eLife | 英国邓迪大学研究揭示拟南芥NLR基因的过早转录终止机制！

参与抗病的基因是基因组中进化最快和最多样化的组成部分。在植物基因组中发现了大量的核苷酸结合的富含亮氨酸的重复序列（NLR）基因，这些基因是抗病所必需的。然而，NLR可以触发自身免疫，破坏有益的微生物群或降低适应性（Nature | 重磅！中科院植生所辛秀芳团队揭示模式识别受体是NLR介导的植物免疫所必需的！Science | 清华大学和马普所重磅研究！植物免疫受体：一个巴掌拍不响！Science | 重磅！加州伯克利研究揭示植物抗病小体ROQ1识别病原菌效应蛋白新机制！Science | 专家点评：植物NLR免疫受体与植物防御反应！Annual Review of Plant Biology | 植物和动物细胞内守护者NLRs的比较概述！Nature Reviews Immunology | 重磅！Paul Schulze-Lefert综述NLR介导的植物免疫！）。因此，了解NLRs是如何被控制的至关重要。

2021年4月27日，国际权威学术期刊eLife发表了英国邓迪大学Gordon Grant Simpson团队的最新相关研究成果，题为Widespread premature transcription termination of Arabidopsis thaliana NLR genes by the spen protein FPA的研究论文。

在这篇文章中，科研人员表明RNA结合蛋白FPA介导了NLR转录本广泛的过早剪切和多腺苷酸化，从而控制其功能表达并影响免疫力。利用长读长Nanopore直接 RNA测序，科研人员解决了NLR转录本加工和基因注释的复杂性。科研人员的研究结果揭示了NLR控制的共同转录层，对理解植物免疫反应中NLR的调控和进化动态具有重要意义。

图1：FPA与处理Pol II转录的RNA的3'端并促进转录终止的蛋白质联系在一起

图2：依赖于FPA的poly(A)位点选择

图3：Nanopore和Helicos DRS鉴定出受替代多腺苷酸化调节的NLR基因

图4：FPA依赖的NLR转录本的替代多腺苷酸化

图5：RPP4的替代多腺苷酸化的复杂FPA依赖模式

图6：FPA促进RPP7蛋白编码外显子6内的过早裂解和多腺苷酸化，损害了植物对Hpa-Hiks1的免疫力

图7：FPA依赖的替代多腺苷酸化在NLR基因座上的功能后果

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