面对上万篇问题论文,期刊35年来沉默不语
大约有20%~36%的实验用细胞系被污染或者混淆——来自1182个期刊的近5800篇文章把 HeLa 细胞混淆为 HEp-2 细胞,来自271个期刊的1336篇文章把 HeLa 细胞混淆为 INT 407 细胞。截至2015年,这7000多篇存在错误的文章共被引用了大约214000次。
作者 Ivan Oransky, Adam Marcus
翻译 张畅
审校 赵维杰
如果你的房子里到处是白蚁,你却把它当做一个没有害虫的房子卖给下家,那你铁定要吃官司;但当同样糟糕的论文被当成百分百可靠的研究推荐出去时,期刊却并不会被追究责任。
问题是这样的:最近的评估显示,大约有20%~36%的实验用细胞系被污染或者混淆——猪、大鼠或者小鼠细胞被当成人源细胞,或者实验所需的人源细胞被未知的细胞污染。但是,尽管已经对这种情况知情至少35年之久,绝大多数的期刊却很少会拒绝受此影响的论文。
其中一个问题细胞系就是 HeLa。这种宫颈癌细胞于20世纪50年代初从 Henrietta Lacks 女士体内分离培养成功,并以其名字命名,现在广泛应用于实验室中。然而,已经被证实的是,这种细胞可以污染它所接触的各种其他细胞——特别是 HEp-2 和 INT 407 这两个细胞系,研究者已经确认,HeLa 细胞已经污染了这两个细胞系。认为自己在使用 HEp-2 和 INT 407 的研究者们实际上使用的很可能是 HeLa 细胞。
科罗拉多大学的遗传学家 Christopher Korch 对这一问题进行了研究。根据他的调查,有来自1182个期刊的近5800篇文章把 HeLa 细胞混淆为 HEp-2 细胞,另外来自271个期刊的1336篇文章把 HeLa 细胞混淆为 INT 407 细胞。截至2015年,这7000多篇存在错误的文章共被引用了大约214000次。
而这仅仅是两个细胞系而已。事实上,总共有超过400个细胞系缺少来源证据,或者已经在实验室传代过程中与人或其他动物来源的细胞发生交叉污染。能够被选为实验材料的细胞大多繁殖能力强、可培养时间长,所以如果细胞沾在了研究者的手套上,超强的生命力使得这些细胞可以遍布整个实验室。
“出乎我们意料,细胞系之间非常容易发生污染,”国际细胞系认证委员会(ICLAC)主席 Amanda Capes-Davis 在一篇受邀为 Retraction Watch 网站撰写的文章中写道,“细胞培养的初始阶段,形成细胞系前通常会经历一个缓慢增长或无增长期。在这一阶段,如果有哪怕一个其他来源的细胞介入,外来细胞都可能在生长中超过原有细胞,而且很难被发现。”
Korch 表示,尽管数据还存在争议,这些被混淆的细胞可能卷入了涉及亿万美元投资的研究。
细胞系并不是科研中存在混淆问题的唯一领域。有证据显示,抗体(由免疫系统产生的针对入侵者的蛋白,由少数几个供应商供应)也存在严重的确认缺失。一些专家将会在2016年9月于加利福尼亚举行会谈,商议这一问题的解决方案。
一些期刊(例如 Nature 及其子刊)现在会要求作者们提供细胞系认证声明。但是问题的关键是,编辑们并没有验证这些声明的可靠性。而且无论如何,这项措施只能预防未发生的混淆,却对使用了错误细胞的既往研究无能为力。
这项工作任重而道远,或者几乎是不可为之。但这并不表示期刊可以高挂“就这样了”的牌子然后听天由命。2014年的一项研究显示,“尽管细胞混淆的问题已经影响了无数已经发表的文章,但只有少数几篇文章因为细胞混淆问题而撤回。”期刊至少应该对可能存在细胞混淆的文章附加说明——用出版业的话说叫“expressions of concern”。而确定有问题的文章则应该被撤回。
尽管情况不甚乐观,但科学工作者们对问题的认识却很理性。2015年12月一份来自 Retraction Watch 网站的调查结果显示,55%的人认为期刊应该更正那些有细胞污染或混淆问题的文章,40%的人则认为撤回才是正确的办法。换言之,只有5%的人认为可以什么都不做。
然而,目前大多数期刊的做法恰恰就是:什么都不做。
原文链接:
https://www.statnews.com/2016/07/21/studies-wrong-cells/
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