实习生(生物信息学知识体系的建立)招募
我们公众号一直在给朋友(研究单位课题组或者公司)做宣传,有需要实习生,工程师的,博士后的,上一期在昨天发布,是: 人才招聘 | 中科院深圳先进技术研究院赵国屏课题组招聘
是时候给我们生信技能树自己宣传一波了!
现招募实习生,将会在我的指导下参与生物信息学知识体系的建立,基于前期已经设计好了全面而系统的知识体系,比如下面这个体系节选:
生信基础知识掌握
生物芯片和测序技术的分类,原理及历史,需要自行查找归纳总结
按照公司来区分:affymetrix,agilent和illumina,还有罗氏
按照应用来区分,表达芯片,基因分型芯片,拷贝数芯片
其它定制化芯片
1.5.1 Illumina
1.5.2 SOLID
1.5.3 Roche 454
1.5.4 lon Torrent
1.5.5 Pacific Biosciences
1.5.6 纳米孔技术
主要的测序平台
主要的芯片平台
3大国际数据中心的了解,NCBI,ENSEMBL,UCSC
https://www.ebi.ac.uk/ena
https://www.ebi.ac.uk/arrayexpress/
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/sra
了解每个数据中心的子数据库单元
了解数据上传的4个地方,NCBI的GEO和SRA, EBI的ENA和arrayexpress
数据格式的整理和熟记,包括fastq,fasta,sam,bam,vcf,gff,gtf,bed,MAF
http://www.biotrainee.com/thread-42-1-1.html
参考基因组的熟悉及其基因组注释新文件下载及摸索
从基因开始理解生物信息学
GF生长因子及其受体家族系列
人体基因数量,分类,基因结构等等
genecard数据库
熟记部分基因
组学技术应用的第一篇文章以及最新综述文章收集整理
各个组学数据分析的结题报告的阅读及整理
数据库的收集整理,包括
http://snpeff.sourceforge.net/download.html
http://annovar.openbioinformatics.org/en/latest/user-guide/download/
https://asia.ensembl.org/info/docs/tools/vep/script/vep_cache.html
遗传变异资源
TCGA
ENCODE
GTEx
基因集注释数据库:GO terms/Pathway (KEGG, BIOCARTA,Reactome) MSigDB,主要理解基因集的定义
特此招募实习生2名,请直接发邮件写清楚你的实习需求,然后附上简历给生信技能树boss即可,邮箱地址是: jmzeng1314@163.com 展现你的热情(简历及项目经验)吧!!!
工作地点:广东省珠海市横琴新区横琴小镇
福利:可以免费参加每周末的各路生信牛人给学员及学徒的小班教学授课
工作内容:根据我构建的生物信息学知识体系来系统性整理收集资料。
要求:实习期 > 3个月,来信请详细描述你的职业或者学业规划
福利:免费住宿+不定期餐补(与jimmy共进晚餐)还可以和优秀学徒或讲师、实习生面对面接触,一起学习:
全国巡讲约你
第1-11站北上广深杭,西安,郑州, 吉林,武汉,成都,港珠澳(全部结束)
一年一度的生信技能树单细胞线下培训班(已结束)
全国巡讲第12站-北京(下一站杭州)(已结束)