肿瘤基因测序数据分析视频课程终于上架B站啦

不知道还有多少人记得上半年的活动：0元，10小时教学视频直播《跟着百度李彦宏学习肿瘤基因组测序数据分析》，可能是因为免费所以大家都不珍惜吧，实际上参加这个活动的人数还不到200 ，连一个微信群都装不满！！！

因为没有人跟我讨论，课程做的很没有意思，其实这个文章绝大部分篇幅都是生物信息学数据分析结果：包括mutation signature，病人的TMB and MSI 状态，SNVs和CNVs的突变全景图，非编码区域的突变意义，癌症相关通路的突变情况以及突变基因的靶向药情况讨论。我本来是计划出一个10小时教学视频，从肿瘤基因组测序开始到文章的那个接近600M的maf.csv文件，从508个病人的肿瘤SNVs信息到文献的5个主图，以及部分附图的代码实践过程！

但是计划赶不上变化，有一群不法分子拿我的视频去恶意贩卖，太打击我的知识创造和分享的积极性了。干脆把这个未完成版本视频丢在B站吧：

B站学习链接

官方链接是：https://www.bilibili.com/video/BV1Sy4y1S7pz/

 

目录如下：

• 01-文献解读_上
• 02-文献解读_下
• 03-多组学队列研究策略介绍
• 04-多位点取样研究策略介绍
• 05-认识肿瘤基因测序数据分析流程
• 06-认识maf格式的肿瘤somatic突变数据
• 07-基因突变的棒棒糖图
• 08-使用R包SomaticSignatures推断denovo的signature
• 09-使用deconstructSigs进行cosmic的30个signature推断
• 10-依据signature比例使用NMF对病人进行分组
• 11-两个signature体系的比较

不到3个小时啦，相信你马上就可以学习完毕。另外，大家可以去比较不同的肿瘤somatic突变的signature 看看这个留言。

交流模式我们变化一下

这次我不想组建群聊了，虽然前面绝大部分的NGS组学视频，都已经组建了**微信交流群， 有下面这些：

这次我们使用钉钉群：

“跟着百度李彦宏学习肿瘤基因测序数据分析”群的钉钉群号：33122139 ，可以自己去钉钉软件里面搜索这个钉钉群号：33122139 直接进，或者扫描下面的二维码！

 

钉钉群默认是禁言的哈，我们会在一些特殊的答疑时间段开放交流，代码以及数据都在思维导图哦，有任何课程反馈或者笔记，都可以发邮件给我，我的邮箱地址是 [e-mail]

课程思维导图：https://mubu.com/doc/2Whkn5HVCGv

配套资料

当然是建议大家阅读原文：2020年5月12日，《细胞研究》（Cell Research）杂志在线刊载的一篇题为“Whole-genome sequencing of 508 patients identifies key molecular features associated with poor prognosis in esophageal squamous cell carcinoma”的文章中，署名单位为“Baidu”的作者“Yanhong Li”（李彦宏）为该文章的三位通讯作者之一。论文末尾还特别致谢李彦宏（百度）对该研究的慷慨支持。

以及看完我给这个课程配套的阅读材料啦：课程思维导图：https://mubu.com/doc/2Whkn5HVCGv （文末阅读原文即可直达这个思维导图，你应该是会感兴趣，而且我会持续更新哦！）

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