技术服务|Olink超灵敏低丰度蛋白组助力精准医学(一)
随着精准医疗计划的提出,研究人员在寻求个性化诊断、预后和药物策略的最佳方法中主要面临疾病机理、药物靶点识别、药物作用机制、相关生物标志物以及疾病分型等多方面的难题。蛋白质几乎是所有药物的作用靶点,越来越多地制药公司转向从蛋白质层面发现解决方案,以获得更好、更精确地理解疾病机制、药物机制以及疗效和安全性的替代标志物。为了使蛋白组学在临床与制药中发挥其潜力,对蛋白质检测平台的重现性,验证性、敏感性、高通量及特异性提出了更高的要求。为此,伯豪生物引进瑞典Olink Proteomics AB公司的Olink平台,提供更高通量、更低样本量、高重现性、验证性和敏感性的蛋白标志物研究方案。
图1 蛋白质组学在加速医药发展中的作用
Olink介绍
Olink是一家源自于瑞典乌普萨拉的创新蛋白质组检测方案公司,依托其核心蛋白质检测技术——临近延伸分析(Proximity Extension Assay,PEA)实现对极微量样本中蛋白质的高通量、高特异性、高灵敏度及动态范围的检测。为理解复杂的、实时的人体生物学,助力精准医学、转化医学、药物研发等提供创新的蛋白组检测方案。
Olink检测原理
图2 临近延伸分析(Proximity Extension Assay,PEA)原理
Olink依赖于其蛋白检测专利技术——PEA实现对样本中蛋白质的高通量检测。基本原理如上图所示:(A) 用分别偶联DNA寡核苷酸标记(DNA barcode)的成对抗体结合靶蛋白;(B) 结合到同一蛋白上的抗体在空间上相互接近,其偶联的DNA寡核苷酸链互补配对,被DNA聚合酶识别结合;(C) DNA barcode通过PCR扩增;(D) 采用qPCR或二代测序对每个DNA barcode的数量进行定量。
Olink技术优势
图3 Olink与其他蛋白组平台技术比较
Olink基于PEA检测技术,每个靶蛋白都由双抗体识别并偶联特异性的互补的DNA barcode,经qPCR检测;该方法使得检测的特异性、灵敏度大大提高,检测动态范围实现10个数量级的跨越(fg~μg),目前一次反应最多可检测3000多个蛋白,与MSD、Luminex平台相比,其检测通量显著提升。同时,样本量仅需1~3 μl,实现极微量样本的蛋白组检测。
Olink蛋白质标志物一体化研究方案
图4. Olink蛋白质标志物一体化研究方案
Olink提供蛋白标志物一体化研究方案,可通过Olink Explore/Target系列实现对样本中蛋白质的高通量筛选,发现疾病相关标志物或药物靶点。接着,定制Olink Focus custome panel特异性的对前期发现的标志物进行相对定量/绝对定量验证。
目前,Olink Explore 1536可覆盖人心血管代谢类、炎症类、神经类、肿瘤类的检测,或选择Olink Explore 348针对性的检测某一种方向。今年6月,Olink发布了Olink Explore 3072将验证的蛋白标志物库规模扩大一倍,涵盖所有主要生物通路。此外,每个Olink Target 96试剂盒能够检测92种不同的蛋白质,对某一种特定的疾病类型或某一生物学过程提供更具针对性的检测方案。Olink Target 48能对45个蛋白质进行绝对定量检测。
图5. Olink Target 96 panels检测方向介绍
关于伯豪生物
上海伯豪生物技术有限公司(www.shbio.com)是生物芯片上海国家工程研究中心的有机组成部分,专注于提供领先的生物医药和疾病诊断技术创新、产品及优质服务。
经过十多年的发展,公司建立了系统的多组学技术平台、质量控制和营销管理体系,从基因芯片到新一代测序、单细胞测序、空间转录组测序,紧跟技术的发展,公司不断引进前沿技术和方法,并持续进行技术创新和配套产品的研发。为国内外客户提供常规多组学和单细胞多组学的技术服务和技术支撑。公司拥有39项发明专利和软件著作 权。已经成功研发10余种试剂产品,进入市场销售。协助客户发表SCI论文超过2000余篇,平均影响因子(Impact Fcator, IF)超过5。公司先后获得国家基因检测技术应用示范中心、浦东新区企业研发机构、院士专家工作站、上海市专业技术服务平台、上海市服务外包公共平台、上海名牌、上海科技小巨人等资质认证。
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