什么套路这么香？图这么少，分这么高！1区15.1分双向MR来了
大家好，我是雪梨~
五月是一个适合表达爱的月份。今天的爱来自少图而高分的双向双样本孟德尔随机：用六种MR分析方法直击免疫系统与精神分裂症发病之间的双向遗传预测关系，在研究精神分裂症病理的路上走了一大步，1区15+拿得当之无愧。
登在Brain, Behavior, and Immunity五月刊上的这篇文献可谓文狠画不多，除了两张展示双向MR结果的表格，就只有一张展示各MR方法优劣的表格、一张研究设计及结果图而已。短小精悍的文献，对我们的好处除了有思路可以快速学习，还有其留下的宝贵未来研究空间。“跟在大佬身后抢到肉吃”，也是一种优秀的能力。
下面就一起来看看吧！
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如果目前不便阅读，可以收藏或者浮窗。
文献背景
Bidirectional two-sample Mendelian randomization study of differential white blood cell counts and schizophrenia
白细胞计数差异与精神分裂症的双向双样本孟德尔随机研究
期刊：Brain, Behavior and Immunity
IF：15.1
文献背景
技术路线
数据收集：收集精神分裂症基因组学联盟和白细胞计数基因组学联盟的GWAS数据，包括精神分裂症样本130,644个和白细胞计数样本563,946个。
数据预处理：从GWAS数据中提取p值小于5e-8的SNPs，进行clumping处理以获取近独立的SNPs。然后进行数据协调，去除同义SNPs和模糊SNPs，并排除F统计量小于10的SNPs。
统计分析：采用多种孟德尔随机化方法分析精神分裂症与不同类型白细胞计数之间的遗传预测关系，包括逆方差加权法、MR Egger法、加权中值法、MR PRESSO法、污染混合法以及混合模型互为因果推断法。
结果分析：分析各孟德尔随机化方法的效应估计值和统计显著性，以及可能的混杂因素、异质性、异常值等。
讨论与结论：根据不同孟德尔随机化方法的一致性，讨论精神分裂症与白细胞计数之间的遗传预测关系，并提出研究结论。
研究背景
来自香港大学李嘉诚医学院临床学院的团队首先把目光放在了精神分裂症病理机制上面。它在很大程度上仍然未知，但有一些假说与免疫系统有关。早期对欧洲样本精神分裂症基因组研究的荟萃分析以及在中国人群中复制的结果表明，一个极具影响力的单核苷酸多态性（SNP）rs2021722与精神分裂症密切相关，它位于TRIM26基因区域，参与免疫相关通路。流行病学证据显示，母亲产前的免疫反应以及儿童期的感染与精神分裂症有显著关联，这可能是通过免疫相关机制介导的。此外，Tylee 等人（2018）报告了精神分裂症与各种免疫相关疾病（如克罗恩病、原发性胆汁性肝硬化、系统性红斑狼疮和溃疡性结肠炎）之间的全基因组遗传相关性。
团队在免疫相关机制方面再进一步。白细胞计数（WBC）是感染、炎症、免疫、过敏和血液学疾病的常规指标，白细胞升高与全因死亡率升高有关。虽然白细胞会因外部因素波动，但这些标志物也显示出可遗传的个体差异。淋巴细胞、单核细胞和中性粒细胞计数的遗传率估计分别为 58%、58% 和 41%。
几项荟萃分析表明，首发精神病和慢性精神分裂症患者的淋巴细胞、单核细胞和中性粒细胞升高，且中性粒细胞/淋巴细胞比率（NLR）持续升高。
研究结果
Table1
雪梨关心你看了一天文献累不累
所以翻译了一遍
Table1 所选MR方法的假设、优势和劣势
Table2
Table2 精神分裂症对白细胞计数差异的MR结果
β系数以 IVW、MR Egger、加权中位数、MR-PRESSO 和污染混合物中白细胞计数差异绝对值增加的标准差为单位解释。
Table3
Table3 白细胞计数差异对精神分裂症的 MR 结果
在 IVW、MR Egger、加权中位数、MR-PRESSO 和污染混合物中，β 系数以对数几率为单位解释；在 MRCI 中，β 系数以责任标度为单位解释。
Figure1
Figure1 研究设计与结果概要
总结
这项MR研究在两个大型数据集上利用多种MR方法，进项双样本MR分析得出的结果初步证明，淋巴细胞计数升高与精神分裂症发病风险之间存在双向遗传基因预测关系。
此外，一些证据还显示，精神分裂症与单核细胞数之间存在双向遗传预测关系，嗜酸性粒细胞数的遗传责任对精神分裂症的影响是单向的，精神分裂症的遗传责任对中性粒细胞数的影响也是单向的。精神分裂症对嗜酸性粒细胞计数的影响则不太确定。
快速发展的MR和GWAS方法有望增进我们对精神分裂症与白细胞等免疫活性生物标志物之间关系的了解。
本篇文献的局限性分析非常精彩，涉及GWAS研究的限制、“真实暴露”、MR方法权重等，推荐下载精读
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