【超简明系列】医学检索入门及检索策略
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医学信息检索知识点梳理
目录
1.绪论
2.中文数据库检索
3.PubMed检索
4.Web of Science检索
5.NoteExpress文件管理软件
6.学位论文检索
7.电子书检索
8.google网络搜索
9.检索策略
绪论
1.检索基本思路：（例：2010年甲流发病率）
①准确了解背景知识（甲流，甲型h1n1，权威机构，权威作者）
②挖掘隐含的信息线索（卫生部，统计数据）
③切分为多个词语输入（2010 h1n1 发病率）
④选用核心词，省略不重要的词（甲型）
2.文献类型：
①图书：教科书、工具书、专著
②连续出版物：期刊、报纸
③特种文献：标准规范、会议文献、产品资料、专利文献、科技报告、学位论文
【会议文献(conference、proceeding)：比期刊信息更新，但全文较难获取】
【学位论文 (dissertation )：篇幅长、论述循序渐进，实验方法表达详尽】
3.不同文献类型的用途：
①概念、定义、背景知识查找：百科全书、词典、辞海、专著
②事件、数值查找：年鉴、报纸、统计资料等数值数据库
③课题研究内容：期刊、会议文献、学位论文、科技报告
④技术研发、申请专利：专利文献、成果数据库
4.文献的加工深度：
①一次文献（原始文献)
②二次文献 (目录类文献、索引）
③三次文献（教科书、参考工具书、综述）
④零次文献（私人笔记、试验记录、设计草图、口头交流的信息等）
5.违规行为：
①超过正常阅读速度，连续、系统、批量地进行下载。比如在一小时内下载超过百篇以上的全文文献、对某本期刊整本或整期下载。
②使用软件、工具批量下载电子资源，如“网络蚂蚁”或“Flashget”之类网络机器人软件。
6.查准与查全：
①了解某一理论、方法、设备、过程等具体的片断的信息，以解决研究中的具体问题，要求以“准”为主
②申请发明、申报成果奖励、鉴定科研成果以及立项查新时，往往需要全面地收集某一主题范围的文献信息，这类课题具有普查追溯的特点，应着眼于“全”
7.常用英文数据库：
①PubMed（北美期刊为主，文摘, 全）
②Web of Science 核心合集（文摘，精）
③Embase (欧洲期刊）
8.常用中文数据库：
①中国学术期刊网络出版总库（即中国知网）（全文）
②万方数据—期刊、会议、学位论文等（全文）
③中文科技期刊数据库（维普，全文）
④中国生物医学文献数据库（即CBM）（文摘）
⑤超星电子书（全文）
⑥西医图书数据库(人民卫生出版社)
9.检索途径：
检索途径 | 检索标识（检索词） | 备注 |
分类检索 | 分类名、分类号 | 当“主题词”无法覆盖要查的内容（比如一个疾病还有很多细分类时），可进行“中图分类号”检索、分类检索 |
主题检索 | 关键词、自由词、规范词 | 某些数据库（如中国生物医学文献数据库CBM）把关键词里的词统一成主题词（肾功能不全、肾衰、肾功能衰竭），用“主题搜索”，下面有“树形结构” 中文：CBM的主题检索 英文：PubMed的MeSH词表 |
著者检索 | 著者姓名 | PubMed中有著者格式转换，“姓 名首字母” |
刊名检索 | 刊名缩写与全称 | 有的英文数据库对刊名的书写格式进行了规范化处理，例：N Engl J Med（PubMed） |
机构检索 | 机构名称缩写与全称 | 有的英文数据库对机构的书写格式进行了规范化处理，例：Fudan Univ（Web of Science）。Web of Science Core Collection上选“地址”要有规范名称，“机构扩展”则可以搜全称 |
引文检索 | 被引用文献的检索标识 | 参考文献回溯的文献“越查越老”，通过引文检索，可以用老文献回查，谁引用了它。是Web of Science Core Collection发明的，并发明了SCI。中国知网也可以 |
推荐：分类搜索＋检索词
10.逻辑算符：
①逻辑算符（布尔算符）：与（交集）、或（并集）、非
【运算次序：一般为：not →and →or】
【在一个检索式中同时出现and, or时，如果要先算or的部分，应把or的部分输在前面，或输在一个检索框内。如果在专家检索中输入检索式，应用括号括起or的部分】
②精确匹配符（短语匹配）：“”
③位置算符（邻近算符）：用于限定检索词之间的间隔单词数，有adj, near, N, W等
