数据集不好，满配分析也容易竹篮打水一场空！盘点那些不能用的数据集

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上期需要“拉黑”的数据集对你有帮助吗？本期继续带来没有解决方法、可以直接弃用的部分数据集（GEO）！能够通过一些操作及时解决的问题数据集，将在今后的更新中为大家说明。如果你在研究过程中发现了其他暗藏雷区的数据集，欢迎在文末留言和大家交流喔~！

拉黑原因包括：无差异基因、加药/特殊处理。

GSE185952

GPL平台：GPL30862

疾病类型：甲状腺相关眼病 Thyroid-Associated Ophthalmopathy（TAO）

问题原因：无差异基因

该数据集的p adj.>0.05，无法使用。

GSE92681

GPL平台：GPL16956

疾病类型：牙髓炎 Pulpitis

问题原因：无差异基因

该数据集的p adj. >0.05，无法使用。

GSE44593

GPL平台：GPL570

疾病类型：重度抑郁症 Major Depressive Disorder（MDD）

问题原因：无差异基因

UMAP聚类无法将疾病/对照组测序数据区分出来。

GSE68183

GPL平台：GPL16686

疾病类型：糖尿病足溃疡 Diabetic Foot Ulcers（DFU）

问题原因：无差异基因

样本来源于不同分组但无差异，在数据集GSE80178被整体用作对照组。

GSE20194

GPL平台：GPL96

疾病类型：乳腺癌 Breast Invasive Carcinoma （BRCA）

问题原因：加药处理

患者接受6个月的术前 (新辅助) 化疗，对术前化疗的反应被归类为病理学完全反应并用作预测的终点D。

GSE42568

GPL平台：GPL570

疾病类型：乳腺癌 Breast Invasive Carcinoma（BRCA）

问题原因：加药处理

50例患者接受辅助全身化疗（CMF/-阿霉素）。

GSE9103

GPL平台：GPL570

疾病类型：肌少症 Sarcopenia

问题原因：加药处理

受试者在试验期间需要输注葡萄糖以维持正常血糖。参考文献PMID：18716044

GSE107850

GPL平台：GPL14951

疾病类型：胶质母细胞瘤 Glioblastoma （GBM）

问题原因：特殊处理

样本做过放疗，参考文献PMID：34362400

该文献研究了放疗和放疗+TMZ治疗患者的生存情况。

GSE87211

GPL平台：GPL13497

疾病类型：Rectal Cancer （READ）直肠癌

问题原因：特殊处理

样本做过放疗，参考文献PMID：29119627

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