熊说肿瘤｜OncoSearch：肿瘤研究必备（自用）的聚合搜索工具
写在前面
如果你目前的学习或者工作和「肿瘤研究」相关，面对日新月异的研究进展，想必总会在实际工作开会或者看文献的时候发现各种奇奇怪怪的基因和名词。问同学和同事吧，有点不好意思，鼓起勇气问了，很可能就也还记不住。（好吧，以上都是我对现状的自我剖析）
于是借助 Google CSE 的羊毛，我就整了这么一个叫做 OncoSearch 的小工具。开发成本可以说是没有，但着实解决了自己现在非常棘手的问题，于是也推荐给可能需要的你。
因为Bing要收费，所以我调用的是Google搜索，所以目前使用OncoSearch唯一也是最大的门槛就是要有能力正常使用Google。如果你暂时不行，可以推荐给可以用Google的朋友
关于 OncoSearch
OncoSearch 利用 Google 搜索引擎整合了肿瘤相关的近30个常见网站对你的输入内容进行搜索。你可以尝试搜索基因名如 EGFR，突变位点如 BRAF V600E 或者是任何和肿瘤相关内容。
OncoSearch的小优点
OncoSearch 不生产知识，只是Google搜索结果聚合的搬运工，所以这个工具使用的唯一前提就是能正常的打开Google搜索。根据自己的日常使用总结出来的高频需求，目前的OncoSearch和直接在搜索引擎里查询相比有如下几个特点。
接近30个肿瘤医学相关的网站（还会持续增加且欢迎推荐），基本覆盖了肿瘤研究的方方面面，例如基因功能、基因表达、突变信息、药物信息和临床实验信息以及文献等，也可以直接搜索到 cBioPortal 内容。 我给高频的一些关键网站添加了标签，方便一眼看到搜索结果的主要类型是变异相关、药物相关、临床实验相关还是常用综合性网站。 省去了很多每次搜索肉眼过滤的时间，如果按照相关性排序，OncoSearch 往往在第一页我都能找到自己想要的结果。 所有标签都被做成单独的tab可以进行过滤，比如搜索后按照时间排序，再点开文献标签页，你甚至也能一并大概了解这个东西目前的最新研究进展。 可扩展性，OncoSearch本身就是一个简单的网页，但是也因此有了很多可扩展性。如果今后还有新的易于实现的想法，我也都可以在这里测试上线。
效果如下图所示
OncoSeach 已经推荐给了身边的一些朋友同事，大家都觉得还不错。因此如果你也在这个领域（且能用Google），我非常认真地建议你把它作为一个常用搜索引擎收藏并用起来。
嗯，真的挺香。
访问地址
https://kaopubear.top/oncosearch
附上目前包括的网站
GeneCards
gnomAD
ICGC
cancer dictionaries
HUGO Gene Nomenclature Committee
Atlas of Genetics and Cytogenetics in Oncology and Haematology
Network of Cancer Genes Home
Cancerrxgene - Genomics of Drug Sensitivity in Cancer
OncoKB - MSK’s Precision Oncology Knowledge Base
My Cancer Genome
CIViC - Clinical Interpretation of Variants in Cancer
JAX CKB
COSMIC | Catalogue of Somatic Mutations in Cancer
ClinVar
OncoMX
ArrayExpress
The Human Protein Atlas
InterPro
TIMER2.0
Homo_sapiens - Ensembl genome
GeneMANIA
Cancer Genetics Web
Surveillance, Epidemiology, and End Results Program
STRING: functional protein association networks
cBioPortal for Cancer Genomics
GTEx Portal
赶紧用起来吧，有什么建议添加的网站也可以直接在这里留言。
顺手再来个转发呗
访问地址
https://kaopubear.top/oncosearch
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