【tongue w/2 base表示两个检索词中间最多允许插2个词，词序可互换】
④字段限定符
⑤截词符与通配符：
*词尾，替代0个或任意多个字符
?, $,#等用于词中、词尾，一个通配符替代一个或0个字符
11.寻找中外文核心期刊：
①科技部中国科技期刊引证报告：http://coreej.cceu.org.cn/，查询中文期刊影响因子、收藏图书馆
②北大中文核心期刊要目总览：http://coreej.cceu.org.cn/，查询“核心期刊”、本专业重要期刊
③外文：JCR，在“Web of Science”的左上角
中文数据库
1.检索策略：
核心概念舌根肿瘤限定篇名（以确保查准）
次要检索词治疗可限主题或文摘
例：舌根肿瘤的治疗——中国知网
“舌根肿瘤”限定在篇名，而“治疗”限定在主题、文摘
使用“模糊查询”以查全同义词
“舌根肿瘤”可同义为舌根癌、舌根瘤，“治疗”可同义为手术、切除、疗法
还有“结果中检索”
因此可先检索“舌根肿瘤”，再检索“治疗”
“分类检索”结合“主题检索”
2.中国知网搜索后：
①可分组浏览，确定核心著者群
②导出题录：选择文献，点击导出
③选中文献，点击阅读，批量预览全文
④查看检索式
⑤分析→文献互引图
3.CBM
①运算次序：NOT＞AND＞OR
②每个框只能输入单个检索词，不允许输入逻辑算符，多个字段组配需分步发送到检索框
③主题词表来自中国中医研究院图书情报研究所新版《中医药学主题词表》
【可通过CBM查询规范的英文主题词名，再去PubMed上面查】
④主题词检索的功能：
将非主题词引见到主题词形式
提供主题词的定义、注释
显示主题词之间的族性关系（上位词、下位词、同位词）
主题索引中提供中、英文两种形式
带*的主题词是重点论述的内容
⑤副主题词：限定规范主题词某一方面研究内容的规范词，例：
诊断：诊断，放射摄影术，放射性核素成像，超声诊断等
治疗: 治疗，药物治疗，放射治疗，外科学，膳食疗法，康复，中医治疗等
病因: 病因学, 病理学, 化学诱导，中医病机等
⑥人工标引速度慢，最新论文未标规范主题词；新词、一些很专指的概念没有对应的主题词
（如舌根癌），因此CBM查文献应同时使用自由词检索以防漏检
先用“主题检索”搜索，再用自由词检索
最后合并两次搜索结果（组合检索式：(#1 or #2)）
⑦加权检索：相关性更强
扩展检索：含这个主题词的“下位词”（更细分类）。若不扩展，就排除了这个主题词的下位词里的内容，只剩归不进下位词的内容
4.维普：
每个框均可输入检索式*、+、-
5.三个中文数据库比较：
中华医学刊 | 生物医学期刊种数 | 高级检索框输入 | 其他特点 | |
CNKI | 2007年截止 | 1175 | 不可输入逻辑符 | 结果分组；相关词提示；结果中搜索 |
万方 | 最新刊全部收录 | 1188 | 可输入逻辑符 | 高频词；相关词 |
维普 | 2007年截止 | 2083 | 可输入*，+，- | 有同义词、同名作者等相关提示； 在结果中搜索、添加、去除 |
CBM | 收录最新题录全文2007年截止 | 1800 | 选取逻辑符，分步送入检索框，智能检索 | 翻译中文规范词确定分类号 获取编辑部信息 选择作者机构 结果聚类 |
5.中文综述检索：
搜“综述”“概述”“进展”“现状”“展望”“回顾”
综述可短时间内了解研究的最新动态、研究分支、确定选题方向、提高研究起点
【英文综述直接在结果中选择Review即可】
PubMed
1.特点：提供检索词智能转换匹配，仅含期刊文献，不含学位论文
2.不同标引的含义：
①[PubMed-indexedfor MEDLINE]：来自MEDLINE，有MeSH字段和摘要的已标引数据
②[PubMed-OLDMEDLINEfor Pre1966]：来自MEDLINE，无MeSH字段和摘要的1949-1965年间的数据
③[PubMed-inprocess]：来自MEDLINE，尚未经MeSH字段标引的处理中数据
④[PubMed-assupplied by publisher]：非MEDLINE，无MeSH字段标引，直接由出版商提供
⑤[PubMed]：非MEDLINE，无MeSH字段标引
3.检索规则：
①每个框可输入多个检索词，运算符必须大写
②系统默认空格为AND检索，但有字段限定时不拆分
③著者检索[au]：姓全称在前，名首字母在后
