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三行搞定GSVA分析


果不其然,昨天的推送阅读完成率不到50%:文献阅读系列(九)、一文了解GSVA原理
大篇幅的原理介绍确实容易让人脑溢血,那我必然知道大家喜欢的是什么,上一次的三行搞定还是:三行命令搞定热图。三行奉上(两行都花在读数据上了):
myexpr <- read.csv('myexpr.csv')my.gene.set <- readRDS('my.gene.set.rds')myresult <- GSVA::gsva(myexpr,my.gene.set)
得到的结果如下:



如果你也想自己试试的话,测试文件在这里,如果过期了可以添加我的qq领取。

链接:https://pan.baidu.com/s/1BHbrBgElbqmPrRd4xi3vFQ?pwd=a5ec

提取码:a5ec



下一篇推送主要来教大家如何详细的通过代码实现GSVA,以及GSVA得到的结果又可以进行如何的下游分析,0点准时更。


最近发现后台中有一些消息我没能及时看到并答复,微信后台中超过48h后便不允许回复读者消息,这里还是再给大家留一下答疑的扣扣号,方便大家随时交流:1913507043。


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