重磅！华大基因CNV-seq (康孕®-染色体检测) 全新升级！
编者按:
基因组拷贝数变异检测技术 (Copy Number Variation sequencing，CNV-seq) 可对染色体缺失重复进行高精度准确检测，近年来在产前诊断、遗传病因明确等方面得到了广泛的临床应用。然而，CNV-seq对于部分异常的排查仍具有检测局限性，一方面，CNV-seq无法对于单亲二倍体 (Uniparental Disomy，UPD) 进行检测，因此共识指南也建议在使用CNV-seq的同时辅助其他技术方法用于UPD的诊断[1]。另一方面，部分非遗传因素比如病原微生物感染也会带来胎儿超声异常等问题，但无法通过常规CNV-seq进行排查。
为更好的满足临床需求，华大基因对CNV-seq检测产品迭代升级，新增常见UPD疾病检测，并结合特有的宏基因组算法对于超声异常胎儿病原微生物感染情况予以额外提示，填补了国内同类检测产品空白，为临床诊疗提供更全面的决策依据。
单亲二倍体染色体异常检测不容忽视
在出生缺陷染色体异常排查中，染色体数目异常及缺失重复是临床关注的重点，由UPD所导致的出生缺陷往往容易被忽视。然而，UPD与多种染色体异常疾病有关，其临床检测必不可少。UPD指来自父母一方的染色体片段被另一方的同源部分取代、或者个体的两条同源染色体都来自同一亲本的情况[2]。大多数染色体UPD没有临床表型，且不在常规检测方法范围内，从而容易被漏诊。目前已知当第 6、7、11、14、15及20号染色体存在UPD时会导致疾病的发生，其中常见疾病包括Prader-Willi综合征 (PWS)、Angelman综合征 (AS)、Silver-Russell综合征 (SRS)、Temple综合征和Kagami-Ogata综合征等。作为UPD疾病的典型代表，PWS发病率约为1/10,000-30,000，临床表现复杂多样，发病人群可出现在产前、幼儿期和成年期各阶段，涵盖了生长、发育、代谢等各方面的异常表现[3]。AS则主要影响神经系统，发病率约为1/12,000-20,000，临床表现包括发育迟缓，智力低下，共济失调，癫痫和睡眠障碍等[4]。目前针对UPD疾病尚无有效的治疗手段，因此，早发现、早诊断、早干预对于此类疾病的防控尤为重要。
CNV-seq共识建议运用其他技术辅助诊断UPD
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2019年4月，中华医学会医学遗传学分会临床遗传学组、中国医师协会医学遗传医师分会遗传病产前诊断专业委员会、中华预防医学会出生缺陷预防与控制专业委员会遗传病防控学组联合发布《低深度全基因组测序技术在产前诊断中的应用专家共识》[1]，建议对于临床高度怀疑为单亲二倍体的胎儿，运用其他技术进行辅助诊断。
宫内病原感染与出生缺陷及不良妊娠结局相关
除遗传因素外，非遗传因素也会造成胎儿畸形继而引发出生缺陷，占比约为35%-55%[5]，宫内致畸相关病原感染是其中的重要组成部分。病原微生物感染不仅会危害母胎健康，导致胎儿生长受限、畸形、早产、流产、死胎等不良妊娠结局的发生，而且新生儿感染和脑瘫等并发症概率也将增加[6, 7]。常见的病原微生物包括巨细胞病毒 (CMV)、弓形虫、微小病毒 B19、水痘－带状疱疹病毒等。以CMV为例，妊娠期孕妇原发性CMV感染后多无症状，但其胎儿感染率高达30％-40％[8]，先天性CMV感染的产前超声特征包括生长受限、肝脾肿大、脑室扩张、颅内钙化、小头畸形及其他脑部异常等[9]。对宫内致畸相关病原感染进行检测，可进一步排查非遗传因素带来的超声异常，为临床诊疗提供更多的参考依据。
华大基因CNV-seq (康孕®-染色体检测) 全面升级
为助力临床精准诊断，华大基因CNV-seq (康孕®-染色体检测) 系列产品全面升级，在原有检测23对染色体非整倍体、100Kb以上缺失/重复基础上，实现无需父母样本验证，新增由于UPD导致的常见染色体疾病检测，同时通过对既往数万例CNV-seq检测样本及数据回溯，开发了特有的宏基因组算法，可对具有超声异常表现的胎儿予以病原微生物感染补充提示，指导后续妊娠管理，改善临床预后，为出生缺陷精准防控提供更全面的解决方案。
