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未来组Direct RNA测序合作项目文章online啦!

5’-Cap捕获的方法富集全长RNA转录本,5’-生物素化的RNA转录本通过耦合的链霉亲和素免疫磁珠捕获。通过Nanopore对RNA直接进行测序(Fig.1)。
2019年4月17日
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RNA修饰?APA分析?isoform分配?Nanopore direct RNA一招搞定!

RNA测序产生的长读序列应该更容易地分配给亲本的等位基因,因为遇到杂合子的SNP的可能性更大。研究者利用HapCUT2将至少包含两个杂合子变异体的reads分配给他们的亲本等位基因。
2018年12月4日
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有了OPERA-MS,人体肠道微生物不用愁!

完美的测序技术诞生了吗?并没有,短读长测序技术天然自带短片段缺陷,长读长测序技术也有原始错误率、通量等不完美的一面。这些都对宏基因组的研究造成了一定的障碍,而来自新加坡基因组所的Denis
2018年11月2日
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研究全长转录组?建议先看看这几篇文献

2b),说明APA现象在高粱转录组中是广泛分布的。研究中还确定了超过2,100个未注释过的新基因以及数千个3’非翻译区不同的转录本,研究者认为大部分新基因为长链非编码转录本。
2018年1月19日
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Nature methods丨基于Nanopore的direct RNA测序方法测评,你要不要来试试?

RNA测序能在读取RNA碱基序列的同时获得碱基修饰信息。Fig.8以两种常见的碱基修饰m6A和5-mc为例,展示了经过修饰的碱基与未经过修饰的碱基,在经过测序纳米孔时引起的电流变化有什么区别。
2018年1月17日
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来自Nanopore测序的2个线虫基因组,解析复杂的染色体重排

测序技术对秀丽隐杆线虫的两个品型(野生型;带有两个复杂染色体重排区域的突变型)进行了全基因组测序,完善了秀丽隐杆线虫参考基因组,研究突变型中复杂的重排机制。2017年12月,文章发表于Genome
2018年1月10日
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Oxford Nanopore丨人转录组direct RNA测序数据首发

Biosciences)成立于2011年8月8日,总部位于武汉光谷生物城,目前在北京生命科学园和美国纽约设立有分支机构,是世界领先三代测序基因组中心。
2017年12月8日
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和组学君一起来“尝鲜”—Nanopore Top News!

Nanopore测序技术已经不再陌生,11月30日-12月1日,Nanopore技术研讨会在美国纽约举行,组学君挑选一些精彩部分(仅基因组学相关),看看有没有哪些能超乎你想象?
2017年12月6日
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基于Nanopore测序的结构变异分析【染色体碎裂病例解析】

Mb亚显微水平的基因组结构变异一直受限于测序技术的短读长,无法得到准确地解析。进入到三代测序时代后,测序读长由几百bp上升到数十Kb以上,终于为基因组结构变异检测分析提供了更好的选择。
2017年11月24日
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Nanopore测序组装人类基因组初探

MinION开始试用的初期,5家单位联合产出了这些测序数据,下机reads的准确度约在80%-90%之间,在约35×的数据量情况下,contig
2017年11月17日
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【聚划算】未来组双十一送Nanopore测序仪

距未来组Nanopore数据惊艳首发已整整2个月了,在这两个月里,我们的测序平台已经完全稳定,组装分析流程也已搭建调试完毕,持续优化中;我们还完成了数个动植物基因组的测序和组装,指标提升明显。
2017年11月10日
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Nanopore测序可得1Mb的超长读长?!

当然,目前一条read就可测得一株细菌基因组信息的脑洞还没法立刻成为现实,但已有研究者通过优化样本提取、建库和上机条件后,可通过nanopore测序数据中的一条read覆盖全基因组序列的1/6。
2017年10月25日
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Nanopore测序技术已进军Gb级别的番茄基因组领域,你还等什么?

2)。另外,经片段筛分后构建的文库每个flowcell产出20Kb以上的读长占15%,而未筛分片段的文库产出20Kb以上的读长占3%,说明protocol的优化利于后续读长产出。
2017年10月18日
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中国市场喜迎牛津纳米孔技术

牛津纳米孔商务发展与技术支持专员已经来到中国,随时准备为中国客户提供专业的服务。ONT即将于今年在上海设立中国办公室。与此同时,其认证经销商,上海纳昂达生物科技有限公司(Shanghai
2017年10月13日
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欢迎来到Oxford Nanopore测序技术新世界

Protein:为解旋酶,在构建文库时,马达蛋白会随引导接头一同加在DNA分子上,在测序过程中,马达蛋白会对双链DNA解压和解链,使得单链DNA以一定速度经过纳米孔。
2017年10月13日
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看Nanopore超长读长如何为高质量基因组组装添砖加瓦

序列比对率为~93%,2D比对率90-95%,其中,3号染色体上有~3M的duplication(chrIII:10,062,096-11,973,739)(Figure
2017年9月29日
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未来已来,Oxford Nanopore全球最大测序中心落户中国

Sequel测序仪,搭建了BioNano平台,在武汉分析中心还搭建了Phoenix超算平台,对现有的分析流程进行了优化,积累了大量复杂基因组项目分析经验,已成为世界领先的三代测序基因组中心。
2017年9月22日
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Hello 未来!Oxford Nanopore测序数据惊艳首发!

武汉未来组(NextOmics)作为国内三代测序技术应用的开拓者,自2011年起一直致力于将领先的技术提供给关注前沿科学的合作伙伴。我们是中国首家PacBio测序服务供应商,是亚太区首批PacBio
2017年9月15日
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未来组项目文章 | 又发了一篇全长转录组文章,还是复杂的异源四倍体棉花

(2)通过与参考序列比对,更新了18,008个基因,确定了222个融合基因,在新的转录本中确定了2,447个LncRNA,与LncRNA_V1比较,确定了365个新的LncRNA(Figure
2017年9月12日