开天辟地：又一重要器官的菌群研究获历史性突破~ | 热心肠日报

今天是第459期日报。

Immunity：小鼠结膜共生菌，保护眼睛不受感染！

Immunity[IF:22.845]

① 采用小鼠眼表疾病模型，分离出mastitidis棒状杆菌，后者可诱导眼睛粘膜内的γδ T细胞产生共生菌特异性白介素-17应答；② 向缺乏mastitidis菌的小鼠体内移植该细菌，可保护眼睛免受感染；③ 针对mastitidis菌特异性的应答驱动中性粒细胞募集，向眼泪中释放抗菌素，保护眼睛免受致病性白色念珠菌或铜绿假单胞菌感染；④ 局部使用抗生素可能导致眼表更易感染，提示眼表的常驻菌群在眼部免疫稳态和宿主防御的细胞机制中发挥作用。

An Ocular Commensal Protects against Corneal Infection by Driving an Interleukin-17 Response from Mucosal γδ T Cells

2017-07-11  DOI: 10.1016/j.immuni.2017.06.014

Immunity：眼睛共生菌群研究的精彩序幕，正式开启！

Immunity[IF:22.845]

① St. Leger等人在Immunity杂志发表了备受瞩目的研究——在小鼠结膜中明确发现了保护眼睛免受感染的共生细菌（mastitidis棒状杆菌）；② 基于研究者的强大免疫学背景，对发现的共生细菌的相关免疫学机制研究得很深入，证据链令人信服；③ 未来研究可关注：是否有其他细胞（如树突状细胞）和分子参与眼部防御，共生菌如何在不利于微生物生长的环境中顽强生存等；④ 这项研究终结了过去很长一段时间的争论，开启了眼睛共生菌群研究的精彩序幕。

A Commencement for Eye Commensals

2017-07-18  DOI: 10.1016/j.immuni.2017.07.006

Immunity：首次明确肠道IgM的来源和功能

Immunity[IF:22.845]

① 人体肠道IgM+浆细胞明显多于小鼠，且在克隆上与遍布肠道的IgM+记忆B细胞相关；② IgM+记忆B细胞与IgA+记忆B细胞共享肠道特异性基因特征，并与IgA+记忆B细胞的克隆类型相关，可在对T细胞依赖性/非依赖性信号的应答中转换为IgA；③ 这些信号诱导大量IgM产生，与IgM+浆细胞产生的sIgM共同识别粘膜中的共生细菌；④ 人类而非小鼠的sIgM可识别被sIgA包被的细菌，这些双重包被的细菌比被IgA单独包被或未被包被的细菌相比，丰度及多样性更高。

Human Secretory IgM Emerges from Plasma Cells Clonally Related to Gut Memory B Cells and Targets Highly Diverse Commensals

2017-07-11  DOI: 10.1016/j.immuni.2017.06.013

AIDS：HIV感染/未感染者的肠道CMV和EBV特征

AIDS[IF:5.003]

① 从19名HIV感染者及22名HIV未感染者中收集63份左/右结肠及17份末端回肠活检样本；② HIV感染者的样本中检测到的巨细胞病毒（CMV）更少，EB病毒（EBV）更多；③ 末端回肠样本比结肠样本更多地检测到CMV，不同肠道部位检测到的EBV无差异；④ CMV或EBV的检测状态不影响肠道菌群的OTU数量；⑤ 在HIV感染者中，高CMV水平与回肠中放线菌丰度较低相关，在未感染HIV的个体中，CMV与回肠、结肠的某些细胞因子的上调相关；⑥ EBV对细胞因子及菌群组成无影响。

Effect of CMV and EBV replication on intestinal mucosal gene expression and microbiome composition of HIV-infected and uninfected individuals

2017-07-07  DOI: 10.1097/QAD.0000000000001579

FM：肠道菌群与宿主体液免疫的选择性共同微进化

Frontiers in Microbiology[IF:4.076]

① 鸡作为模式生物，分析肠道菌群与宿主体液免疫系统间的共同进化；② 根据绵羊红细胞抗体滴度对宿主进行40代选择后，发现宿主体液免疫的微观进化促进分类群水平上的肠道菌群组成；③ 放松（Relaxing）选择使一些对宿主免疫功能相反的菌群富集，疣微菌科及颤螺菌属在高抗体放松（HAR）下富集，并促进抗体反应降低；④ 乳杆菌属在低抗体放松（LAR）下增加，并增强抗体反应；⑤ 研究结果揭示了宿主-菌群的共进化关系及肠道菌群对宿主免疫的影响。

Gut microbiota co-microevolution with selection for host humoral immunity

2017-07-04  DOI: 10.3389/fmicb.2017.01243

FM：给猫口服益生菌，呼吸道菌群变了

Frontiers in Microbiology[IF:4.076]

① 6只健康年轻的猫口服益生菌（VSL#3）4周，采集口咽、支气管肺泡灌洗（BALF）、直肠、血液样本；② 平均菌群丰度在上呼吸道及下呼吸道样本中显著增加；③ 在被分析的5种益生菌OTU中，口咽菌群中有5种的丰度显著上升，支气管肺泡及粪便中分别有3种及2种升高；④ BALF及血液样本在益生菌处理后在分级群聚中聚集，这两个部位的菌群组成均发生了显著变化，口咽及直肠样本的菌群种群组成未发生显著改变；⑤ 口服益生菌后，样本之间的差异变大。

Oral Probiotics Alter Healthy Feline Respiratory Microbiota

2017-07-11  DOI: 10.3389/fmicb.2017.01287

DD：不同肠道疾病，肠道菌群特征确实挺不一样

Digestive Diseases[IF:1.775]

① 评估非复杂憩室病（DD）、肠易激综合征（IBS）和炎性肠病（IBD）患者与健康对照（CT）的肠道菌群组成差异；② 通过宏基因组基因靶向方法分析粪便菌群组成，IBS与IBD患者的粪便菌群表现出显著差异；③ DD患者粪便菌群的物种组成与CT相似，除了脆弱拟杆菌存在差异；④ IBS患者中，小类杆菌属及柔嫩梭菌群是最具代表性的物种，而在克罗恩病中，变形杆菌属是最具代表性的；⑤ 每种病症都具有明确的整体菌群特征，与其他病症产生明显的分化。

Gut Microbiota in Health, Diverticular Disease, Irritable Bowel Syndrome, and Inflammatory Bowel Diseases: Time for Microbial Marker of Gastrointestinal Disorders?

2017-07-07  DOI: 10.1159/000477205

刘雪珠等：长江口表层海水里有什么细菌？

PeerJ[IF:2.177]

① 从长江河口及附近区域的12个位点分别采样，分析表层海水的菌群群落结构及功能；② 12个来自不同地点的样本可分为6组，变形菌门在所有样本中均占主要地位，其次是拟杆菌门及放线菌门，α-变形菌纲及γ-变形菌纲是最主要的细菌纲；③ 原核生物的固碳途径、光合生物的氮代谢、固碳途径在所有样本中富集；④ 溶解氧及PO43浓度与细菌群落呈正相关，化学需氧量、溶解氧及PO43与菌群功能多样性显著相关。

Composition and predictive functional analysis of bacterial communities in the surface seawater of the Changjiang Estuary

2017-07-10  DOI: 10.7287/peerj.preprints.3079v1

感谢本期日报的创作者：花开，热心肠先生，沈志勋，小扣啊

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