④刊名检索[so]：全称或标准缩写
⑤查文章作者全名：[FAU]
⑥PubMed可智能转换匹配，具体匹配语句详见右侧下方的Search Detail
例：livercancer →"liver neoplasms"[MeSH Terms] OR ("liver"[AllFields] AND "neoplasms"[All Fields]) OR "liverneoplasms"[All Fields] OR ("liver"[All Fields] AND"cancer"[All Fields]) OR "liver cancer"[All Fields]
⑦左侧可进一步在结果中筛选
Article types | 文献类型 |
Text availability | 全文、免费全文、摘要 |
Publication dates | 出版日期 |
Species | 研究对象人/动物 |
Languages | 语种 |
Sex | 性别 |
Subjects | 各主题领域 |
Journal categories | 各种专题子数据库 |
Ages | 年龄 |
Search fields | 字段 |
⑧凡是标题带[]的，就不是英文文献！下面会告诉语种
⑨检索历史中显示历次检索式、时间和检出篇数。可组配检索式，如：#1 OR #2，#1 AND child
4.字段含义说明
字段名称 | 字段标积 | 字段含义 |
Affiliation | [AD] | 第一著者单位、地址 |
All Fields | [ALL] | 所有字段 |
Author | [AU] | 著者 |
Corporate Author | [CN] | 团体著者 |
First Author Name | [1AU] | 第一著者 |
Full Author Name | [FAU] | 著者全名 |
Issue | [IP] | 期刊期号 |
Journal | [TA] | 期刊名称（含全称、缩写、ISSN号） |
Language | [LA] | 语种 |
Last Author | [LASTAU] | 排名最后的著者 |
MeSH Major Topic | [MAJR] | 主要MeSH主题词，用*表示 |
MeSH Subheadings | [SH] | MeSH副主题词 |
MeSH Terms | [MH] | MeSH主题词 |
Other Term | [OT] | 款目词（非MeSH主题词） |
Pagination | [PG] | 文献起止页码 |
Personal Name as Subject | [PS] | 作为文献主题的人名 |
Pharmacological Action | [PA] | 药理作用概念 |
Place of Publication | [PL] | 期刊出版国别 |
Publication Date | [DP] | 出版日期 |
Publication Type | [PT] | 文献类型 |
Subset | [SB] | 数据子集 |
Text Words | [TW] | 文本词，来自TI、AB、MH、SH、PT等字段 |
Title | [TI] | 题名 |
Title/Abstract | [TIAB] | 题名/摘要 |
UID | [PMID] | PubMed文献唯一识别码 |
Volume | [VI] | 期刊卷号 |
5.MeSH词表查规范词
选“MeSH”数据库，而不是“PubMed”
例：在“MeSH”里查“liver cancer”，点进去，出现“上位词”“下位词”“款目词（不规范词）”
主题词检索后应补查最新一年的未整理主题词的文献，再用检索历史合并检索结果
查找杂志规范名：选“NLMcatalog”数据库，而不是“PubMed”
6.检索结果导出：
Send to→MEDLINE→txt【导出后可直接导入题录到NoteExpress】
Send to→summary→csv【导出后可用excel打开，然后复制标题到谷歌翻译，快速浏览搜索结果】
7.PMC (PubMed Central)
生命科学免费期刊资源中心
免费提供900多种期刊的10多万篇全文
其中部分文献被PubMed涵盖
8.分析PubMed结果：
德国网站GoPubMed：www.goPubMed.com
可提供时间、国家、城市、刊物分析
Web of Science
