lncRNA研究大神，看看你都认识谁？

关于lncRNA有道不尽的话题，特别是近几年来国内各大单位都涌现出很多的大牛，在lncRNA研究方向上独树一帜。下面我们通过中科院生化细胞所陈玲玲的一篇综述《Research Progress of Long Noncoding RNA in China》看看这些年在lncRNA这个方向出现的大神，看看有没有你老板呢？

先看整体趋势，下图是lncRNA研究领域全世界和中国的文章发表数量和分数统计结果：

我们看到从1989年到2000年，乃至2001-2005年这段时间里面，对lncRNA的研究相对比较平静；对lncRNA的研究从2006年开始进入快速增长期，随后不管是文章数量还是文章分数都大幅增长；到2015年，全世界一年文章有1302篇，我们就占到了一半656篇；不过高分文章的比例就显著减少了，4分以上的文章我们占到了大约1/3,10分以上的文章我们只占到大约1/6左右，这也基本反映了我们国家在lncRNA研究领域的现状：追热点所以文章多，但高分文章比率只有世界平均水平的一半。

另外，从表中我们可以看到：中国的第一篇10分以上的文章出现在2011年，是二军大孙树汉教授发表在hepatology上的文章[Long non-coding RNA high expressed in hepatocellular carcinoma (lncRNA-HEIH) facilitates tumor growth through enhancer of zeste homolog 2. Hepatology, 2011]，从此以后10分以上高质量文章的数量就开始以指数增长，2015年已经达到了18篇，增速显著。

下面我们从这篇综述的作者中科院生化细胞所陈玲玲开始说起，

我们知道在10月26日的Mol Cell刊登了陈玲玲组的一篇文章：“Unusual Processing Generates SPA LncRNAs that Sequester Multiple RNA Binding Proteins”，报道发现了一种新型的RNA转录加工产物：SPA及其分子机制。SPA是一种新型的lncRNA，它的5’端为snoRNA，3’端为Poly(A)。文中系统分析了SPA形成机制，分子细胞生物学作用机制并探讨了PWS病人中SPA如何发挥作用的，文章的内容我们下次再介绍。

陈玲玲教授主要从事RNA编辑和长非编码RNA对基因表达调控和干细胞命运决定的分子机制研究。现任上海生命科学院生物化学与细胞生物学研究所研究员，研究组长。

接下来，我们继续看这篇综述中提到的国内lncRNA研究的专家，并根据文章提到的顺序和领域进行简单介绍，看看大牛研究的哪些内容、有什么样的成果、研究的方向是什么？不要眨眼哦，因为您今年写关于lncRNA的国自然基金项目，很有可能明年就落在他们的手里呢。

干细胞多能性和分化

北京大学-汤富酬

汤富酬教授实验室主要围绕人类早期胚胎发育、研究多能干细胞的自我更新能力和多能性调控的分子机理，特别是表观遗传学调控机理，以及相关的原始生殖细胞发育过程中的表观遗传学重编程机理。

综述中介绍了汤富酬教授文章“DNA methylation signatures of long intergenic noncoding RNAs in porcine adipose and muscle tissues”所做的工作，团队通过单细胞测序分别分析了100多个人植入前胚胎和人胚胎干细胞，共检测到了8701个lncRNAs，该研究为后期对早期胚胎发育过程lncRNA的研究提供了重要参考。

二军大-刘厚奇

刘厚奇教授是第二军医大学发育生物学研究中心主任，组织胚胎学教研室主任，开展人干细胞的分化机制与临床疾病治疗的基础与应用研究。

综述中介绍了刘厚奇教授文章“Endogenous miRNA sponge lincRNA-RoR regulates Oct4, Nanog, and Sox2 in human embryonic stem cell self-renewal. ”所做的工作，团队发现了在人胚胎干细胞中，lincRNA-ROR通过吸附miRNAs，保护核心转录因子Oct4, Sox2, Nanog避免被miRNAs所抑制，从而保持干细胞的自我更新。

清华大学-沈晓骅

“973首席科学家”沈晓骅

“We mainly use embryonic stem cells (ESCs) as a cellculture model to characterize epigenetic networks centered on protein-DNA-RNA interactions during ESC differentiation towards different lineages and to understand transcription regulations mediated by transcription factors,epigenetic regulators, lncRNAs and RNA-binding proteins in cell-fatedetermination. ”

