Origin绘图:XPS曲线半透明填充“叠影重重”
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一位来自湖北大学的PLWlk提出:怎样将XPS分峰曲线下方区域填充为半透明的彩色?例图如下:
图1 文献图
【文献】ACS Catal. 2016, 6, 8336-8341
【DOI: 】10.1021/acscatal.6b02664
PLWlk推荐的理由:上图很鲜明,细节挺好,叠影界限分明。
一般高水平期刊的作图都很出色,都很有内涵。确实,文献作者是“用心”在作图,这种“用心”往往是反复琢磨、反复推敲的一个费时的过程。用心作图的功夫,往往不负有心人!
多数文献的XPS能谱图都是各色线条分峰谱。
一方面,这种曲线的绘制可以很简单,通过origin绘图软件一步到位,几乎不用修改和渲染,可以说是一种“偷懒”的绘图模式;
另一方面,这种曲线太普通,略显杂乱,分峰曲线藏于全谱下方且与其他分峰曲线交织,如果线度(粗细)太细,颜色区分度较小的情况下,任你睁大眼睛也很难分辨清楚。
谭编以PLWlk提供的数据为例,在Origin绘图软件中演示曲线怎样半透明填充彩色的过程。
第一步:数据准备
从Excel全选数据,Ctrl+C复制,在Origin软件的空白表格中,点击“Comment”,然后Ctrl+v粘贴。这里为什么要点击“Comment”,因为Excel中第一行是标题文本,在Comment中粘贴,可以将标题文本自动填入“comment”中。具体步骤如下图所示。
图2 数据的导入
第二步:绘制草图
在Origin数据表中,从灰色标题栏按下鼠标左键不放,向右移动鼠标到最后一列标题,这样选中了需要绘制的数据列,然后点击左下角的“Line”线图工具,得到下图所示的曲线图,并做相应格式和范围的调整。
图3 绘制草图
图4 “懒式”草图
上图也就是最常见的“懒式”图。
第三步:透明填充基本步骤
在对上图进行透明填充之前,先介绍一下基本操作。对于一条曲线,采用下图的具体步骤进行填充。通常双击曲线后,在弹窗中看不到曲线下方填色的界面或功能,只有在点击下图的第②步后才显示填充方式。这也是众多初学者,一直找不到曲线填充功能的一个重要原因。
图5 曲线的填充功能“开关”
在点击上图中第②步之后,按照下图的步骤操作。你会发现右边的示例已经显示出填充方式:曲线下方。另一种方式曲线与横轴围成区域也是常用的,表示阴影面积。下图步骤中,只有点击第①步✔之后,才可以操作第②和③步骤。
图6 曲线填充样式
完成上述步骤之后,点击“Pattern”定义填充样式。按照下图步骤操作。
图7 曲线半透明填充
于是,得到下图所示的填充效果。为了显示其半透明,谭编画了一个椭圆,然后将其置入最底层“Push to the back”,衬底后,曲线的半透明填充就体现出来了。
图8 曲线半透明填充效果图
其他填充效果的操作步骤如下图所示,可以点击“Apply”应用一下预览显示效果。
图9 曲线不透明单色填充效果
上图的第②步选择一种颜色则如上图所示为亮色过渡到深色,如果选择两种颜色则是在这两种颜色之间过渡(如下图)。当然设置好这些过渡效果之后,再调整透明度“Transparency”就可以半透明,具体透明度调多少,看自己觉得满意为止。
图10 曲线不透明双色渐变填充
第四步:XPS曲线的透明填充
通过一步法绘制的曲线,通常是绑定的状态,需要将其改为独立状态。具体操作如下图所示,双击任意曲线之后,在弹框中点击“Independent”,然后选择左边Layer1中的某条曲线,按照第三步的基本步骤操作即可。
图11 曲线群组解绑
例如,首先点击某条曲线,然后点击“Line”标签,✔“Fill Area under Curve”,接着点击“Pettern”标签,按照下图所示的步骤设置即可。
第五步:球状散点
点击曲线,然后点击最下方的绘图工具栏的Line+scatter(线+散点)绘图,具体步骤如下图所示。
图13 由线图(Line)改为线散点图(Line+scatter)
上图这样操作之后会将所有曲线加上散点(如下图),但是,我们只想将全谱线加上球状散点,能不能只修改某一条线图为线散点图?谭编尝试按照图12的步骤,对全谱曲线修改“Plot Details”弹窗左下角“Plot Type”的“Line”为“Line+Scatter”,但是,这个地方是灰色的,不让修改。
图14 不希望得到的图
好吧,那我们就在图14的基础上,将其他图的散点线改为Line。我们双击每一条需要修改的曲线,在弹窗中修改。但是,这下全部变为Line+Scatter也是灰色地带不让改哦(如下图),这或许是我们将所有曲线绘制在一个图层的结果,任何修改都对同一个图层下的所有对象进行修改。也就是说,我们安排多个图层,每个图层放置一条曲线,那就相当灵活了。
那么,在同一个图层中怎样设置不同的图线样式呢?我们可以尝试将其他曲线的图例隐藏起来!将每条曲线的Symbol的大小改为0,具体步骤如下图所示。
图15 图例符号的隐藏方法(置零)
接下来,调整全谱线的散点样式(由■改为球)。双击全谱线,弹出如下图所示的对话框窗口,按照下图所示的步骤操作,选择图例样式列表左下角的黑白色球,最后调整填充颜色(第⑤步)。
图16 球体散点图例的设置
现在设置球体的样式,上图在点击第⑤步后选择一种颜色(如下图),然后修改大小、半透明,注意半透明的游标此时是灰色的,拖不动的,是因为“开关”没打开,就是需要去除✔之后,这个游标才可以被拖动。
图17 球体颜色和半透明的【开关】
有时候,散点太挤了,可以通过下图的步骤调整散点的疏密度,也就是设置“跳点”(Skip Points)显示。具体步骤如下图所示。
图18 散点图例的“疏密”调节方法
得到的效果图如下图所示。当然,后续还需要对每个分峰进行元素轨道的标注,谭编就不演示了。
图19 散点疏密度调节后的效果
小秘密:配色原则
上图每个填充颜色的选取比较混乱,无章可循。当然文献图(图1)还有一个“亮点”就是配色!可能大家很少注意(或许也没这个意识)这个配色原则,这是一个什么配色原则呢?
“红移”和“蓝移”大家可能不陌生吧!那么在很多波谱的分析研究中,经常讨论某个峰因为合成掺杂或者其他什么条件发生向长波长(红光)方向移动(红移),;相反,向短波长(蓝光)方向移动,则称之为“蓝移”。
谭编这样说,大家都明白了,那么我们在为每一条曲线填充颜色时,就要考虑从左到右依次填充紫、蓝、蓝绿、绿、黄、橙、红等色。XPS能谱的横轴为结合能(Binding energy/eV),虽然并非光谱的波长,但也不妨按照这个填色原则进行填充,这样可以保证其他类似的图保持全文填色规律一致,这也是一个非常好的习惯。最终本文的XPS曲线半透明填充的效果图如下图所示。
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