第二届动物磁共振影像数据处理培训班
北京赛博尔医药科技有限公司将于2018年12月13日- 2018年12月16日 (周四至周日)举办第二届动物磁共振影像数据处理培训班(详见课表安排)。欢迎大家前来咨询。
培训班依然坚持小班教学,手把手带教的教学模式,争取使每一位参加培训的学员能够在数据处理方法上取得进步。
培训简介
这次培训班面向的对象是一些希望利用小动物磁共振相关技术在大鼠模型、小鼠模型或树鼩模型进行科研的医生、初学者、研究生等。同时,培训也对MRI图像分析中的统计分析部分进行较为详细的原理讲解和实际操作训练。培训班实行小范围的理论与实践相结合,以实现授课、操作、指导及问题解决一体化,最终达到独立操作的目标。
培训对象
本次培训班具体培训内容主要包括:核磁共振波谱数据处理以及其在神经科学领域内的应用,小动物数据分析流程介绍,小动物数据处理相关软件的介绍,小动物结构磁共振数据VBM分析,小动物静息态功能磁共振数据处理、静息态功能指标计算,小动物磁共振数据统计分析、结果报告及作图等,培训结束后达到让学员能够完全独立完成小动物成像数据分析的目的。本培训将主要基于SPM软件平台。
注:如方便,请于会议开始前一天到达会场(9:00 - 17:00)熟悉场地及安装软件、拷贝资料等事宜。
培训课程安排
第一天 王杰老师 | 上午 | Matlab学习 | 1、matlab基本知识 |
2、Matlab绘图以及文件操作 | |||
3、matlab的GUI操作(后续图像处理软件的基础) | |||
下午 | 核磁共振波谱数据处理以及其在神经科学领域内的应用 | 1、核磁共振波谱技术简介 | |
2、核磁共振波谱数据数据处理 | |||
3、核磁共振波谱技术的应用 | |||
4、Matlab数据处理实操学习 | |||
第二天 聂彬彬老师、梁胜祥老师 | 上午 | 小动物数据分析简介 | 1. 小动物成像实验注意事项 |
2. 小动物成像基本原理 | |||
3. 小动物数据分析研究现状 | |||
4. 小动物数据分析一般流程 | |||
下午 | 小动物数据处理软件准备及实操练习 | 1. MRIcron简介 | |
2. 软件工具包介绍及准备(SPM、spmratIHEP、spmmouseIHEP、spmtreeshrewIHEP等) | |||
3. 数据整理及转换、数据质量检查 | |||
4. 实践操作 | |||
第三天 聂彬彬老师、梁胜祥老师 | 上午 | 小动物结构磁共振数据VBM预处理简介及实操练习 | 1. Matlab基本操作 |
2. 数据头文件修改(图像原点等调整) | |||
3. GM、WM和CSF组织分割 | |||
4. 高斯平滑 | |||
5. 实践操作 | |||
下午 | 小动物静息态功能磁共振数据预处理简介及实操练习及实操练习 | 1. SPM数据分析原理和流程 | |
2. 预处理方法及常用预处理流程(时间矫正、头动矫正、空间标准化、滤波等) | |||
3. 基于用户数据的自适应空间标准化 | |||
4. 实践操作 | |||
第四天 聂彬彬老师、梁胜祥老师 | 上午 | 静息态功能指标计算 | 1. ALFF计算 |
2. ReHo计算 | |||
3. 基于种子点的FC计算 | |||
4. ROI指标提取 | |||
下午 | 小动物数据统计分析、结果报告及作图 | 1. SPSS、SPM统计分析(单样本t检验分析,配对t检验,单因素方差分析,多重比较校正) | |
2. 体素水平结果报告 | |||
3. 可视化作图 |
培训人数、费用
为保证培训质量,此次培训限定人数20人左右,报名敬请从速。所有参会人员3000/人(含资料费、培训费和午餐费,交通及住宿费自理)。
培训地点
北京市经济技术开发区科创十三街18号院锋创科技园5号楼,具体见会议指南。
报名方式、缴费方式
请将报名回执发送至:Cibr_medical@163.com
联系人:杨老师13381109780
姜老师15904965265
银行转账或者支付宝(账号:13381109780 户名:杨南),不接受现场缴费,谢绝录像,主办方提供发票。
报名回执表
单位名称 (发票抬头,纳税人识别号) | |||||
姓名 | 性别 | ||||
电话号码 | 科室/专业 | ||||
缴费方式 | □转帐 □支付宝 (请选择在□打√) | ||||
银行信息 | 户名:北京赛博尔医药科技有限公司 账号:0200048409200117652 开户银行:中国工商银行股份有限公司北京石门支行 | ||||
汇款备注 | 第二届动物磁共振影像数据处理培训班 |
注:请完整填写回执表后回传给我们,以便给你发送确认函,谢谢支持!