1.检索范围：期刊、技术专利、会议录、化学反应、Internet资源、文献分析工具，不含学术论文
“更多设置”：勾选第一个、第四个即可，其他的与医学无关
2.其他功能：（页面最上方）
①JournalCitation Reports(JCR)（期刊引用报告数据库）：与科学计量学工具结合，有分析功能
②EssentialScience Indicators（基本科学指标数据库）：提供了对科学家、机构、国家/地区和期刊进行排序的数据；依据期刊文章出版数量和引文数据，探索科学绩效统计和科学趋向数据；确定特定研究领域的研究成果和影响；评估潜在的雇员、合作者、评审人和同行
③InCites（基于引文的综合性科研评估工具）：评估数据来源于高质量的Web of Science引文数据库各学科领域30年的数据；从宏观的国家、机构、领域分析到微观的每篇论文、每个科研人员的绩效评估
3.检索方式：
4.检索规则：
①在检索框中输入检索词（关键词、著者姓名、刊名等）。词组检索可使用双引号
②支持AND、OR、NOT的逻辑组配，同时使用时遵循NOT＞AND＞OR的运算顺序
③提供NEAR/X位置算符，表示由该运算符连接的检索词之间相隔指定数量的单词 （X为最大单词数）；提供SAME位置算符，表示检索词出现在同一个地址中
④著者检索输入格式为：SmithJP
⑤通配符：可用于词前、词中或词尾，* 替代多个字符； ？替代1个字符；$替代0个或1个字符
⑥检索后再左侧“精炼检索结果”，可继续选择（类似PubMed左边，但可选性更高）
⑦获取全文：“出版商处的全文”、“S-F-X”（校园网可获得的）
⑧左下角“分析检索结果”
⑨CitedReferences越查越旧，Times Cited越查越新，RelatedRecords越查越深
5.检索字段选择：
①主题——包括标题、摘要、关键词字段TS=Topic
②标题TI=Title
③作者——作者、书籍作者、书籍团体作者、团体作者AU=Author
④团体作者——机构作者、书籍团体作者GP=Group Author
⑤出版物名称——期刊标题、书籍标题、丛书标题等SO=Source
⑥出版年PY
⑦著者所在机构地址（缩写）AD=Address；SA=Street Address；CI=City；PS=Province/State；CU=Country
⑧原文语种
⑨文献类型
⑩会议——会议标题、会议地点、会议日期、会议发起人
例：TI=(constipation) AND TS=(microflora ORmicrobiota OR microbiome) AND PY=(2013-2013)
6.检索结果导出：
①把搜索结果“保存至Endnote”，会保存为一个ciw格式的文件
②NoteExpress导入题录，当前过滤器选“Web of Science”，文件格式不支持？选“任意文件”。这样就可以导入了
7.影响因子：
影响因子＝该刊前两年发表论文在当年被引用的总次数÷某刊前两年发表的论文总数
NoteExpress
1.文献管理软件：
①NoteExpress：快速收集、有序存储、建立可检索的个人文献库；题录关联全文，随读随记；多角度归类、分析、筛选文献；随写随引，自动调整格式顺序
②EndNote：只有网络版，全文不能附在题录后，无法进行笔记管理，不能添加标签
③医学文献王
2.下载地址：
http://www.library.fudan.edu.cn→常用数据库→
http://www.library.fudan.edu.cn/main/info/3242.htm（选教育网镜像比较快）
3.使用方法：
①文件→新建数据库→“题录”右键→添加文件夹
·题录：文献的篇名、作者、关键词等简要信息
·笔记：用户对每篇文献所作的摘记，感想等
·检索：用户所有的检索指令
·组织：文献按作者、机构、关键词等建立索引
②题录的导入：
·批量导入题录：先在数据库中检索（如中国知网/PubMed）→（把所有的文章全选/一个一个选）→导出/Send to→以NoteExpress/Medline的格式保存
·在浏览器中检索：包括CNKI，维普，ProQuest，PubMed，SciDirect（Elsevier），springer等数据库→点击Ne标签来添加到题录【缺点：浏览器中没有Ne标签的文章不能导入】
·在线检索：先显示50条，逐渐再扩展，适合单篇文献查找，不适合大批量
