CNS都在用的图片分析工具，你造嘛？

众所周知，CNS文章中的图片颜值都是杠杠滴，比如下面这个心脏血管的图片。

Nature 522, 62–67 (04 June2015)（doi:10.1038/nature14483）心脏血管

颜值是有了，但是要如何定量分析血管网络呢？PS手动设置路径进行测量？那你试试下面这图？

Elife. 2017 Apr 11;6.pii: e24419. （doi:10.7554/eLife.24419）视网膜血管

       血管网络的定量分析使用手动分析肯定是非常不靠谱的！既浪费了大量的时间，分析结果又不准，误差大。

今天阿牛就给各位带来一款界面友好、免费获取的能够进行全面血管网络分析的实用小工具——AngioTool。AngioTool可以测量一系列形态学指标和空间参数，例如血管网络的总体大小，血管的总长度或平均长度、血管密度、孔隙率（反映血管的不均匀性）以及分支指数（分支总数/血管网络分布面积）。

如何获取AngioTool？

AngioTool可在https://ccrod.cancer.gov/confluence/display/ROB2/Home免费下载。可根据需要下载Windows 32/64位的软件，安装即可。

如何使用AngioTool？

Step1：

打开安装好的AngioTool，界面如下：

界面非常简洁，最上方式Open Image（打开图片），Run analysis（开始分析），Exit（退出），点击Help可以查看软件的简明使用指南。Analysis下可以设置分析的参数：待分析血管的直径、强度；需要移除的小粒子的大小，填充孔。最下面SavingPreferences选择保存位置，选择保存分析结果。

Step2：

打开分析图片：

在Setting下可以看见打开图片颜色标识的意义：

Step3：

调整待分析血管的直径和强度（根据实际情况调整）：

Step4：

点击Run analysis（开始分析），得到分析结果：

除了得到分析的图片外还可以得到一个Resultsexcel表格：

结语

AngioTool可以便捷地用于不同血管网络的分析：

再复杂的网络也是难不倒它的！

其它已发表文章举例：

NatureProtocols 9, 1514–1531 (2014)（doi:10.1038/nprot.2014.102）

NatureProtocols 8, 418–429 (2013)，（doi:10.1038/nprot.2013.015）小鼠胚胎后脑血管发育

AngioTool就介绍到这里了，希望对大家有所帮助！

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