核心升级亮点大揭秘
23对染色体非整倍体
100Kb以上缺失/重复
新增常见单亲二倍体疾病检测
新增病原微生物检测
新增病原微生物检测
升级产品介绍
案例展示
王女士，25岁，孕28+3周，G1P0，孕期出现不明原因发热38.5℃，胎儿B超提示发育异常、侧脑室增宽 (14mm) 等异常表现。在医生建议下，抽取羊水进行产前诊断，其CNV-seq结果为阴性。随访结果显示王女士足月分娩一男胎，临床表现为精神发育异常，运动发育迟缓，经医院确诊为脑瘫，医生诊断为孕期巨细胞病毒感染所致。
华大通过回溯该羊水样本数据，进行宏基因组算法分析，结果提示疑似巨细胞病毒宫内感染，后经核酸验证为巨细胞病毒阳性 (病毒载量为104拷贝/mL)。
左图 王女士病原微生物附加报告 右图 宏基因组算法分析鉴别样本巨细胞病毒感染
出生缺陷的综合防治之路任重道远，我们坚信随着未来经济的发展与科技的进步，精准、高效的检测技术将在临床中得到更广泛的应用。华大基因秉承基因科技造福人类的使命和助力临床精准医疗的愿景，创新性地将单亲二倍体及病原微生物检测整合进CNV-seq技术临床检测产品中，旨在通过技术革新，更好地为临床服务，与医生丰富的临床经验相结合，共同谱写出生缺陷防控的新篇章！
参考文献：
[1] 中华医学会医学遗传学分会临床遗传学组, 中国医师协会医学遗传医师分会遗传病产前诊断专业委员会, 中华预防医学会出生缺陷预防与控制专业委员会遗传病防控学组. 低深度全基因组测序技术在产前诊断中的应用专家共识[J]. 中华医学遗传学杂志,2019; 36(4): 293-296.
[2] Daniela Del Gaudio, et al. Diagnostic Testing for Uniparental Disomy: A Points to Consider Statement From the American College of Medical Genetics and Genomics (ACMG). Genet Med. 2020; 22(7): 1133-1141.
[3] 中华医学会儿科学分会内分泌遗传代谢学组. 中国Prader—Willi综合征诊治专家共识(2015)[J]. 2015; 53(6): 416-424.
[4] Karin Buiting, et al. Clinical utility gene card for: Angelman Syndrome. Eur J Hum Genet. 2015; 23(2).
[5] Kumar P. Dysmorphology. In: Kumar P, Burton B, editors. Congenital malformations. 1st edition. Blacklick. USA: McGraw-Hill Professional Publishing; 2008. p3–11.
[6] Riggs MA, et al. Treatment of vaginal infections to prevent preterm birth: a meta-analysis. Clin Obstet Gynecol. 2004; 47(4): 796-807.
[7] Jessica L Illuzzi, et al. Duration of intrapartum prophylaxis for neonatal group B streptococcal disease: a systematic review. Obstet Gynecol. 2006; 108(5):1254-65.
[8] 杨慧霞. 妊娠期感染性疾病诊治策略[J]. 中国实用妇科与产科杂志. 2016; 32(6): 499-501.
[9] 王谢桐. 胎儿超声异常与病毒感染[J]. 实用妇产科杂志. 2018; 34(12): 888-890.
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