推荐一个miRNA数据库

miRNA即microRNA，是一类长约20~24 nt的小RNA分子。miRNA在真核生物中广泛存在，主要通过与mRNA结合调控基因的表达。miRbase是由曼彻斯特大学研究人员开发的miRNA数据库，几乎是收录最全的miRNA数据库。

数据库链接：

http://www.mirbase.org/

在Search页面可通过输入miRNA的ID、关键词、染色体位置等查询已知的miRNA的信息。

也可以提交miRNA序列，以序列比对的方式在miRbase数据库查找序列相似的已知miRNA。

我这里以工具页面的Example序列为例，看一下比对结果。点击Search miRNAs按钮，会得到比对结果列表，如下。

点击任一align，查看提交序列与结果列表中其他miRNA的比对得分情况，如下。

点击比对结果列表中相应物种miRNA的ID或Accession，比如我这里点MIMAT0000414（或 has-let-7g-5p）可进入相应miRNA的详情页面，我们可以查看miRNA前体的茎环结构，注释信息等。

还可以查看结环结构对应的两个成熟体miRNA，如这里的has-let-7g-5p和has-let-7g-3p，如下。

点击成熟体序列对应的Predicted targets板块中的外部数据库链接，比如TargetScanVert或miRDB，可预测相应Mature miRNA的靶基因。

下表为点击TargetScanVert后，得到的靶基因预测结果列表。

为了方便使用数据库中数据，我们可通过Download页面，将miRNA的序列（fasta）和相应物种的基因组位置信息（ggf3格式）数据下载到本地，以实现更多本地的个性化分析。

最后，在Submit页面，我们也可以上传新的miRNA序列，对新miRNA进行命名。受国外网速限制，miRbase的整个使用过程可能会体验不佳，本次分享就到这里啦！

▼参考文献▼Kozomara A, Birgaoanu M, Griffiths-Jones S. miRBase: from microRNA sequences to function[J]. Nucleic acids research, 2019, 47(D1): D155-D162.

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