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实习生(生物信息学知识体系的建立)招募

生信技能树 生信技能树 2022-06-06


我们公众号一直在给朋友(研究单位课题组或者公司)做宣传,有需要实习生,工程师的,博士后的,上一期在昨天发布,是: 人才招聘 | 中科院深圳先进技术研究院赵国屏课题组招聘

是时候给我们生信技能树自己宣传一波了!

据不完全统计,我在生信技能树/生信菜鸟团的1.3万篇教程,至少有1427篇数据分析实战教程直接或者间接的帮助学员或者工作岗位,完成项目,找到课题,或者搞定基金/SCI文章!我有一个梦想,把生物信息学技能传授给10万人,希望有你!

现招募实习生,将会在我的指导下参与生物信息学知识体系的建立,基于前期已经设计好了全面而系统的知识体系,比如下面这个体系节选:


生信基础知识掌握 


  • 生物芯片和测序技术的分类,原理及历史,需要自行查找归纳总结

    • 按照公司来区分:affymetrix,agilent和illumina,还有罗氏

    • 按照应用来区分,表达芯片,基因分型芯片,拷贝数芯片

    • 其它定制化芯片

      • 1.5.1 Illumina

      • 1.5.2 SOLID

      • 1.5.3 Roche 454

      • 1.5.4 lon Torrent

      • 1.5.5 Pacific Biosciences

      • 1.5.6 纳米孔技术

    • 主要的测序平台

    • 主要的芯片平台

  • 3大国际数据中心的了解,NCBI,ENSEMBL,UCSC

    • https://www.ebi.ac.uk/ena

    • https://www.ebi.ac.uk/arrayexpress/

    • https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/

    • https://www.ncbi.nlm.nih.gov/sra 

    • 了解每个数据中心的子数据库单元

    • 了解数据上传的4个地方,NCBI的GEO和SRA, EBI的ENA和arrayexpress

  • 数据格式的整理和熟记,包括fastq,fasta,sam,bam,vcf,gff,gtf,bed,MAF

    • http://www.biotrainee.com/thread-42-1-1.html

  • 参考基因组的熟悉及其基因组注释新文件下载及摸索

  • 从基因开始理解生物信息学

    • GF生长因子及其受体家族系列

    • 人体基因数量,分类,基因结构等等

    • genecard数据库

    • 熟记部分基因

  • 组学技术应用的第一篇文章以及最新综述文章收集整理

  • 各个组学数据分析的结题报告的阅读及整理

  • 数据库的收集整理,包括

    • http://snpeff.sourceforge.net/download.html

    • http://annovar.openbioinformatics.org/en/latest/user-guide/download/

    • https://asia.ensembl.org/info/docs/tools/vep/script/vep_cache.html

    • 遗传变异资源

      • TCGA

      • ENCODE

      • GTEx

    • 基因集注释数据库:GO terms/Pathway (KEGG, BIOCARTA,Reactome)  MSigDB,主要理解基因集的定义

特此招募实习生2名,请直接发邮件写清楚你的实习需求,然后附上简历给生信技能树boss即可,邮箱地址是: jmzeng1314@163.com 展现你的热情(简历及项目经验)吧!

工作地点:广东省珠海市横琴新区横琴小镇

福利:可以免费参加每周末的各路生信牛人给学员及学徒的小班教学授课

工作内容:根据我构建的生物信息学知识体系来系统性整理收集资料。

要求:实习期 > 3个月,来信请详细描述你的职业或者学业规划

福利:免费住宿+不定期餐补(与jimmy共进晚餐)

还可以和优秀学徒或讲师、实习生面对面接触,一起学习:


全国巡讲约你

第1-11站北上广深杭,西安,郑州, 吉林,武汉,成都,港珠澳(全部结束)

一年一度的生信技能树单细胞线下培训班(已结束)

全国巡讲第12站-北京(下一站杭州)(已结束)

全国巡讲第14、15站-兰州和贵阳(生信入门课全新改版)



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