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写SCI学学西游记,好故事倒着读更精彩!

2014-05-29 酸菜 解螺旋


如来派唐僧师徒四人去东土大唐去传教,一路上遇到形形色色的妖怪阻挠,闹到最后发现都是有后台的。八戒和沙和尚觉得现实太黑暗了,一个躲进了高老庄,一个钻入了流沙河,只有悟空坚持护送师傅。


  吃了亏的各路山大王撺掇后台老板天庭跟如来达成协议——我们可以保证唐三藏平安到长安,不过你得把孙悟空这个刺儿头给办了。如来妥协了,在一番阴谋之下,悟空被压在了五指山下,唐三藏抛弃了悟空,孤身来到长安,被封为御弟,享受荣华富贵,寿终正寝。


  五百年后,悟空终于从五指山下逃脱,一声不吭把天庭搅了个天翻地覆。天庭被迫许诺让猪八戒化为人身,封为天蓬元帅,沙和尚封卷帘大将,利诱他们灭掉悟空。最后,因兄弟相残而心灰意冷的悟空去寻找菩提祖师解惑,封印了一身神通,回到花果山,陪着猴子猴孙聊度余生,终在花果山的山顶化作了一块石头……


  第一次看到这个段子,酸菜着实感慨了一阵子,同样的故事,改变一下叙事顺序会演化出另一种摄人心魄的效果,尤其是在今天看来还有借古讽今的味道。作为一个文法熟练的伪文艺理工男,我自然是对正叙、倒叙、插叙等故事手法驾驭自如。所谓世上无难事,只怕有心人,经闭门研究,举一反三,我居然发现科学论文中也同样具有多样化的叙事结构,有时候因为情节的巧妙设计,读起来会更有滋味。


  我随手撷取一篇今年三月份发在Clinical Cancer Research杂志上的文章来举例说明。


  

  这篇论文看题目就有这么两组关键词:膀胱癌、转移、EMT;TGF-β、malat1、suz12。为了节约大家时间,酸菜简单总结下:作者研究的是TGF-β介导膀胱癌转移过程EMT转化(这一现象是已知的)的调节机制,TGF-β可以上调LncRNA malat1表达,并在suz12蛋白协助下改变EMT标志物,抑制E-cadherin,上调N-cadherin和fibronectin的表达水平(本文发现)。


原文是这么讲故事的:

1. 在膀胱癌细胞株RT4中重现了TGF-β刺激下细胞发生EMT的表型,表现为上皮标志物E-cadherin下降,间质标志物N-cadherin、fibronectin增强。有趣的是,malat1表达也与TGF-β处理剂量正相关(抛出现象);

2. 检测组织样本中TGF-β、malat1和E-cadherin表达,与细胞实验结果相符(加深证据);

3. malat1可以负调节E-cadherin表达,表现为将malat1用siRNA沉默后,E-cadherin表达上升(提出假设);

4. LncRNA发挥功能往往需要一些蛋白伴侣,作者用RIP实验(RNA结合蛋白免疫沉淀)研究细胞内RNA与蛋白结合情况,证实malat1与suz12蛋白存在相互结合(探讨机制);

5. suz12也可以负调节E-cadherin,进一步ChIP实验(染色质免疫沉淀)证实,suz12结合于E-cadherin的DNA启动子区依赖于malat1的招募(加深细节);

6. 无论沉默malat1还是suz12,都可以阻断TGF-β调节E-cadherin、N-cadherin和fibronectin的作用,说明TGF-β诱导EMT表型依赖于malat1/suz12通路(总结通路);

7. 细胞、动物模型中无论沉默malat1或suz12,都可以抑制肿瘤转移能力,说明靶向malat1或suz12治疗的潜力(功能验证);

8. 95例膀胱癌组织样本中高表达malat1则预示着患者预后较差(临床意义)。

小伙伴们看着有点晕?没关系,酸菜换一个正叙方式来概述一下这个故事:malat1是最近很火的一个lncRNA,作者发现这个malat1竟然跟膀胱癌的预后有关系,为了解释这一想象,作者建立了一个TGF-β刺激的EMT细胞模型(做肿瘤转移研究常用),有趣的是沉默malat1能够阻断TGF-β诱导的EMT,进一步探索发现malat1还有一个好基友——suz12蛋白,一个RNA,一个蛋白相互结合调节了EMT核心marker,E-cadherin的转录,所以malat1高表达的膀胱癌患者更易发生转移也就不难理解了。

怎么样,将数据换个顺序编排是不是感觉就清晰多了?这是因为大家习惯于从临床到细胞、动物,再到分子机制的线性结构;习惯于先抛出问题,然后作答的简单逻辑。而对于故设悬疑,多线索叙事,穿插剪辑等花哨的手法缺乏体验,更谈不上享受和欣赏。有一点可以肯定,按照做实验的时间线去组织数据是非常平铺直叙的一种写法,虽然思路不乱但缺少引人入胜的情节。而将论文的数据素材重新编排,演绎出悬疑和趣味绝对是高段位的能力。不过练归练,一味烧脑也不可取,凡事过犹不及,切勿走火入魔。


回复“西游记”,给你看2个酸菜针对原文重新编排的故事,通过真实的案例,体会科学论文叙事多样性的魅力。

——酸菜



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