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学徒数据挖掘代码打包

生信技能树 生信技能树 2022-06-07
其实公共数据库挖掘仅仅是你科研课题的前戏,避免你重复浪费科研经费去做一些明明可以通过分析公共数据库拿到的结论。
比如你研究的癌症里面哪些基因高表达,哪些低表达,你通过数据挖掘拿到了感兴趣基因,后续自己设计基础实验来探索它们,完善你的生物学故事。假如你并不知道可以分析公共数据库,那么你就不得不自己去做一次癌症病人队列的转录组,耗费几万块钱来拿到一个本来就可以通过公共数据库分析拿到的上下调基因。
或者说,你已经有了比较完整的生物学故事,定位到了具体的通路或者基因,如果想设计病人队列来说明你感兴趣的基因或者通路的临床意义,就是一个大工程,从病人招募信息整理,到ngs组学数据采集,分析,统计可视化等等。但是大概率上你感兴趣的疾病都会有现成的公共数据,你完全可以选择从你感兴趣的角度来对它进行分析!
所以我安排比较有空的学徒做了一系列的文献图表复现,也断断续续坚持了两年,现在整理出来共享给大家。

第一期(2018年秋季)

第二期(2019年全年)

目前仅提供第一期13个教程数据代码打包

全部代码和数据,存放在微云供下载,内容截图如下:
 
需要注意的是,学徒早就出师了我还委托她整理,所以这个代码是需要付费的。第二期由不同学徒完成,代码数据我还得组织大家重新整理,敬请期待哈!

文末友情宣传

强烈建议你推荐给身边的博士后以及年轻生物学PI,多一点数据认知,让他们的科研上一个台阶:
付费内容分割线
为有效杜绝黑粉跟我扯皮,设置一个付费分割线,这样它们就没办法复制粘贴我的代码,也不可能给我留言骂街了!(付费6元,拿到测试数据和代码
世界顿时清净很多!

综合脚本

链接在:链接:https://share.weiyun.com/5O0FuTW
这个微云链接需要密码才能访问哈,付费6元可以得到:

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