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20221028【回放】-杨鸣雷丨单分子测序解析体内RNA二级结构构象多样性

BioArt 2023-04-22

精选提问:

1.哺乳动物细胞中有没有尝试过相同的RNA结构测序?

2.这种构想改变对蛋白功能表达有什么影响?

3.您是如何对所有二级结构进行聚类的呢?看图的话,您用的是pca的两个成分,那么PCA的输入数据是什么呢?谢谢?

4.RNA构象改变响应温度变化,那么这种温度选择性构象变化的调控机制是什么?

5.是同一个isoform 有不同的构象吗?

6.另外,这里测的RNA非常长,仅从每个位置突变与否,是不是很难得到配对的详细信息呢?

7. Fire:这个单分子测序能测出多长的RNA?测序深度怎么样?能发现多少的RNA呀?

8.酸性条件会不会影响构象?

9.老师请问常规pull down去分析结合目标启动子的lnc RNA结果效果好么?

10.请问杨老师,这种突变对拟南芥植株存活率有影响吗?

11.您好。我想问你们使用的试剂优点有哪些呢?还有一个问题是您有张图是用您实验数据跟聚类分析,能解释一下两个轴吗?

12.请问如何区分引入突变带来的影响是序列引起的还是结构引起的呢?

13.在人体对冷热环境,lncRNa的测序改变意义?

14.FLC mRNA降低是由于翻译下降还是mRNA稳定性下降?

......


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演讲人介绍:

杨鸣雷:Senior Scientist in John Innes Centre, 2009-2015年就读于中国科学院合肥物质科学研究院获得生物物理博士学位,之后在中国科学院北京遗传与发育研究所和英国John Innes Centre从事博士后研究,主要研究方向是以植物拟南芥为模式系统,开发基于高通量的研究手段,解析体内RNA/DNA结构在不同的转录调控中的作用。


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制版人:Leo

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