查看原文
其他

和组学君一起来“尝鲜”—Nanopore Top News!

组学君 Nextomics 2019-12-12


相信长期关注未来组公众号的朋友对Oxford Nanopore测序技术已经不再陌生,11月30日-12月1日,Nanopore技术研讨会在美国纽约举行,组学君挑选一些精彩部分(仅基因组学相关),看看有没有哪些能超乎你想象?


8条ultra-long reads组装一个完整的基因组(E. coli),组装耗时1.5S


仅花了4天的时间,完成了拟南芥从样本提取、建库上机到结构变异(SV)分析的全过程




更长的测序读长,更快的basecalling和组装速度,更准确地phasing,Oxford Nanopore测序技术让各方向的基因组学计划有了更经济有效的实现手段。


植物育种

脊椎动物基因组计划

地球微生物组计划


可进行多种碱基修饰识别,随着算法的升级,准确度和识别范围在不断提升


可直接对RNA进行测序,并且比反转成cDNA后再测序,有更高的读长和准确度


一条RNA直接测序的read可能就是一条转录本,无需组装



会议上还展示两款新型的Nanopore测序仪


1. 可使用手机供电的SmidgION

看碱基序列在手机上实时basecalling是一种什么感觉?

2. 超高通量的PromethION

单个flowcell 产出60G


未来组已提供Ultra-long reads和RNA直接测序服务,详情请咨询当地科技顾问或拨打组学君热线400-027-1221。



更多资讯请移步nanopore官网

https://nanoporetech.com/about-us/news/nanopore-community-meeting-2017-day-1-write

https://nanoporetech.com/about-us/news/nanopore-community-meeting-day-2-writeup-0


图片来源于网络|侵删



武汉未来组生物科技有限公司(Nextomics Biosciences)成立于2011年8月8日,总部位于武汉光谷生物城,目前在北京生命科学园和美国纽约设立有分支机构,是世界领先三代测序基因组中心。

未来组通过三代测序生物信息学工具和流程的开发,解决了复杂基因组组装、微生物完成图组装、全长转录组分析、人类基因组变异检测等领域的技术瓶颈,推动了基因组学研究的升级换代,目前已经完成数百个三代测序科研项目,发表了多篇三代测序的科学文献。因为专注于三代测序技术开发和应用推广,未来组已成为三代测序技术应用的第一品牌。





    您可能也对以下帖子感兴趣

    文章有问题?点此查看未经处理的缓存