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一区顶刊文章聚焦细胞衰老

CC 生信人 2022-06-21
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文章摘要

本研究旨在探讨成纤维细胞样滑膜细胞(FLS)及其衰老在骨关节炎(OA)进展中的作用和调节机制。在患者和小鼠模型中,随着OA的进展,衰老的FLSs显著增加。作者确定OA-FLS中发生自噬受损,导致衰老相关分泌表型(SASP)上调,自噬的重建通过抑制GATA4逆转衰老表型。此外,作者首次观察到过度m6A修饰对OA-FLS中的自噬产生负性调节。该研究揭示了FLS衰老在OA进展中的重要作用。在实验动物模型中,靶向METTL3抑制可以缓解FLS的衰老,限制OA的发展,为OA治疗提供了一种潜在的策略。
嗨,早上好呀,相信经过持续关注,大家已经对细胞衰老有所了解。今天给大家分享一篇2022年1月份发表在风湿病Top级别期刊的文章,Ann Rheum Dis(Q1,IF=19.103)。

METTL3介导的ATG7 m6A修饰调节自噬-GATA4轴促进细胞衰老和骨关节炎进展

背景
骨关节炎(OA)是晚年最常见的关节疾病,其主要特征是软骨基质逐渐丧失,并伴有其他关节成分的病理变化,包括软骨下骨硬化和滑膜炎症。据报道,偶发症状性膝关节骨性关节炎在55至64岁之间达到高峰。在老年人中,多种与衰老相关的因素可能有助于OA的发展。线粒体功能障碍、氧化应激和自噬减少改变软骨细胞功能,促进分解代谢过程和合成代谢过程中的细胞死亡。因此,提高对衰老如何促进OA进展的理解,将为减缓或停止OA提供新的策略。衰老细胞的长期存在与组织功能丧失和OA等与年龄相关的慢性疾病密切相关。细胞衰老是衰老的重要标志,软骨细胞在衰老和OA进展过程中具有衰老细胞的各种特征。据报道,在OA的发病机制中,大量滑膜细胞衰老。关节软骨细胞依赖自噬作为维持正常功能和存活的主要机制。在衰老过程中,软骨细胞中的自噬逐渐减少,从而导致衰老,最终导致OA严重程度加重。然而,OA进展中自噬受损的机制尚不清楚。

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N6-甲基腺苷(m6A)作为一种广泛的RNA转录后修饰,决定信使RNA(mRNA)的稳定性、剪接、运输、定位和翻译效率,深入参与各种细胞过程,包括DNA损伤、自噬和细胞衰老。最近,有报道称,m6A甲基转移酶的核心成分甲基转移酶样3(METTL3)在人类类风湿性关节炎滑膜中显著升高。METTL3基因敲低可有效抑制成纤维细胞样滑膜细胞(FLS)中的炎症和MMP因子表达。然而,m6A修饰的生物学意义以及FLS细胞衰老的潜在调节机制仍不完全清楚。

一句话总结现状:衰老细胞的长期存在与骨关节炎(OA)的发展密切相关,但潜在的机制仍不清楚。

在这项研究中,作者首次在体外和体内证明了衰老FLS在OA进展中的关键作用,并发现m6A修饰与FLS衰老之间存在正相关。METTL3以m6A-YTHDF2依赖的方式影响自噬相关7(ATG7)mRNA的稳定性,从而影响自噬活性,进而促进FLS衰老和OA进展。

材料方法

作者收集正常和OA患者的滑膜组织,通过免疫荧光和免疫印迹分析滑膜FLS的衰老;通过N6-甲基腺苷(m6A)-甲基化RNA和RNA免疫沉淀分析,探讨了甲基转移酶样3(METTL3)在自噬调节中的作用;对进行内侧半月板(DMM)手术的小鼠进行关节内注射pAAV9(含有靶向METTL3的小干扰RNA(siRNA))或不注射pAAV9,进行组织学分析以确定软骨损伤。

结果
FLS衰老和自噬受损与OA的进展密切相关
为了探索细胞衰老在OA发展中的作用,作者首先检测了人类OA患者滑膜组织中衰老细胞的典型生物标记物p16INK4a和p21的表达。OA患者滑膜中二者的蛋白质和mRNA水平显著升高(图1A-D)。作者进一步观察了OA滑膜组织中衰老FLS的积累和表型特征,p16INK4a和FLS标记物波形蛋白的双阳性免疫染色证实了这一点(图1E)。OA患者滑膜中自噬小泡的积聚减少,表明OA滑膜中自噬不足(图1F)。通过DMM建立了创伤后OA模型,作者发现与假手术小鼠相比,DMM小鼠滑膜中p16INK4a阳性FLS的数量以时间依赖性的方式显著增加(图1G)。软骨降解和OARSI(Osteoarthritis Research Society International)评分随时间显著加重(图1H),这与增强的FLS衰老密切相关(图1I)。此外,作者还证明,在DMM诱导的OA进展过程中,LC3B的表达显著降低(图1J),这与OARSI评分呈负相关(图1K)。这些结果表明FLS衰老和自噬受损与OA进展密切相关。

