1958，王震将军率领十万复转官兵开发北大荒，并主持创建了“铁道兵农垦局农业大学”，亲任校长。
1959年，国家教育部批准，正式定名为黑龙江八一农垦大学。
1967年3月，学校改名为军垦大学并成立了军垦大学革命委员会，2个月后改名为东北农垦大学。
1967年，牡丹江地区革命委员会批复成立“东北农垦大学革命委员会”。
1969年，学校划归黑龙江生产建设兵团管理，不久学校被撤销。
1973年，学校复校，时名为“中国人民解放军沈阳军区黑龙江生产建设兵团农垦大学”。
1976年，学校更名为“黑龙江农垦大学”。
1978年，校党委向上级要求恢复“黑龙江八一农垦大学”校名，并得到省革命委员会正式批准恢复。
2003年，学校整体迁至大庆市高新技术开发区。
新时期，学校围绕建设教学研究型大学的发展目标，正在为早日实现“强校梦”、“中国梦”做出新的更大贡献。