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结构磁共振及DTI(弥散张量成像)科研培训班

北京赛博尔医药科技有限公司将于2019年5月1日- 2019年5月5日(周三-周日)举办结构磁共振及DTI(弥散张量成像)科研培训班(详见课表安排)。欢迎大家前来咨询。

培训班依然坚持小班教学,手把手带教的教学模式,争取使每一位参加培训的学员能够在数据处理方法上取得进步。


培训简介

大脑结构像分析可以实现对大脑解剖结构的重建、可视化显示以及量化分析,为揭示各种神经、精神疾病的发病机理和神经机制提供影像信息;还可以实现与脑功能数据的多模态融合,帮助我们更加深入地了解大脑的工作原理。作为近年来磁共振成像技术的一项重大突破,弥散张量成像(DTI) 是目前唯一能够对活体人脑内的白质纤维结构进行非侵入性检测的影像技术,成为当前国内外影像学的研究热点。我们拟举办结构磁共振及DTI(弥散张量成像)科研培训班,旨在帮助刚刚接触磁共振脑成像的临床医生,如放射、精神、神经内外科、康复科、儿科等及心理、生物医学工程等研究生快速了解本领域及初步掌握数据处理及分析的相关方法。

培训对象

本次培训班面向的对象是一些希望利用T1W-MRI、T2W-MRI及DTI进行科研和临床研究的医生、研究人员等,为了使数据处理不再成为脑科学研究的拦路虎,培训班实行小范围的理论与实践相结合,授课、操作、指导及问题解决一体化,最终达到独立操作。

培训内容主要包括:利用FreeSurfer提取皮层厚度及体积、结构脑网络构建、基于图论的脑网络分析方法、结构像VBM/CAT12-SBM分析、DTI数据实际操作流程和结果报告、弥散磁共振成像的基本原理,分析方法以及应用概述、基于DTI数据的脑网络构建和图论分析等。

培训课程安排

时间

课程名

主要内容

第一天

5月1日


上午

皮层厚度、皮质下结构体积及海马体积的计算

Ubuntu系统及常用命令介绍

Freesurfer环境配置

计算结果及文件说明

Freeview看图

下午

结构网络构建

个体脑网络/群组脑网络的构建

海马亚区网络构建

小世界网络分析

第二天

5月2日

崔博士

 

上午

Freesurfer中Qdec统计分析

数据质量检查与常见问题解决

Qdec统计分析

下午

命令行统计&数据转换

GLM原理简介

命令行统计分析

皮层厚度提取

Freesurfer批处理

第三天

5月3日

张博士

上午

结构像VBM/CAT12-SBM分析

VBM方法介绍

基于SPM的VBM分析流程详解

VBM统计分析

结果呈现与汇报

下午

SBM方法及常用指标介绍

基于CAT12的SBM分析流程详解SBM统计分析

结果呈现与汇报

第四天

5月4日

路博士

上午

DTI分析方法概述、预处理及网络构建

扩散磁共振成像基本原理介绍

DTI数据基本分析方法概述

DTI相关应用研究综述

DTI数据的格式转换,预处理与质量控制

下午

脑白质网络构建

基于Gretna的脑白质网络特征提取

基于SPSS的相关统计学分析(结合临床指标)

脑网络可视化软件BrainNet Viewer介绍及应用

第五天

5月5日

仲博士

上午

弥散磁共振成像的分析方法原理及实操

概率纤维跟踪的实现

概率纤维束跟踪的可视化显示

ROI-based 概率性纤维追踪以及统计分析

下午

基于概率纤维跟踪的网络构建

概率纤维跟踪的批处理(基于脚本,以及PANDA图形化界面操作)

注:如方便,请于会议开始前一天到达会场(13:00 - 17:00)熟悉场地及安装软件、拷贝资料等事宜。

培训人数、地点

为保证培训质量,此次培训限定人数20人左右,报名敬请从速。

北京市经济技术开发区科创十三街18号院锋创科技园5号楼,具体见会议指南。

费用、报名缴费方式

所有参会人员3000/人(含资料费、培训费和午餐费,交通及住宿费自理)

请将报名回执发送至:Cibr_medical@163.com 

银行转账或者支付宝(账号:13381109780 户名:杨南),不接受现场缴费,谢绝录像,主办方提供发票。

联系人:杨老师13381109780 

姜老师15904965265

 

报名回执表

单位名称

(发票抬头,纳税人识别号)


姓名


性别


QQ


电话号码


科室/专业


缴费方式

□转帐  □支付宝 (请选择在□打√)

银行信息

户名:北京赛博尔医药科技有限公司

账号:0200048409200117652

开户银行:中国工商银行股份有限公司大郊亭支行

汇款备注

结构磁共振及DTI(弥散张量成像)科研培训班

注:请完整填写回执表后回传给我们,以便给你发送确认函,谢谢支持!

