TCGA数据库里面你的基因生存分析不显著那就TMA吧

最近看到文献里面提到了针对膀胱癌的METTL3基因的生存分析，我定睛细看，发现并不是TCGA里面的表达数据，而是IHC的结果，如下：

f. Kaplan-Meier survival curves of overall survival in 180 bladder cancer patients based on METTL3 expression analyzed by IHC staining. The log-rank test was used to compare differences between two groups (P = 0.0128)

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结果是相当的显著哦，所以我就思考，为什么作者要舍近求远呢，明明是tcga数据库里面大把的公共数据，很容易检验自己感兴趣的基因是否具有生存效应。

所以我就帮助作者在网址：http://gepia2.cancer-pku.cn/#survival 看了看膀胱癌的METTL3基因的生存分析，同样的UCSC的xena浏览器也是可以做到，感兴趣的可以去学习：GEPIA2详解（中国智造-肿瘤数据库），当然了，也可以自行编程探索。需求最大的是tcga数据库的生存分析和表达量差异，看看这两个视频：

• https://www.bilibili.com/video/av25643438?p=9

• https://www.bilibili.com/video/av49363776?p=6

如下，有意思的就来了：

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其实更有意思的是，你还可以使用km-plot网页工具来看膀胱癌的METTL3基因的生存分析，虽然我是不相信km-plot网页工具结果的。我们已经多次介绍过生存分析:

是不是可以合理的推测，因为作者发现自己感兴趣的基因，也就是METTL3在TCGA数据库的膀胱癌里面并没有统计学显著的生存意义，所以就想方设法的去购买TMA，看看IHC结果的针对膀胱癌的METTL3基因的生存分析。  

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