一个博士生该掌握那些工具(武器)？
文献管理
EndNote 或 RefWorks 至少要会一个；
配合百度学术或谷歌学术，最好注册一个账号，以便自动记录检索历史；
要学会配合使用
EndNote+百度学术+Word。知识管理和文献梳理
可以使用思维导图。在 知乎 中搜索关键词【思维导图】会有很多相关的讨论。
统计软件
Stata，R，Matlab至少会用一个。如果准备做量化或者基金之类的，也可以抽空学学
Python。具体学哪个，还要看你的最终用这些武器干啥
写作和排版
Word 必须要学会，且能熟练排版出符合要求的文稿，可以看看侯捷先生的经典著作Word的排版艺术。
有时间，可以学学 LaTeX，即使不用，也可以大幅提高你的审美能力。很多不是不想做好排版，而是不到什么是【美】。
日常记录
简书。可以注册一个简书账号(在线写，实时保存，随时随地可以查看修改)。看到好文可以一键分类收藏，形成自己的专辑。
有道云笔记。或为知笔记，或印象你笔记，功能都差不错，主要是实现多设备云平台写作，自动同步，随时写入，摘录网页和文献等。允许多人协作编辑文档。
Markdown
Markdown 一种简单的标记语言，让你在写作的同时不用纠结排版问题。花两个小时就能学会，上述在线笔记都支持 Markdown。
Markdown 的最大好处是一种输入，多种输出。可以将 Markdown 文档直接贴入简书编辑器，后者会自动转化成美观的网页。
也可以将 Markdown 文档转化为 Word 或 PDF 文档。Stata 官方和用户提供了多个命令用于支持 Markdown 文档，如
dydoc,markdown,markstat,markdoc等。我的做法
我平时主要使用有道云笔记记录一些想法、文献摘要、网页摘录、新学到的东西等等。
可以随时在电脑上，手机上，IPAD 上记录，支持语音录入。
可以直接讲分享链接发给同学或老师，他可以直接存入自己的有道笔记中。也支持多人协作编辑。
若是使用 Markdown 格式书写，贴入简书或知乎（使用 Markdown Here 插件渲染）即可分享给大家。
几个提高效率的小软件和技巧
Everything。可以快速查询电脑中的文件，速度非常快。
Q-dir。多窗口文件管理。
设置搜狗拼音输入法的【自定义短语配置】功能，大幅提高输入效率。