请各位培训学员自带笔记本电脑(Windows 64位及Linux双系统(Ubuntu或虚拟机),务必下载好FreeSurfer、FSL、PANDA软件,i5、4G内存、50G剩余存储空间等基本配置;苹果Mac电脑用户如方便请提前使用Bootcamp加装Windows 64位系统);

FreeSurfer下载

(http://www.freesurfer.net/fswiki/DownloadAndInstall)

FSL下载

(https://fsl.fmrib.ox.ac.uk/fsl/fslwiki/)

PANDA下载

(https://www.nitrc.org/projects/panda/)

Matlab 2016a 安装破解教程

(https://blog.csdn.net/u012313335/article/details/73733651/)

学员自己有数据的可以带3-5例进行现场处理。并在4月20日前进行缴费及将回执表发至Cibr_medical@163.com,便于培训安排。

在线支持服务

参加培训学员将得到在线技术支持服务,伴随参加培训班的学员共同成长。

培训人员简介

张柏雯, 北京工业大学生物医学工程在读博士,专注于机器学习方法在大脑磁共振的研究,具有丰富的基于机器学习的医学影像特征处理实践经验。目前主要课题方向为基于深度学习和磁共振影像对大脑认知的疾病及老化的分类与预测研究。已独立完成一项基于结构磁共振和深度学习模型对阿尔兹海默症的分类方法研究,取得了非常理想的分类结果。至今已发表关于大脑磁共振工程方法学研究论文10余篇。硕士期在北京神经外科研究所功能影像磁共振室长期实习,并在此期间完成了多项图像分析任务,对人与动物的脑磁共振最新获取手段及后处理方法具有深入的了解。熟悉深度学习及传统机器学习算法模型原理,擅长matlab、python等编程实践。

崔博士,中国科学院自动化研究所模式识别国家重点实验室脑网络组研究中心,副研究员,硕士生导师。2012年在澳大利亚纽卡斯尔大学获得博士学位,博士毕业后进入中科院自动化所工作。主要研究方向为基于神经影像的脑疾病生物标记识别和影像遗传学研究。在Cerebral Cortex, NeuroImage, Schizophrenia Bulletin, Psychological Medicine等国际权威杂志发表研究论文20余篇,主持和参与多项国家自然基金。

路博士,天津大学,硕士毕业于北京工业大学生物医学工程专业,一直专注于弥散磁共振(DTI)数据分析方法研究及其应用,擅长使用fsl、PANDA等DTI数据处理软件。目前以第一作者已在Frontiers in Neurology、Biomedical engineering online等期刊发表多篇SCI论文,同时也发表多篇中文核心论文。此外,结合机器学习与磁共振图像进行分类方法的研究,已申请软件著作权及国家发明专利。参与多项国家自然科学基金、北京市科技新星基金。

仲博士,北京师范大学认知神经科学与学习国家重点实验室博士后。2016年6月于北京师范大学认知神经科学与学习国家重点实验室获得博士学位。目前主持国家自然科学基金青年项目1项,博士后面上项目1项,并作为主要参与人参与多项国家自然科学基金项目。目前主要从事基于弥散磁共振成像的人脑白质连接组学的方法学及其应用研究。目前已在相关领域国际权威期刊共发表SCI论文13篇,其中包括以第一作者身份在CerebralCortex, Human Brain Mapping等期刊发表论文5篇,以共同作者的身份在the Journalof neuroscience等主流SCI期刊发表论文8篇。参与开发了“弥散磁共振人脑图像的并行处理平台”(软件著作权登记号:2011SR091748;参与者),该软件的相关论文目前已被引用100余次。 PANDA软件工具包已在国际神经影像工具共享平台上(http://www.nitrc.org/projects/panda)被下载16000余次,被国内外同行广泛使用,得到了非常好的反馈和评价。

word版本报名回执单下载链接:

https://pan.baidu.com/s/1OI1VqZ4ovkjmPS1TWB_U4Q 

提取码:yw7h 

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培训信息

第十六届脑电信号数据处理专题培训班

第二届机器学习应用培训班

第二十八届 脑功能磁共振数据处理分析培训班

第一届R语言数据分析与可视化培训班(从入门到提高)

第三届动物磁共振数据处理培训班

科研服务

灌注数据处理服务

EEG/ERP数据处理服务

  • 电数据预处理:使用EEGLAB对Neuroscan、Brain Products、EGI、ANT、Biosemi等主流脑电设备采集的脑电数据进行预处理。

  • ERP成分统计分析:提取ERP成分的波幅和潜伏期,并进行统计分析。

  • EEG频谱分析:使用傅里叶变换的方法计算脑电各个频段的功率,并进行统计分析;使用短时傅里叶变换、小波变换和希尔伯特变换的方法进行脑电时频分析(如ERD/ERS分析、试次间相位同步分析)。

  • 基于sLORETA的脑电源分析:ERP成分源定位;特定频段EEG源定位;源空间的脑功能连通性分析。

  • 功能连通性分析:使用相关、相干、相位锁定值和格兰杰因果分析研究电极之间功能连通性。

近红外数据处理服务

PET数据处理服务

功能磁共振数据处理

  • 任务激活脑区分析

  • 任务态E-prime实验实

  • 功能连接分析

  • 局部一致性(ReHo)分析

  • 低频振幅(ALFF/fALFF)分析

  • 基于图论及ICA的脑网络分析

结构磁共振数据处理

  • 基于VBM的灰白质分析

  • 基于Freesurfer的皮层厚度分析

  • 基于FSL的纤维束追踪

详情联系:13381109780(杨老师)


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