图1 FLS衰老和自噬受损与OA的进展密切相关

衰老的FLS有助于软骨细胞在体内和体外的分解代谢作用
为了进一步验证衰老的FLS是否能加速OA的病理进展,作者将人类软骨细胞(C28/I2细胞)与OA患者的原代FLS(OA-FLS)或非OA患者的FLS(Con-FLS,图2A)共同培养。有趣的是,在与OA-FLS共培养后,检测到C28/I2细胞中MMP13和ADAMTS5的表达增加,II型胶原的表达减少(图2B,C)。此外,为了进一步研究衰老的FLS对体内软骨降解的影响,作者使用博莱霉素(一种DNA损伤化学剂)诱导小鼠FLS中的细胞衰老,然后未经DMM手术的小鼠关节内注射2.5×105正常FLSs或博莱霉素诱导的衰老FLSs(图2D)。在第一次注射后第56天,作者发现注射衰老FLSs的小鼠与注射正常FLSs的小鼠相比,safranin O染色减少,II型胶原表达降低(图2E,F),同时滑膜和软骨中p16INK4a表达升高(图2G,H)。这表明外源性注射衰老的FLS可引发软骨功能障碍,并诱导滑膜和软骨衰老。

图2衰老FLS在体外和体内促进软骨降解

OA患者和DMM诱导的OA小鼠的衰老FLS中的自噬受损
在OA和DMM小鼠模型患者中,FLSs中LC3B表达降低(图3A、B)。p16INK4a阳性细胞中的LC3B显著降低(图3C、D)。为了证实OA-FLS中自噬结构的减少是由自噬损伤还是自噬降解增强引起的,作者使用了自噬通量抑制剂巴非霉素,它可以通过防止溶酶体降解增加LC3B。巴非霉素处理增加了Con FLS中LC3B点状细胞的数量,并提高了p62的水平。然而,巴非霉素治疗并没有增加OA-FLS中LC3B和p62的表达(图3E,F),这表明OA-FLS缺乏进一步自噬体形成的能力,并且OA-FLS中溶酶体的降解能力已经处于较低水平。


图3 OA患者和DMM诱导的OA小鼠的FLS中自噬受损

FLS中受损的自噬以GATA4依赖性方式加速细胞衰老
为了评估自噬是否介导FLS衰老,作者进行了额外的自噬激活和阻断实验。一方面,雷帕霉素激活自噬有效增加了每个细胞的LC3B-II和LC3点状蛋白质水平,并抑制了一系列事件,包括p16INK4a、p21和p62的表达(图4A)。另一方面,通过3-甲基腺嘌呤(3-MA)抑制自噬可显著降低LC3B-II水平,并伴有Con-FLS中p62、p16INK4a和p21的表达升高(图4B)。衰老调节剂GATA4在体内和体外OA-FLS中显著增加(图4C、D)。此外,在OA-FLS中通过雷帕霉素恢复自噬可有效降低GATA4的表达,而3-MA治疗显著提高Con-FLS中GATA4的蛋白水平(图4A,B)。GATA4基因敲低减轻了3-MA诱导的p16INK4a、p21和SASP的表达(图4E、F)。相反,GATA4的上调可能有助于p16INK4a、p21和SASP的表达(图4G,H)。

图4自噬以GATA4依赖性方式调节细胞衰老

升高的m6A水平与OA-FLS中的自噬受损相关
为了确定m6A修饰是否参与调节OA发展过程中FLS中的自噬活性,使用免疫荧光法测定m6A的水平。在OA患者和DMM小鼠模型的FLS中,m6A表达均显著增加(图5A-C)。鉴于m6A修饰主要受m6A甲基转移酶复合物的调节,作者测量了OA滑膜和OA-FLSs中相关复合物的mRNA水平,除了METTL3的mRNA表达显著上调,而其他基因的mRNA表达没有显著变化。从OA患者滑膜分离的FLS中METTL3的蛋白质水平也显著升高(图5D,E)。通过对人类OA滑膜和DMM诱导的OA模型中使用免疫荧光染色对波形蛋白和METTL3进行双重标记,进一步证实了这一发现(图5F,G)。METTL3的上调提高了m6A水平,伴随着LC3B-II的表达降低,p62和GATA4的表达增强(图5H)。相反,METTL3基因敲低降低了OA-FLS中m6A的水平,上调了LC3B-II的表达,并抑制了p62和GATA4的蛋白水平(图5I)。这些结果表明,METTL3介导的m6A修饰在FLS中自噬调节的衰老中起关键作用。

