心脑血管疾病|最新甲基化研究思路分享
心脑血管疾病是心脏血管和脑血管疾病的统称，泛指由于高脂血症、血液黏稠、动脉粥样硬化、高血压等所导致的心脏、大脑及全身组织发生的缺血性或出血性疾病。心脑血管疾病是一种严重威胁人类健康的常见病，具有高患病率、高致残率和高死亡率的特点，即使应用目前最先进、完善的治疗手段，仍可有50%以上的脑血管意外幸存者生活不能完全自理，我国每年有260万人死于心血管疾病，我国每年新发中风患者200万，其中2/3致死或致残，居各种死因首位。
小编基于DNA甲基化和RNA甲基化两个方向，找了心脑血管疾病方向的高分文章，比如常见的冠心病，脑血管病，动脉粥样等相关疾病。
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标题：表观遗传年龄速度反映长期的心血管健康
时间：2021.8
单位：美国西北大学
期刊：Circ Res. 17.364/Q1
平台：450K
doi：10.1186/s13148-021-01113-6.
摘要：表观遗传衰老是一种新的生物年龄测量方法，反映了与实际年龄无关的暴露和疾病风险。它可以作为一个有用的心血管健康(CVH)和/或心血管疾病(CVD)风险的生物标志物，用于早期发现或预防。目的:GrimAA是一种表观遗传老化测量值，由GrimAge按年龄回归的残差计算得出。研究GrimAge加速(GrimAA)与两次重复的CVH测量值之间的关系。作者使用450K DNA甲基化数据，从两个前瞻性队列计算GrimAA和模型与CVH的关联。作者的数据表明，更快的GrimAA与年轻时CVH的丢失有关。表观遗传年龄可能是CVD风险的一个有用的生物标志物，并为表观遗传机制在与年龄相关的CVD损失和CVD之间的作用提供生物学视角。
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标题：在纵向瑞典双胞胎中研究中心血管疾病的表观遗传病因学
时间：2021.7
单位：瑞典卡罗琳斯卡医学院
期刊：Clin Epigenetics. 6.55
平台：450K
doi：10.1186/s13148-021-01113-6.
摘要:DNA甲基化的研究有可能发现心血管疾病(CVD)风险的机制。然而，DNA甲基化在CVD病因学中的作用尚不清楚。作者对535名瑞典双胞胎的纵向样本进行了CVD的表观基因组全关联研究(EWAS)。在EWAS分析中，分别选择bonferroni校正后显著性水平的CpGs或P值最低的前20个CpGs进一步分析。作者进一步应用了二元自回归潜轨迹模型(ALT-SR)来评估这些CpGs位点的甲基化状态与心脏代谢特征(血脂、血压和体重指数)之间的交叉滞后效应。此外，通过中介分析来评估交叉滞后效应是否对心血管疾病有因果影响。在EWAS模型中，我们选择的CpG均未达到bonferroni校正的显著性水平。ALT-SR模型显示，DNA甲基化水平更有可能预测随后的心脏代谢性状水平。最后，研究结果证明了由心脏代谢特征介导的DNA甲基化对CVD的间接影响。DNA甲基化与心脏代谢特征和CVD之间存在定向关联，而不是相反，这突出了表观遗传学在CVD发展中的作用。
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标题：HDAC1和HDAC2通过抑制GATA6启动子的甲基化来调控内皮细胞VCAM-1的表达和动脉粥样硬化发生
时间：2021.5
单位：南京医科大学
期刊：Theranostics. 11.553
平台：MSP
doi：10.7150/thno.55878.
摘要：血管细胞粘附分子(VCAM)-1在活化的动脉内皮细胞(EC)表面的表达增加对动脉粥样硬化起重要作用，这可能在一定程度上受到表观遗传机制的调控。本研究研究了临床可用的组蛋白去乙酰化酶1和2 (HDAC1/2)抑制剂药物Romidepsin是否以及如何表观遗传学地调节VCAM-1的表达来抑制动脉粥样硬化。方法:采用roidepsin或hdac1 /2靶向siRNA转染人主动脉EC (HAEC)，分析VCAM-1的表达情况。甲基化特异性PCR检测GATA6启动子区域的甲基化。用染色质免疫沉淀法检测STAT3对GATA6启动子的富集。构建Lys685Arg突变阻断STAT3乙酰化。在高脂饮食喂养的Apoe-/-小鼠中评估Romidepsin对动脉粥样硬化的潜在治疗效果。结果:Romidepsin通过同时抑制HDAC1/2，显著降低tnf-α诱导的HAEC表面VCAM-1表达和单核细胞粘附。VCAM-1的下调可归因于转录因子GATA6的表达减少。Romidepsin增强了STAT3的乙酰化及其与DNA甲基转移酶1 (DNMT1)的结合，导致GATA6启动子CpG丰富区+140/+255的高甲基化。阻断STAT3在Lys685位点的乙酰化可以阻断DNMT1-STAT3的相互作用，降低GATA6启动子的甲基化，并逆转HDAC1/2抑制对GATA6和VCAM-1表达的抑制作用。最后，腹腔注射Romidepsin可减少Apoe-/-小鼠饮食诱导的动脉粥样硬化病变的发展，并降低主动脉GATA6/VCAM-1的表达。结论:HDAC1/2通过抑制STAT3乙酰化依赖的GATA6启动子甲基化促进VCAM-1表达和动脉粥样硬化。这些发现可能为HDAC1 /2靶向治疗动脉粥样硬化性心脏病提供了理论基础。
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标题：RNA m6A修饰在心血管疾病中的作用
时间：2021.5
单位：吉林大学
期刊：Front Cardiovasc Med. 6.051
doi：10.3389/fcvm.2021.659628.
摘要：尽管治疗方法得到了改进，许多危险因素也得到了确认，但心血管疾病(CVD)仍然是世界范围内死亡和残疾的主要原因。m6A修饰是RNA中最常见、最丰富、最保守的内部修饰，在CVD的发生发展中起重要作用。许多研究表明，mRNA m6A修饰异常参与了CVD的发生发展。此外，非编码RNA(non-coding RNAs, ncRNAs)在包括CVD在内的许多疾病中发挥转录后调控作用。虽然也发现ncRNA被m6A修饰，但目前关于CVD中ncRNA的m6A修饰的研究较少。在这篇综述中，作者总结了m6A修饰在编码RNA和ncRNA以及它们在CVD中的调控作用方面的最新进展。
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