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如何快准狠查找抗体

沐言 小张聊科研 2021-02-21

抗体是一种由浆细胞(效应B细胞)分泌,被免疫系统用来鉴别与中和细菌、病毒等的大型Y型蛋白质。


使用抗体的常见实验:

Western  blot

蛋白质变性,抗体识别线性表位

IHC/ICC/IF

蛋白质固定后经过修复,表位可恢复,抗体识别线性表位/构象表位

ELISA/FACS(表位)/Co-IP

蛋白质处于天然状态,抗体识别线性表位/构象表位

ChIP

蛋白质经过固定处理,部分表位可能被掩盖或发生变化,抗体识别线性表位/构象表位

在多种实验中,都要用到抗体,事实上你对你的抗体了解吗?


一、抗体结构


基本结构都由两部分组成,即包含有特异性结合抗原位点的Fab段和相对保守的Fc段,抗体的特异性表现在Fab段,标记时利用Fab段的抗原结合位点与细胞上抗原分子特异性结合,

             

              

根据Fab的不同,抗体可以分为以下5类:其中以lgG为主


二、一抗和二抗的区别


一抗即第一抗体:就是能和特异性抗原特异性结合的蛋白,包括单克隆抗体和多克隆抗体。


二抗即第二抗体:能和一抗结合,即抗体的抗体,是利用一抗的Fc段(恒定区,每个种属的Fc段都相同)去免疫异种动物,由异种动物的免疫系统产生的针对此抗体的免疫球蛋白,起放大一抗信号的作用。



三、单抗与多抗的区别


单抗即单克隆抗体:抗原通常是由多个抗原决定簇组成的,由一种抗原决定簇刺激机体,由一个B淋巴细胞接受该抗原刺激所产生的抗体称之为单克隆抗体。其制备过程:经过特定抗原处理过的B淋巴细胞与骨髓瘤细胞通过细胞融合,得到杂交瘤细胞,经KAT培养基筛选得到阳性克隆,然后进行细胞培养、纯化得到单克隆抗体。


多抗即多克隆抗体:由多种抗原决定簇刺激机体,相应地就产生各种各样的单克隆抗体,这些单克隆抗体混杂在一起就是多克隆抗体。其制备过程:将抗原直接注入到动物体内进行免疫,经过3-4次免疫后,ELISA测定效价合格后,收集血液离心得到上清,纯化后就得到多克隆抗体。



二者优缺点总结:


优点

缺点

多抗

亲和性比单抗高;

无表位被掩盖的顾虑

放大低表达靶蛋白的信号

引入较高的背景信号

存在批次差异

单抗

单抗的特异性高,杂带少;

在一段时期内较为稳定

有表位被掩盖的顾虑

 


四、如何快、准、狠查找自己需要用的抗体


1、看跟自己研究领域相关的文献,从材料方法里找所用试剂的信息。

2、从网站上查询,这里给大家安利几个网站

(1)CiteAb,https://www.citeab.com/

CiteAb号称是世界最大的抗体搜索引擎,其特色是搜索结果可根据抗体被引用的文献次数来排序。一般引用越多的产品,质量往往越有保障。

网址界面如下:

以β-catenin为例,进行搜索:出来很多关于该抗体的信息,也包括引用文献次数最多的厂家及产品信息,大家可以根据需要自行选择。

(2)The HumanProtein Atlas, https://www.proteinatlas.org/


这个网站是人类蛋白质组学的数据库网站,其中提供了部分人类抗体测试数据。网址界面如下:

还是以β-catenin为例,进行搜索:


(3)此外,还有一个网站http://compbio.med.harvard.edu/antibodies/


主要是提供部分组蛋白修饰抗体的验证数据,适用于表观遗传学的研究。


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