图5 m6A水平升高导致OA-FLS中的自噬受损

METTL3介导的m6A修饰以YTHDF2依赖性方式诱导ATG7转录本的衰变
在人类OA-FLSs和DMM小鼠模型中,ATG7蛋白水平持续显著降低(图6A,B)。METTL3的上调显著降低了ATG7的表达(图6C)。相比之下,METTL3基因敲低上调了OA-FLS中ATG7的表达(图6D)。ATG7的上调有效缓解了METTL3诱导的LC3B-II减少,并降低了Con-FLS中p62和GATA4的表达(图6E)。ATG7的敲低也抑制了METTL3敲低诱导的LC3B-II增加,并提高了Con FLS中p62和GATA4的水平(图6F),表明METTL3诱导的FLS自噬缺陷是通过抑制ATG7介导的。接下来,作者对ATG7转录本进行序列分析,发现编码序列区内有三个m6A修饰位点,3′-非翻译区(UTR)内有五个m6A修饰位点(图6G)。m6A RNA免疫沉淀(RIP)分析表明,m6A在位点1、2、4、5和7处显著富集(图6H)。与Con-FLS相比,OA-FLS中位点4和7的m6A富集显著增加(图6I),METTL3敲除后m6A富集显著减少(图6J)。这些结果表明METTL3靶向ATG7转录本,并以m6A依赖的方式调节ATG7。据报道,YTHDF1促进靶向m6A修饰mRNA的翻译,而YTHDF2选择性识别并破坏m6A修饰mRNA的稳定性。作者发现,YTHDF2基因的敲低显著减轻了METTL3诱导的ATG7蛋白表达的降低,而并不影响ATG7蛋白的表达。这表明METTL3修饰ATG7的m6A mRNA是YTHDF2的靶点(图6K)。此外,TG7与YTHDF2相互作用,但与YTHDF1无关(图6L,M)。上述结果表明METTL3以YTHDF2依赖的方式调节ATG7的表达。

图6 METTL3介导的m6A修饰以YTHDF2依赖性方式诱导ATG7转录本衰变

METTL3在体外调节细胞衰老和SASP表达
作者通过转染METTL3质粒在人类FLS中过度表达METTL3,METTL3的上调显著提高了人类FLS中p16INK4a和p21的表达(图7A,B)和SASP的mRNA水平(图7B)。β-半乳糖苷酶分析也证实METTL3促进FLSs的衰老(图7C)。而METTL3基因敲低明显抑制了OA-FLS中p16INK4a和p21的表达(图7D,E),并降低了SASP的表达和IL-1β的分泌(图7E)。另外,METTL3基因敲低可有效缓解博莱霉素诱导的小鼠FLS中p16INK4a、p21和SASP的表达(图7F),以及β-半乳糖苷酶的产生(图7G,H)。总之,这些数据表明METTL3可能作为一个潜在的治疗靶点来损害FLS的细胞衰老。

图7 METTL3在体外调节FLS中的细胞衰老和SASP表达

滑膜靶向METTL3抑制缓解了DMM小鼠模型中OA的进展
作者将编码滑膜成纤维细胞靶向肽基序(HAP-1)的DNA序列插入VP2结构域的N-末端,以构建FLS靶向的腺相关病毒载体(rAAV9.HAP-1)(图8A)。与rAAV9相比,rAAV9.HAP-1的转染效率略有提高,在ATDC5细胞中检测到低增强型绿色荧光蛋白(EGFP)表达(图8B,C)。关节内注射AAV9.HAP-1-si-METTL3后,DMM小鼠在OA发育过程中进行性软骨降解显著逆转(图8D,E)。此外,与用AAV9.HAP-1-NC治疗的小鼠相比,用AAV9.HAP-1-si-METTL3治疗的小鼠滑膜中的METTL3和p16INK4a水平显着降低(图8F)。这些结果表明,通过向滑膜的AAV9.HAP-1衣壳传递si-METTL3可以抵消DMM诱导的OA小鼠模型中的OA进展。

图8滑膜靶向抑制METTL3可减轻DMM诱导的OA的病理进展

总结
本文的研究结果扩大了对METTL3在促进细胞衰老和OA进展中发挥基础作用的机制的认识。METTL3通过调节自噬并以m6A-YTHDF2依赖的方式影响ATG7转录本的稳定性来实现这些功能(图8G)。该研究强调了m6A甲基化机制在自噬中的功能重要性,这为了解METTL3调节细胞衰老的潜在分子机制以及OA治疗策略的发展提供了见解。

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写在最后
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