线下巡讲|伯豪生物单细胞生信交流会
单细胞测序技术作为当今的前沿技术之一,凭借自身技术优势和成熟商业化逐渐受到广大科研老师的青睐,几乎已经成为了每个科研课题组的必备品。单细胞测序往往会获得的海量数据,如何理解并解析单细胞的数据,尤其是如何能充分挖掘单细胞的亚群基因信息,成为很多科研团队迫在眉睫的问题。
伯豪生物一直致力于高通量领域的科研服务,把单细胞测序作为优势服务重点进行了研发和创新,尤其是在数据分析方面,伯豪生物专业科研团队与全国各地的多个课题组一起汇总最新的单细胞文章,并摸索算法和分析逻辑,在经过了几十场的线下线上培训后,形成了一系列的单细胞分析思路。为了让更多老师可以切实了解到单细胞分析的细微逻辑思路,伯豪生物单细胞团队决定汇总分析思路,开展线下交流会。
全方位解析单细胞,时间地点,会议模式,任您选择!
01
模式一
半天精华解析交流会,
内容包含:
1. 单细胞测序流程介绍和悬液制备的实验细节、上机质控标准判断、10X Genomics和BD的捕获原理,以及自主制备单细胞悬液经常遇到的问题和解决办法。
2. 单细胞基因表达矩阵展示,基础质控和数据过滤标准以及Seurat聚类原理、分群图片基础介绍,亚群注释原理以及如何进行个性化的注释,从亚群注释的角度来探析单细胞Marker与流式Marker的区别和联系。
3. 单细胞简化矩阵的原理以及如何通过共表达来深入挖掘特定亚群的基因表达规律。
4. 单细胞数据分析的逻辑,包括如何解读GSEA、拟时序、细胞间通讯、Scenic、Velocity的数据,以及如何从基础数据分析开始逐步拓展到深入挖掘。
5. 单细胞最新技术应用介绍,包括单细胞表面蛋白测序、单个细胞核的测序、空间转录组测序。
02
模式二:全天全面实操交流会,
内容包括:
1. 精华解析交流会的所有内容,数据分析素材交流拷贝。
2. 解读单细胞的数据基础分析流程,附赠部分分析代码,重点是解析单细胞基础分析报告,以及部分个性化实操,内容包括Seurat聚类实操,亚群Marker基因作图、自主利用公共网站做Marker基因的富集分析,附赠亚群比例的聚类热图代码。
3. Loupe实操,现场演示10x 公司的单细胞软件Loupe的多种个性化分析方法,根据基因信息来个性化提取细胞信息。
4. 高级分析内容实操,包括解读GSEA、拟时序的数据分析报告、简化矩阵、细胞间通讯、InferCNV、Scenic、Velocity的数据。
5. 重点梳理几篇CNS级别的单细胞分析思路。
参会方式:
扫码预约报名,早预约早安排
全国巡讲,排期紧张,抢位快快快!
会议说明:
● 全国巡讲,按报名顺序排期,早预约早安排;
● 半天精华解析交流会人数不限,全天全面实操交流会每场人数建议50人左右。
● 全天全面实操交流会参会建议自带笔记本电脑。
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