·手工录入：新建题录的关键词、作者等如果不止一个，用回车键分隔
题录保存格式 | 过滤器 | |
CNKI，万方，维普 | NoteExpress | NoteExpress |
CBM | 文摘或详细格式 | CBM |
PubMed | Medline格式 | PubMed |
Web of Science | 其他参考文献格式 | Web of Science CCC（RIS） |
OVID: EBM, Medline | .txt 格式 | Medline OVID |
③题录与全文或其他文件关联：
·待关联题录右键→添加附件
·导入全文→待关联题录右键→在线更新→自动更新→选择在线数据库→查找更新→应用更新
·导入全文之后，软件会自动抽取标题（文件名乱七八糟都无所谓），但非pdf的文件（如中国知网的caj）需要手动把文件名改成文章标题
④下载全文：待下载题录右键→下载全文→选择全文数据库
⑤题录可标注“优先级”、设置标签、移动复制到其他文件夹（自动关联，统一修改）、查重（检索→查找重复题录）、多角度归类（左边“组织”里查找）、统计分析（文件夹右键→文件夹信息统计）
⑥表头的修改：鼠标至表头处右键→自定义，可调整表头内容、顺序
⑦笔记：可关联多个题录，一个题录可有多个笔记
⑧插入网页信息：在IE浏览器里面，右键→add URL to NoteExpress（先安装IE插件）
4.随写随引：
安装word插件：在NE中点“工具”→选项→扩展
①Word自动集成进去，点击“插入笔记”把笔记内容插入（不如复制再粘贴方便）
②点击“插入引文”或“检索”的方式生成引文
③“格式化”变成想要的格式，如GBT_7714-2005，也可以按杂志社的要求自定义样式（工具→样式→样式管理器→双击“编辑选中的样式”→左边“题录-模板”可修改字体斜体等）
④插入脚注：样式编辑器中点击左边“注释”→右边“生成注释列表”
⑤文章或题录改动后，点“同步”来更新
⑥“去除格式化”要点“清除域代码”，这样可以去除参考文献与引文的关联，但不能再同步
学位论文检索
1.ProQuestDissertations & Theses(PQDT)：
①美国ProQuest公司出版的欧美博硕士学位论文库，收录欧美1000余所大学的160多万篇学位论文，是目前广泛使用的学位论文数据库
②收录年代长，从1861年开始；更新快，每周更新；
③1997年以来的部分论文不但能看到文摘索引信息，还可以看到前24页的论文原文
④国内三个镜像站有全文（北大、交大、中信所）
⑤http://search.proquest.com/dissertations/index?accountid=10025
2.检索规则：
①逻辑算符：and (与)、or (或)、 not(非)
②截词符：? 替代一个字符，* 替代任意个字符
③词组短语：“”精确匹配
④字段限定的格式：字段代码（检索词）例： ti（nanocarrier）
AB（文摘） ADV（导师） AU（作者）
DG（授予学位） LA（语种） TI（标题）
SCH（学校） SU（主题） YR（年份）
3.检索结果导出：
导出为RIS格式，保存，在NoteExpress中导入题录时，选择RefMan（RIS）过滤器
4.中国大学学术论文：可通过万方或中国知网查找
电子书检索
1.常用数据库：
①读秀知识库
②超星数字图书馆
③CALIS中国高校教学参考书全文数据库
④方正阿帕比电子图书
⑤方正阿帕比工具书库
⑥MyiLibrary 电子书
⑦EBSCOe-book 电子书
⑧Springerlink电子书
⑨OVID电子书
2.可检索内容：
①寻找课题专业相关的图书：图书搜索（主题词，书名，分类浏览）
②寻找某本特定的图书：图书搜索（书名，作者）
③寻找原理、技术细节、方法等知识：图书搜索：目次（章节名）、全部字段搜索
④寻找概念定义、具体事件等知识点：知识搜索（全文）
Google搜索
1.检索规则：
①必须检索：无需and，两词间空格默认and匹配
②或者检索：OR必须大写
③排除检索：用-表示，但减号前必须留一空格
④短语检索：“”精确匹配
⑤对大小写不敏感
⑥检索位置限定：
·标题：allintitle
·网址：allinurl
·内文：allintext
·链接：allinanchor
例1：allinurl:nih搜索网址内含单词nih的网页
例2：查找2010年我国卫生部发布有关甲流的发病数，仅在moh.gov.cn（中华人民共和国卫生部网站）中搜索）
