【科研必备】Meta分析发表偏倚的作图与定量检测
Meta分析中发表偏倚的检测方法有不少，漏斗图、Begger法、Egger法、剪补法、失安全系数法、累积森林图、Deek法……事实上，会的全不如会的精。百度上搜到的几个帖子都用到一些中间变量，比如“_logOR”、“_logES”之类的，读了让人云里雾里。今天教给大家的是能够直接上手用的几招：漏斗图、Begger法、Egger法、Deek法。后三种之所以推荐，是因为不但能作图，还能够计算统计量和P值，可以定量说明研究不存在发表偏倚。Deek法专用于诊断试验。
需要说明的是，本文所用到的统计软件是Stata。
一. 数据准备
（一）已知OR/RR/HR及95%可信区间
OR/RR/HR通常不直接用于计算发表偏倚，而是先取log值。以OR为例，假设OR及其上下95%可信区间变量名分别为or、uci、lci，需键入命令：
gen logor = log(or)
gen selogor= (log (uci) – log (lci) ) / (1.96 * 2)【selogor即logOR的标准误】
（二）已知四格表数据
病例 | 对照 | 合计 | |
暴露 | a | b | a＋b |
非暴露 | c | d | c＋d |
合计 | a＋c | b＋d | N |
gen logor = log( (a/c) / (b/d))
gen selogor = sqrt ( (1/a) + (1/b) + (1/c) +(1/d) )
二. metafunnel命令绘制漏斗图
若没有事先安装metafunnel包，需安装一下：
ssc install metafunnel
绘制漏斗图命令如下：
metafunnel logor selogor
三. metabias6命令绘制Begger图与Egger图
若没有事先安装metabias6包，需下载：
http://fmwww.bc.edu/repec/bocode/m/metabias6.ado，再复制到Stata安装文件夹→ado→plus→m即可。
metabias6 logor selogor【Egger法和Begger法得到检验统计量，不生成图】
【P=0.210是Begger法P值，P=0.276则是Egger法所需P值】
metabias6 logor selogor, graph (egg)【绘制Egger法漏斗图】
metabias6 logor selogor, graph (begg)【绘制Begger法漏斗图】
四.诊断试验绘制Deek图
需安装midas包，tp为真阳性，fp为假阳性，fn为假阴性，tn为真阴性。真阳性＝实验组×灵敏度；假阳性＝对照组－真阴性；假阴性＝实验组－真阳性；真阴性＝对照组×特异度。
midas tp fp fn tn, pubb【Deek法，既得到检验统计量，又得到图】
【P=0.072则是Deek法所需P值】
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