项目文章 | 动植物合作文章再迎井喷式发表

继3月份合作文章五连发以来，动植物合作文章再迎发表井喷，三个月来又连续在多家高水平杂志发表共同作者基因组合作研究成果八篇。

项目文章一 The reference genome of Miscanthus floridulus illuminates the evolution of Saccharinae发表期刊：Nature Plants影响因子：13.256发表日期：2021年5月研究概要：芒草是甘蔗亚族（还包括甘蔗和高粱）的一员，作为纤维素生物燃料原料被广泛使用。在此，作者使用PacBio和Hi-C数据组装了芒草基因组。对甘蔗基因组亚族各基因组进行比较发现高粱先从甘蔗和芒草的共同祖先分离，二者随后分离，随后，甘蔗基因组发生两次连续WGD事件，而芒草基因组中发生一次WGD事件。五节芒基因组重新二倍化的过程中，两条染色体发生融合，没有明显主导的亚基因组。75个芒草居群的重测序分析结果表明，芒属植物之间存在着广泛的种间杂交和渐渗作用，这为通过杂交培育出更优异的芒属或甘蔗属植物品种提供了理论支持。核心结果：甘蔗亚族的进化史。芒草、甘蔗祖先种与高粱祖先种在约550至610万年前分化，而后在约430至460万年前芒草祖先种与甘蔗属祖先种又发生分化，经历过多轮WGD和染色体重排等演变成现在的芒属和甘蔗。75个芒属植物的群体遗传结果和进化关系。主成分分析显示样本主要聚类为三类，其余多为杂交品种，与基于SNP构建的系统进化树一致，表明样本多数起源于M. sinensis和M. sacchariflorus。
项目文章二 Introgressing the Aegilops tauschii genome into wheat as a basis for cereal improvement发表期刊：Nature Plants影响因子：13.256发表日期：2021年5月研究概要：小麦D基因组有限的多样性对选择育种造成了极大困难。研究人员建立了快速渐渗平台，将节节麦的整体遗传变异转移到优质小麦中，从而丰富小麦种质资源池。作者组装了4个新的参考基因组，对278份样本进行重测序，并构建了该小麦先祖种的变异图谱。对基因组之间的比较找到了可能应用在小麦改良中的多样功能基因或新单倍型。作者构建了节节麦核心种质资源，包括覆盖了整个物种99%变异的85个居群，并与精英小麦品系杂交，得到节节麦-小麦合成八倍体小麦池（A-WSOW），实验和田野分析证实了该渐渗系巨大的育种潜力。核心结果：节节麦基因组的进化。基于单拷贝同源基因的系统发育树表明节节麦的D基因组约在440万年前从A基因组分化。支持小麦D基因起源于L2E，其中有少量由L1到D基因组的基因渐渗。

6个节节麦D基因组和278个重测序居群的变异图谱。6个代表性基因组共享的基因家族核苷酸多样性更低、进化速率更慢。野生品种与小麦的亲缘关系越远，在D基因组中就越缺失。

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