1区知名期刊强推“不拒稿”改革，引发编辑集体辞职抗议 | 科研圈日报
· 学术出版
1 区知名期刊 eLife 强推“不拒稿”改革，引发编辑集体辞职抗议
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2022 年 10 月，知名生命科学期刊 eLife 对其发表流程进行了大胆的改革：从 2023 年 1 月 31 日起，该刊将发表每一篇提交同行评议的论文，不论审稿意见如何，都将以“评审预印本”（reviewed preprint）的形式发表。主编 Michael Eisen 表示，这“放弃了传统期刊的守门人角色”，并“基于发表内容而不是在哪里发表，来改良对学者的评价”。
这一“不拒稿”的转变引发了巨大争议。一些科学家和 eLife 的编辑认为这会削弱期刊的品牌和声誉，对该新规的冒进极为不满。据《自然》新闻（Nature News）消息，3 月 9 日，包括该杂志的前主编、2013 年诺奖得主 Randy Schekman 在内的 29 位 eLife 编辑写信给期刊出版方，要求立即撤换主编 Eisen。抗议方表示，目前已有一位 eLife 副主编辞职，还有大量审稿人和资深编辑“随时准备辞职”。此外，早在今年 1 月，就有 30 名编辑私下向 Eisen 去信，称一旦新规定实施就会辞职。在强大阻力下，期刊推迟了完全转向新规定的日程。
另一方面，eLife 改革的支持者们看到了防止同行评审成为声望收集器的好处。eLife 目前仍有 4 位副主编在职，一些编辑已经完全接受了这个新系统，认为“这是未来，是科学的发展方向”。但任何变革性的改变都必须以谨慎的方式进行，并得到社区的支持。一位支持“不拒稿”的副主编表示，正和同事一起试图说服主编 Eisen 放慢脚步，避免大规模辞职，并建立标准来评估这些变化对科学家工作的影响。（Nature News）
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· 古人类遗传学
中科院付巧妹团队填补青藏高原上 5100 年人类遗传史空白
近日，来自中国科学院古脊椎动物与古人类研究所（IVPP）的付巧妹团队，通过对青藏高原上 29 个考古遗址的 89 个古人类的基因组进行测序，其广泛的时空调查将人类遗传史追溯至 5100 年前并填补了该空白，这也是迄今对青藏高原最大规模的古代遗传学研究。相关论文 3 月 17 日发表于《科学进展》(Science Advances)。
青藏高原是有人类定居的最恶劣环境之一，覆盖了约 250 万平方公里区域，存在约 700 多万居民。尽管高原考古资源丰富，但是目前对于高原上的人类起源研究并不完整，对古人类 DNA 的采样也仅限于喜马拉雅山脉西南高原附近。该研究发现，生活在高原上的古代人类具有统一的起源，即东亚北部的人群，该人群与一个差异性极大但尚未被采样的人群混合在一起。付巧妹对此表示，“这种混合模式早在 5100 年前的种群中就已经存在，远比小麦和大麦这类驯化作物来到高原的时间更早”。研究团队进一步发现了 2500 年前的不同遗传模式，表明当时存在三个不同的藏族种群分别占据了高原的东北部，南部/中部和南部/西南部地区，而先前采样的高原种群仅属于后者。祖先人口的多样化使得三个区域群体显示出独特的历史模式，在距今 2500 年后出现合并趋势。该研究使得人们对于亚洲人类历史有了进一步了解，同时展示了使用考古证据的文化互动以外的考古研究新思路。（中国科学院）
· 人工智能
大型语言模型也可预测蛋白质结构：速度是 AphaFold2 的 6 倍，准确性有待提高
根据 Ars Technica 报道，近日 Meta 公司的一个团队训练了一个可预测蛋白质结构的大型语言模型（LLM），该模型被用来统计蛋白质中氨基酸的出现次数，并可根据其所学内容提取蛋白质结构信息。
LLM 最初是为语言处理任务而开发的，但它们还有执行其他任务的潜力。在这项新研究中，它的任务是获取组成蛋白质的线性氨基酸串，并用其来预测蛋白质成熟时这些氨基酸的三维（3D）结构，这对于理解蛋白质的功能至关重要。研究人员向模型输入了大量的蛋白质样本，并随机拿掉了其中数个氨基酸，然后要求模型预测空位中应该存在的氨基酸是什么。在这种训练过程中，模型发展出了使用氨基酸频率的统计数据和周围蛋白质背景等信息进行预测的能力。为了将 LLM 的"注意力模式"转向蛋白质的 3D 结构，研究人员将实验确定的蛋白质结构和其他人工智能预测的蛋白质结构用于训练，最终得到了一个名为 ESMFold 的新模型。该模型参数达到 150 亿，能够在输入一串原始氨基酸序列后，输出蛋白质的 3D 结构。研究者已利用该模型预测了超过 6.17 亿个宏基因组蛋白序列，其中高置信度序列超过 2.25 亿个。尽管该模型的准确度相较谷歌的 AlphaFold2 仍有差距，但速度可达前者的 6 倍。相关论文 3 月 16 日发表于《科学》（Science）。（Ars Technica）
· 月球探测
劳斯莱斯获资为英国月球基地开发微型核反应堆
据 Space.com 消息，英国航天局决定继续为劳斯莱斯（Rolls-Royce）的微型反应堆项目提供 290 万英镑的资助，对英国月球模块化核反应堆进行初步演示。据悉，英国航天局已在 2022 年向劳斯莱斯提供了一项 24.9 万英镑的资助，该公司计划在 2029 年之前将反应堆送往月球。
与其他电力系统相比，核微型反应堆相对较小且重量更轻，可以实现持续供电而不受位置、可用阳光和其它环境条件的影响。劳斯莱斯的后续研究将集中在微型反应堆的三个关键方面，包括用于产生热量的燃料、传热方法以及将热量转化为电能的技术。并解决如何装备微型反应堆以在月球环境中运行的问题。劳斯莱斯公司后续将与英国牛津大学、班戈大学、布莱顿大学、谢菲尔德大学先进制造业研究中心（AMRC）等机构建立合作。(Space.com, Rolls-Royce)
编写：徐慧琳、綦懿、郭世发、张鑫洁
编辑：魏潇
封面图来源：Pixabay
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