⑦文件类型限定：filetype:文件名后缀
支持13种非HTML文件的搜索：pdf，doc，rtf，ppt，xls，swf，ps等
例："nanocircuits" evaluation filetype:pdf
⑧禁用词：最常用的字符以及数字和单个字母等高频词，在检索时系统自动忽略不作检索。如果必须检索禁用词时可用“”，包括：of，is，by，i，的，为，http，.com，3等
例：“worldwari”
⑨高级检索：搜索框旁边的▽
优点：网页全文搜索，对于细小、专指度高的，文献较少的知识点查找较有效（指标、参数、表格等）
2.网站与网页：
①网页：浏览器显示的一个页面
②网站：一个机构/个人在网上提供浏览或服务的站点，一个网站包括多个页面/网页
搜索某一网站的内容：site:……
例：2010 甲型h1n1流感 发病数 site:moh.gov.cn
3.查找本专业网站：
①查找类似网站（Google）
例：查找与美国国立卫生研究院类似的网站，输入related:www.nih.gov
②查找链接网站（Google）
例：查找含美国国立卫生研究院链接的网站，输入link:www.nih.gov
③查找相关网站（ODP目录查询）：www.dmoz.com
4.搜索引擎与目录网站的比较：
①搜索引擎：目标明确、主题较狭窄、知识点、事实数据、文献、新闻等网页查找
②分类目录检索：目标模糊、主题较宽泛、查某专业重要网站
5.免费电子期刊查询：
①Free Medical Journals http://www.freemedicaljournals.com
②Directory of Open Access Journals http://www.doaj.org
③HighWire Press http://www.highwire.org
④学术机构网站
例：美国微生物协会（ASM http://www.asm.org），提供12种协会免费电子期刊浏览
检索策略
1.查准与查全：
①查准适用范围：了解某一理论、方法、设备、过程等具体的片断信息，以解决研究中的具体问题
②查准率：检出相关文献数量÷检出文献总数，可计算
③查全适用范围：立项查新、撰写综述、申请发明、申报成果以及鉴定科研成果时，需要全面地收集某主题范围的文献以鉴定其新颖性，具有普查追溯的特点
④查全率：检出相关文献数量÷数据库中全部相关文献数，检索者难以计算
2.提高查准率的方法：
①仅在数据库的某个或某几个子集中检索
②将检索词限定到标题、关键词字段
③变and为邻近算符：near, adj…，或副主题词
例：asthma and therapy 改为asthmaadj9 therapy (OVID)、asthma/therapy (PubMed)
④使用精确运算符" "，精确匹配
⑤限定主要主题词：加权（CBM）/restrictto major subject headings（PubMed）
3.提高查全率的方法：
①通过涵盖词形变化：
·查全单词的不同拼写方式，例：fibre OR fiber
·查全缩写与全称，例：MRI OR Magnetic Resonance Imaging
·使用截词符，例：transplant*
·查全错别字，例：肾综合征出血热 OR 肾综合症出血热
·查全所有格形式，例：tongue adj2 base（OVID）、tongue near/2 base (Web of Science)
②通过查全子概念：
·用OR连接子概念，例：pulmonaryblastoma OR pleuropulmonary blastoma
·变词组检索为邻近检索，例：acute pancreatitis改为acute NEAR/2 pancreatitis
·变邻近检索为AND检索
③通过改用上位概念检索词：
例：干扰素α-1b 改用 干扰素α
④通过调整检索字段：
相关度：篇名＞关键词＞主题词＞摘要＞全文
⑤通过查全数据库：多库、跨库、跨类
4.如何平衡查准率和查全率
①使用MeSH词表选词检索（若没有对应MeSH词的概念，使用上级概念对应的MeSH词），再结合自由词
②核心概念、前提概念限定篇名、关键词；次要概念、集合概念限定主题、文摘
例：篇名=脓毒症 AND 主题=治疗
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