究结果:NIPT应用于DMD的首次报道,也是首次将基于单倍体型方法的NIPT应用于X连锁疾病,表明基于单体型的策略对使用NIPT检测DMD或其他X连锁的单基因疾病将切实可行。通过父母和先证者的目标区域测序数据构建了父母的单体型。通过母体血清DNA测序的隐马尔可夫模型构建了胎儿的单体型。在男性中与母源突变等位基因有关的单倍型的存在表明了受到影响的胎儿。推测母体SNP的平均准确率达99.98%。当每个样品10M目标区域的平均深度达30×时,无创的结果与侵入性检查一致。



基于单体型的无创产前检测通过对母体血浆的靶向测序检测脊肌萎缩症

简       介:无创-脊肌萎缩症

影响因子:5.595

研究结果:招募了5名孕育过脊髓性肌萎缩症 (SMA) 儿童的孕妇。通过多重连接依赖性探针扩增 (MLPA) 鉴定SMN1基因中外显子7和/或8的缺失。在每个家族中分别从血液样品和母体血浆的基于单倍型的无创测定SMN1基因的亲本和胎儿单倍型。将胎儿单倍型与产前诊断从羊水或绒毛膜绒毛获得的胎儿DNA的MLPA结果进行比较。通过关于亲本单倍型的信息辅助,母体血浆的无创测试鉴定出一个胎儿为外显子7和8的纯合缺失,两个胎儿为外显子7和8的杂合缺失,两个胎儿正常。这些结果与MLPA的诊断一致。



利用母体血浆DNA的靶向捕获测序对21羟化酶缺乏症进行无创产前诊断

简       介:无创-21羟化酶缺乏症

影响因子:4.01

研究结果:无创产前单基因病诊断研究,探讨胎儿DNA浓度和测序深度对结果准确性的影响。对来自12个家庭的14份血浆样本 (包括4份妊娠前期样本) 进行靶向捕获测序,胎儿DNA浓度的下限为2%,平均测序深度为38X,利用隐马尔可夫模型 (HMM) 进行单倍型连锁分析。对所有的14份血浆样本,在妊娠第1天和第8周都准确鉴定出了胎儿的CYP21A2基因型。研究表明利用较低的胎儿DNA浓度和测序深度对21羟化酶缺乏症进行无创产前诊断的准确性和可行性。



无创产前检测致病CNVs在α-地中海贫血中的应用

简       介:无创-地中海贫血

影响因子:2.766

研究结果:通过目标区域捕获测序的方法检测5对携带SEA缺失型地中海贫血致病突变夫妇血浆,检测结果与有创诊断一致。研究证明目标区域捕获测序检测致病CNVs可以极大拓宽无创产前诊断的应用范围。



基于下一代测序和无创产前检测,通过检测血浆游离DNA,检测FGFR 3基因相关骨骼发育不良的测试、性能分析和可行性探讨

简       介:无创-软骨发育不全

影响因子:2.43

研究结果:基于下一代测序和无创产前检测,通过检测血浆游离DNA,检测FGFR 3基因相关骨骼发育不良,最后本检测鉴定出所有胎儿软骨发育不全,具有较好的敏感性和特异性。利用无创产前检测胎儿的软骨发育问题 (胎儿游离DNA浓度在3%)。在临床验证中,利用我们的方法从孕妇血浆中鉴定出所有的胎儿软骨发育不全,没有假阳性结果。本方法的敏感性和特异性分别为100% (95%CI,54.1%-100%) 和100% (78.2%-100%)。



通过对孕妇血浆中游离DNA进行靶向测序对钴胺素缺乏症进行无创产前诊断

简       介:无创-钴胺素缺乏症 (cblC)

影响因子:2.43

研究结果:无创产前单基因病诊断研究,验证基于单倍型方法对钴胺素缺乏症 (cblC) 进行无创产前诊断的可行性。对21个钴胺素缺乏症 (cblC) 的Trios家系 (包括父母和先证者) 进行靶向测序,确定与MMACHC致病变异相关的亲本单倍型,利用亲本单倍型辅助隐马尔可夫模型 (HMM) 对 21个胎儿的基因型进行推断,结果显示3个复合杂合、9个杂合携带者和9个正常胎儿,进一步的侵入性检测显示上述推断的准确率100%。研究表明该方法可以应用到钴胺素缺乏症 (cblC) 的无创产前诊断,并具有推广到其它隐性单基因病无创产前诊断的潜在价值。



对母体血液中胎儿游离DNA进行目标捕获测序的无创产前检测α和β地中海贫血的初步研究

简       介:无创-地中海贫血

影响因子:1.21

研究结果:招募的两个家系被诊断为β-地中海贫血基因或东南亚缺失型α-地中海贫血基因突变的携带者。收集母体血浆和羊水用于产前诊断。设计了靶向目标基因的外显子和1Mb侧翼区内的高度杂合SNP的探针。使用来自孕妇血浆DNA和来自夫妇及其子女的基因组DNA进行目标捕获测序。使用基于隐马尔可夫模型的算法从亲本单倍型推导出胎儿单体型。在两个家庭中成功检出胎儿基因型。两种无创构建的胎儿单体型与侵入性产前诊断结果相同,在目标区域中准确率为100%。研究表明,通过靶向捕获测序和单体型辅助分析方法可以有效实现对α-地中海贫血和β-地中海贫血的无创产前诊断。



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