代办生物信息学服务器

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代办服务器啦！！！

理论上我们平常使用的个人计算机在硬盘，内存，cpu方面的配置是不适合做生物信息学数据分析的。一般的组学测序数据仅仅一个样本的大小就在10~500G，而且很多软件运对内存要求很高，数据的分析过程又非常耗时。所以建议使用配置比较高，安装有linux系统的服务器。

• 个体户使用：人民币2万左右，可以配置16线程+64G内存+16T硬盘

• 3到20人课题组：人民币10~50万，可以配置64线程+512G内存+64T硬盘

• 20人以上的多个课题组：一般是学校的超算中心有专门的IT来负责服务器

一般我们对服务器进行操作都是通过个人电脑远程登录到服务器，然后在上面执行各种各样的数据处理命令。 如果是windows电脑，那么建议安装winscp+xshell来连接服务器。 如果是MAC电脑，建议用自带的终端，文件传输可选择FileZilla软件。

而生信领域所涉及的计算往往是非持续性的，比如RNASeq中计算量较大的就是比对步骤了，而比对往往只需要一次就可以！ 更多的时间其实耗费在下游分析注释，以及挑选可以供讲生物学故事的结果。

这导致配备了一台豪华服务器使用率缺很低，用更少的钱做更多的事，配置一台可用于生物分析的PC机！ 

以下配置适用于生物信息实验室、学校、研究所，没有专业机房和运维人员，服务器使用率不高，经费有限等场景下。

不过，不差钱的豪门请回避~

配置一1套餐一

   16线程 + 32g内存 + 16T硬盘 ==> 2.2万

2套餐二

   16线程 + 64g内存 + 32T硬盘 ==> 3万

配置二
1套餐三

   32线程 + 32g内存 + 16T硬盘 ==> 2.6万

2套餐四

   32线程 + 64g内存 + 32T硬盘 ==> 3.4万

配置三

1套餐五

   64线程 + 128g内存 + 32T硬盘 ==> 4.9万

2套餐六

   64线程 + 256g内存 + 32T硬盘 ==> 5.8万

划重点

完善的生物信息学配置  

 >  生信基本编程环境：java, python, perl, c++, R

 >  生信基础软件：fastqc, samtools, bcftools, vcftools, bedtools, blast, sra-toolkit

 >  全外显子数据处理相关软件：bwa, GATK, freebayes, delly, cnvkit, varscan, sequenza

 >  转录组数据处理相关软件：hisat2, tophat2, subreads, salmon, rMATs, STAR

 >  ChIP-seq数据处理相关软件：macs2, deeptools, homer, meme

相信大家有了上面我精选制作分析的服务器配件清单，如果有能力的话可以去京东逐个挑选然后组装使用，当然需要安装ubuntu18系统，还有下载几十个生物信息学相关软件以及100~500G的生物信息学数据库文件。

PS ：这里很有必要指出下载这些数据库文件在大陆来说是非常困难的事情，稍微有经验的朋友都知道GEO/SRA，NR/NT等数据库下载都是龟速。所以我前些天才会打包这些数据到硬盘送给有需要的朋友：

如果你觉得这些事情很麻烦，那么恭喜你咯，现在有一步到位的选择！

直接联系我们哈！

按照上面的配置整机配置好之后打包寄出，明码标价，京东可查，有需要的朋友，加我微信下单： 招学徒  (微信在这个宣传推文里面)