在线支持服务
参加培训学员将得到在线技术支持服务,伴随参加培训班的学员共同成长。
培训人员简介
王杰,研究员,博士生导师,现工作于中国科学院武汉物理与数学研究所脑科学研究中心,兰州大学与耶鲁大学联合培养博士,2015年入选中科院脑科学与智能技术卓越创新中心副研究员,2016年加入中科院青年创新促进会,并多次荣获所级及院级优秀共产党员荣誉以及优秀青年科学家奖(国际生物磁共振会议,日本)。连续负责组织举办三届全国神经环路示踪技术培训班/研讨会。目前,已主持6项国家自然科学基金面上项目、青年基金、湖北省自然科学基金以及中科院人事局项目等,子项目负责人参与国家863课题,项目骨干参与国家重大研究计划、中科院战略先导专项以及重大国际合作等多个项目研究。近年来在PNAS等SCI期刊上发表四十余篇论文,获批国家发明专利2项,软件著作权6项。现主要从事于核磁共振波谱(MRS)及磁共振成像(MRI和fMRI)在脑功能及其异常领域内的应用,工作重点放在酒精成瘾以及痴呆相关领域。
聂彬彬,中国科学院高能物理研究所,副研究员,硕士生导师,中国科学院脑科学与智能技术卓越创新中心副研究员,中国研究性医院学会放射学专业青年委员会委员,中国医药信息学会医学影像信息学专业委员会委员,国家自然科学基金函审专家,《磁共振成像》审稿专家等。多年来一直从事医学影像数据分析方法的研究及应用工作,作为课题负责人承担了国家自然科学基金三项,中国科学院青年项目一项;作为主要参与人参与了973课题两项。发表论文十余篇。
梁胜祥,博士,一直专注于大鼠、小鼠磁共振数据分析方法研究及应用。目前已发表SCI论文10余篇,其中第一作者论文4篇,参与多项国家自然科学基金项目,擅长小动物磁共振实验与数据分析。
详情请见www.cibrmed.com
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提取码:74rl
数据分析业务!!!
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具体项目包括:
1.脑电数据预处理:使用EEGLAB对Neuroscan、Brain Products、EGI、ANT、Biosemi等主流脑电设备采集的脑电数据进行预处理。
2.ERP成分统计分析:提取ERP成分的波幅和潜伏期,并进行统计分析。
3.EEG频谱分析:(1)使用傅里叶变换的方法计算脑电各个频段的功率,并进行统计分析;(2)使用短时傅里叶变换、小波变换和希尔伯特变换的方法进行脑电时频分析(如ERD/ERS分析、试次间相位同步分析)。
4.基于sLORETA的脑电源分析:(1)ERP成分源定位;(2)特定频段EEG源定位;(3)源空间的脑功能连通性分析。
5.功能连通性分析:使用相关、相干、相位锁定值和格兰杰因果分析研究电极之间功能连通性。
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任务态激活脑区分析
任务态E-prime实验实
功能连接分析
局部一致性(ReHo)分析
低频振幅(ALFF/fALFF)分析
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结构磁共振数据处理
基于VBM的灰白质分析
基于Freesurfer的皮层厚度分析
基于FSL的纤维束追踪
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