综述中介绍了沈晓骅教授文章“Opposing roles for the lncRNA Haunt and its genomic locus in regulating HOXA gene activation during embryonic stem cell differentiation.”所做的工作。团队阐述了在老鼠胚胎干细胞分化时，lncRNA-Haunt及其DNA序列调控HOXA基因活性。虽然干扰Haunt能上调HOXA表达，但切除Haunt基因位点的大段序列则HOXA的表达也下降，且这个结果不能通过表达Haunt进行rescue。这表明Haunt、Haunt的DNA、其转录本都参与调控邻近基因HOXA的表达。

昆明动物所-张亚平

张亚平院士主要从事基因组多样性研究。近期研究重点是动物基因组进化与适应进化的遗传机制，家养动物基因组及人工驯化遗传机制，动物与人的遗传多样性等。 

综述中介绍了张亚平院士文章“DNA methylation signatures of long intergenic noncoding RNAs in porcine adipose and muscle tissues.”所做的工作。团队通过分析MeDIP-seq数据库，对猪脂肪、肌肉组织中的编码lncRNA和蛋白的DNA甲基化程度进行分析，发现编码lncRNA的DNA甲基化程度要高。

肿瘤发生和转移

二军大-孙树汉

孙树汉教授现任“遗传学”国家重点学科主任、全军医学分子遗传学重点实验室主任、第二军医大学“211”工程重点建设学科医学遗传学教研室主任，第二军医大学遗传研究所所长。主要研究方向有临床遗传学（出生缺陷发生机制及诊治）、医学遗传学（复杂性疾病表观遗传学调控）、军事生物工程（重组疫苗理论与应用研究）。

孙教授团队发现了多条参与HCC发展的lncRNAs，综述中介绍了孙教授多篇文章的研究成果。比如，文章“Long noncoding RNA high expression in hepatocellular carcinoma facilitates tumor growth through enhancer of Zeste Homolog 2 in humans.”中，lncRNA-HEIH在肝癌中高表达，通过结合EZH2来调控细胞周期，并抑制EZH2调控的大量基因的表达。

二军大-周伟平

综述中介绍了周伟平教授文章“Long noncoding RNA associated with microvascular invasion in hepatocellular carcinoma promotes angiogenesis and serves as a predictor for hepatocellular carcinoma patients’ poor recurrence-free survival after hepatectomy.”所做的工作，周伟平团队发现了一条lncRNA-MVIH，作为肝脏切除手术后无瘤生存期的标志物。在HCC中， MVIH能结合PGK1抑制后者分泌，从而抑制肿瘤诱导的血管新生激活机制。

中科院-范祖森

范祖森课题组从事免疫细胞发育分化、肿瘤干细胞、肿瘤靶标发现与肿瘤个体化治疗等领域的研究，主要研究方向为免疫细胞谱系建立的信号转导、抗肿瘤免疫机制、肿瘤干细胞鉴定及干预机制、肿瘤新靶标的鉴定与肿瘤靶向药物研发。

综述中介绍了范祖森教授文章“The long noncoding RNA IncTCF7 promotes self-renewal of human liver cancer stem cells through activation of Wnt signaling. ”所做的工作，范祖森教授团队发现lncRNA-TCF7能结合SWI/SNF复合物，并且能招募该复合物到TCF7基因的启动子区，导致TCF7基因激活，增强Wnt信号通路，从而促进肝癌干细胞自我更新、HCC增殖。

中山大学-宋尔卫

宋尔卫教授主要围绕乳腺癌等恶性肿瘤转移开展研究，在非编码RNA（ncRNA）和肿瘤微环境调控癌细胞可塑性与肿瘤转移领域取得了系统性的创新成果。

综述中介绍了宋尔卫教授文章“A cytoplasmic NF-kappa B interacting long noncoding RNA blocks I kappa B phosphorylation and suppresses breast cancer metastasis.”所做的工作，宋尔卫教授团队报道了一条在乳腺癌中由NF-kB诱导的lncRNA-NKILA，能通过遮蔽IKB磷酸化修饰位点，阻遏由IKK诱导的IkB磷酸化作用，从而抑制乳腺癌转移。

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中国科技大学-吴缅

吴缅课题组，主要研究方向为p53与肿瘤代谢、 非编码RNA与肿瘤、ips分子调控机制。

综述中介绍了吴缅教授文章“Reciprocal regulation of HIF-1 alpha and LincRNA-p21 modulates the Warburg effect.”所做的工作，吴缅教授团队报道了一条由缺氧诱导的lncRNA-p21。p21能结合HIF-1a、VHL，从而抑制HIF-1a与VHL，使得HIF-1a免于被VHL泛素化降解，从而使得HIF-1a积累，促进肿瘤微环境中的糖酵解作用。

