为什么一个单细胞亚群既有T细胞也有B细胞的标记基因呢

小伙伴们跟着我们的单细胞数据分析流程，基本上都掌握了： 单细胞聚类分群注释 ，尤其是我们重点演示了的第一层次的分群。b站免费视频课程 地址：https://www.bilibili.com/video/BV19Q4y1R7cu

很多小伙伴在实践我们的教程的时候，会注意到一个很有意思的现象，就是某个单细胞亚群既有T细胞也有B细胞的标记基因，如下所示，其实很简单：

某个单细胞亚群既有T细胞也有B细胞的标记基因

可以看到， 这个cycling 亚群就是 既有T细胞也有B细胞的标记基因，实际上是因为它们这群细胞高表达 TOP2A和MKI67基因，处于比较活跃的细胞增殖状态，这样无论它本身是 T细胞还是B细胞，它们的这个状态使得它们在普通的降维聚类分群的流程里面就会被混合在一起。

一般来说，这样的细胞亚群，我们直接命名为一个个cycling 亚群即可，在今年（2021）年初的文章《A single-cell map of intratumoral changes during anti-PD1 treatment of patients with breast cancer》，也提到了这样的现象：

 

这个文章的研究者们的解决方案是单独拿出来这个 cycling 亚群 进行继续细分，所以就有了如下所示：

. d, UMAP depicting the T-cell phenotypes detected in the proliferative T-cell subcluster.

 

如果你对单细胞数据分析还没有基础认知，可以看基础10讲：