推荐一个强大的文章示意图绘制工具
在大牛的文章中经常会看到一些展示实验流程、基因互作模型、信号通路等的示意图,比如下面的这些。
(Frontiers in Microbiology, 2015)
(Nature Protocols, 2013)
(Nature, 2016)
在之前的文章《如何用PPT绘制通路示意图?》已介绍过用几何图形绘制示意图,可有的童鞋问啦,我想展示比如神经细胞、细胞器、核酸链、小鼠类似这样复杂的图形怎么办?必须要精通Ai(Illustrator)、cdr(CorelDRAW)这样的平面设计软件吗?
这里给大家推荐一个软件ChemDraw,它是一个化学结构式绘制软件,还可以绘制3D的分子模型(如下图)。我在之前的文章《分子化学结构式的绘制》有提到过。它的“主业”是画各种的结构式,我们这里仅仅用到它高质量的矢量图形模板。
下面演示如何画上面示例中的一些图形。首先,通过View菜单显示Biopolymer 和BioDraw两个工具条,如下。
利用Biopolymer工具可以画核酸和蛋白序列,如下图。
而BioDraw可以画一些生物元件,比如双螺旋、抗体、跨膜结构、细胞膜等等,如下图。长按有黑三角的图标,会显示更多同类型的元件。
每个元件都可以旋转缩放、重新着色,方法如下图。
另一种画示意图方法是利用模板。长按“图章”按钮,你会看到非常丰富的图形和化学结构式模板,如下图,用这些图形基本上就可以快速画出上文第1个例子中的图形元件。
当然你也可以通过File\Save As把图形元件保存成svg、eps格式的矢量图(如下图),在Ai软件中进行更复杂的示意图绘制。
软件下载地址(可试用半个月):http://www.chemdraw.com.cn/,软件还是很贵的,你可以通过这个网址看下它的价格(http://scistore.cambridgesoft.com/),贵的东西一般都是好东西!
但如果你只是想画个图,其实半个月的试用时间足够;如果你想一直用下去,这里推荐大家使用ChemDraw的在线版本。
工具网址:
https://chemdrawdirect.perkinelmer.cloud/js/sample/index.html
工具的界面还是比较简洁的,因为是在线版本,所以它的模板更新更及时,比本地版的似乎要丰富,如下图。
在线版本的使用方法和本地版的软件基本一致,不过保存图片的方法比较特殊,这里介绍一下。我这里简单的画了一个注射器和小鼠(做了组合),然后点击Structure菜单下的Get SVG,如下图。
在弹出的窗口中CTRL+A全选代码,然后复制粘贴到文本编辑器(如记事本、notepad等)中,另存为文件名为“*.svg”的文件即可。
SVG格式的矢量图可以用Ai、cdr等软件打开(如下图),以及做进一步的编辑,比如放大缩小、颜色调整等等。
今天的内容就到这里啦,ChemDraw的功能非常强大,大家赶快去探索吧~
参考文献
Song C, Zhang S,Huang H. Choosing a suitable method for the identification of replicationorigins in microbial genomes[J]. Frontiers in Microbiology, 2015, 6:1049.
Ran F A, Hsu P D,Wright J, et al. Genome engineering using the CRISPR-Cas9 system[J]. Nature Protocols, 2013, 8(11):2281-2308.
Kranz L M, Diken M,Haas H, et al. Systemic RNA delivery to dendritic cells exploits antiviral defence for cancer immunotherapy[J]. Nature, 2016,534(7607):396-401.