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三军大-曾春雨 

曾春雨教授从事心血管专业临床、教学和科研工作10余年，主要从事“高血压、冠心病”的临床和基础研究工作。

综述中介绍了曾春雨教授文章“LincRNA p21 regulates neointima formation, vascular smooth muscle cell proliferation, apoptosis, and atherosclerosis by enhancing p53 activity.”所做的工作，曾春雨团队发现LincRNA p21通过保护p53蛋白避免受到泛素化连接酶MDM2降解，调节内膜增生、血管平滑肌细胞增殖、凋亡和动脉粥样硬化。

二军大-王红阳

综述中介绍了王红阳院士文章“Exosome-transmitted lncARSR promotes sunitinib resistance in renal cancer by acting as a competing endogenous RNA.”所做的工作，王院士团队发现在苏尼替尼耐药RCC细胞中，lncARSR通过竞争性结合miR-34、miR-449促进苏尼替尼耐药，并能上调AXL、c-MET表达，激活STAT3、AKT、 ERK（存活）通路。另外，激活AKT能诱导FOXO1、FOXO3a磷酸化-降解，其结果导致lncARSR在转录上去抑制，从而形成了一个正向反馈回路。另外，lncARSR可以被包进外泌体中，并且可以由苏尼替尼耐药的RCC细胞分泌，传播耐药性到受体细胞中。

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北京协和-林东昕

林东昕教授研究方向包括致癌物代谢、DNA修复、细胞周期和凋亡控制、肿瘤免疫等系统的基因遗传变异与肺癌、食管癌、胃癌、乳腺癌、结-直肠癌等常见肿瘤发生和发展的关系。

综述中介绍了林东昕教授文章“Pancreatic cancer risk variant in LINC00673 creates a miR-1231 binding site and interferes with PTPN11 degradation.”所做的工作，林教授团队发现LNCR00673能增强PTPN11与PPF19结合，从而促进PTPN11泛素化降解。低水平的PTPN11能抑制SRC/ERK促癌信号通路，激活胰腺癌中STAT1依赖的抗肿瘤应答机制。但LNCR00673第四号外显子rs11655237位置碱基由G突变为C，结果导致该lncRNA靶向miR-1231，最终lncRNA降解，从而促进胰腺癌肿瘤生长。

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免疫细胞分化和功能

二军大-曹雪涛

曹雪涛院士在免疫学方面的成就有目共睹，那么结合从lncRNA角度来看他有哪些发现呢。

综述中介绍了曹院士文章“The STAT3-binding long noncoding RNA lnc-DC controls human dendritic cell differentiation.”所做的工作，曹院士团队报道了一条只在人DC细胞中表达的lncRNA-DC，该lncRNA通过直接结合转录因子STAT3，调控人DC细胞的分化。该结合作用，保护了STAT3免于被下游分子结合，从而促进了STAT3第705位酪氨酸磷酸化。

中山大学-曾谷城

曾谷城教授的研究方向为感染性疾病免疫机理。综述中介绍了曾谷城教授文章“

Long noncoding RNA derived from CD244 signaling epigenetically controls CD8(1) T-cell immune responses in tuberculosis infection. ”所做的工作，曾教授团队发现在肺结核感染中，lncRNA-CD244作为T细胞免疫应答调控分子，富集EZH2介导infg/tnfa基因位点的H3K27me3，抑制CD8+T 细胞中IFN-c/TNF-a的表达。

中科院-陈吉龙

陈吉龙教授的研究方向为抗病毒免疫、肿瘤免疫与肿瘤生物学。研究内容包括以下几方面：抗病毒免疫的信号转导通路与抗病毒的细胞免疫机理；病毒与癌基因诱发肿瘤发生的分子机制；肿瘤发生的信号转导通路。

综述中介绍了陈吉龙教授文章“NRAV, a long noncoding RNA, modulates antiviral responses through suppression of interferon-stimulated gene transcription. ”所做的工作，陈教授团队在感冒病毒感染的细胞中发现了一条lncRNA-NRAV，NRAV能表观抑制由干扰素刺激的基因，促进感冒病毒的复制与毒性。

由于篇幅有限，综述中介绍的其他大神我们就不一一介绍了，综述下载链接： https://pan.baidu.com/s/1hrPHiyK 密码: kjrp

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