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【数据对比】安捷伦预制胶电泳4200 VS 芯片式电泳2100,一致性体现在哪里?(RNA篇)

测序中国 2024-01-08

安捷伦4200 TapeStation系统 VS 2100生物分析仪,性能全面升级!推文中,已详细介绍了安捷伦预制胶电泳4200与经典的芯片式电泳2100相比,在自动化程度、防污染能力、灵活性、DNA完整性指标等几个方面的升级情况。文章一经发布,就受到许多用户的评论及转发,尤其是先后使用过2100和4200平台的用户,更是对上述特点深有体会。但仍有一些2100平台的用户好奇,4200做了如此多的升级,在数据一致性上是否会与2100有显著性差异?

本期文章就来头对头比较一下两个平台的数据一致性表现。


对比1

RNA分析试剂

在RNA分析方面,两个平台都有用于ng和pg级别样本的专用试剂:4200对应的试剂名称是RNA ScreenTape试剂和高敏RNA ScreenTape试剂;2100对应的试剂名称是RNA 6000 Nano试剂和RNA 6000 Pico试剂。
通过官方给出的参数对比,对于ng级别RNA样本的分析试剂(简称标准试剂),可以看到在灵敏度、定量范围、定量准确性、定量精确性层面,两者完全一致对于pg级别RNA样本的分析试剂(简称高敏试剂),可以看到在定量准确性层面,两者完全一致在灵敏度和定量精确性层面,4200可以分析到100pg/ul的RNA,定量精确性是15%CV,2100可以分析到50pg/ul的RNA,定量精确性是20%CV,范围大致相同
表1. 4200和2100用于ng和pg级别RNA样本的专用试剂详细参数对比

结论1:4200和2100的RNA分析试剂参数一致性好。



对比2

RINe值与RIN值

由于RIN值的专利问题,4200出具的RNA完整性数值称为“RINe”(RIN equivalent,RIN当量)。通过对不同的真核生物和原核生物样本的RINe和RIN进行相关性分析,标准试剂R2=0.9969,高敏试剂R2=0.9821,均具有很好的一致性

图1. 4200和2100用于RNA分析的标准试剂和高敏试剂出具的RINe和RIN一致性对比

结论2:RINe值与RIN值一致性好。



对比3

RNA定量

4200与2100的标准试剂RNA定量范围都是25ng/uL~500ng/uL,为验证两者的定量一致性,实验人员对大鼠RNA样本进行了梯度稀释,使用RNA标准试剂检测了不同浓度范围的样本的浓度值,并对两个平台的浓度值作相关性分析。结果显示,两者的相关性R2=0.9985,具有很好的一致性

图2. 4200 和 2100 RNA定量一致性对比

结论3:RNA定量一致性好。


上述内容从官方理论参数、定性实验结果、定量实验结果方面详细对比了4200和2100进行RNA分析的数据表现,可以得出结论:4200和2100在RNA分析上具有很好的一致性。


延续经典,传承品质,不断变化的是基于用户反馈进行的更新迭代、体验升级,不变的是始终如一的高性能品质,下期将为大家展示4200与2100在DNA分析上的一致性表现。


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